Как отключить сигнализацию кгб
В этой статье автоэлектрик Алексей Молотов отвечает на вопрос «Как отключить сигнализацию кгб?».
В случае поломки или потери передатчика, а также при прочих обстоятельствах, не позволяющих разблокировать охранную систему штатным образом, возникает необходимость аварийного отключения автосигнализаии.
Разблокировать автомобиль, в котором установлена сигнализация КГБ, можно только при полном соблюдении последовательности действий, зависящих от конкретной модели охранной системы.
Аварийное отключение KGB VS-130
Если охранная система не реагирует на брелок, то разблокировать сигнализацию возможно, если следовать нижеприведенной инструкции.
Снятие с охраны KGB VS 300
Способ отключения охраны на машине, оборудованной сигнализацией KGB VS 300, если сломался брелок зависит от того, был ли заранее запрограммирован персональный код. Аварийное снятие с охраны производится таким образом:
- Открыть водительскую дверь автомобиля.
- Не обращая внимание на активацию режима тревоги, включить зажигание.
- При отсутствии заранее запрограммированного персонального кода нажать единожды Valet. Это действие полностью деактивирует охранную систему. При наличии персонального кода светодиодный индикатор начнет неинтенсивно мигать. Он произведет по 10 мигов трижды через небольшую паузу. Зажигание необходимо выключить, отсчитав количество миганий, соответствующее цифре персонального кода.
В целях безопасности при введении неправильного кода охранная система на некоторое время нет реагирует на любые попытки аварийного отключения без брелка.
Тоже самое произойдет и в случае отсутствия действий со стороны водителя при трех сериях миганий светодиодного индикатора.
Деактивация KGB VS-4000
Как и у предыдущей охранной системы аварийное отключение KGB VS-4000 возможно как с применением персонального кода, так и без него. Для повышения противоугонных свойств автосигнализации рекомендуется запрограммировать пин-код.
В случае если брелок не открывает двери необходимо выполнить следующие действия по деактивации охранной системы:В случае введения пин-кода дается две попытки. При их неудачных попытках охранная система на время перестает реагировать на попытки ее деактивировать.
Аварийное снятие с охраны KGB FX 7
При отсутствии персонального кода аварийное снятие с охраны автосигнализации kgb fx 7 производится в следующей последовательности:
При наличие персонального кода необходимо разблокировать охрану аналогично KGB VS-4000. Единственным отличием FX 7 является возможность использования не двухзначного, а трехзначного пин-кода.
В случае поломки или потери передатчика, а также при прочих обстоятельствах, не позволяющих разблокировать охранную систему штатным образом, возникает необходимость аварийного отключения автосигнализаии.
Аварийное отключение KGB VS-130
- 1 Аварийное отключение KGB VS-130
- 2 Снятие с охраны KGB VS 300
- 3 Деактивация KGB VS-4000
- 4 Аварийное снятие с охраны KGB FX 7
Если охранная система не реагирует на брелок, то разблокировать сигнализацию возможно, если следовать нижеприведенной инструкции.
Снятие с охраны KGB VS 300
Способ отключения охраны на машине, оборудованной сигнализацией KGB VS 300, если сломался брелок зависит от того, был ли заранее запрограммирован персональный код. Аварийное снятие с охраны производится таким образом:
- Открыть водительскую дверь автомобиля.
- Не обращая внимание на активацию режима тревоги, включить зажигание.
- При отсутствии заранее запрограммированного персонального кода нажать единожды Valet. Это действие полностью деактивирует охранную систему. При наличии персонального кода светодиодный индикатор начнет неинтенсивно мигать. Он произведет по 10 мигов трижды через небольшую паузу. Зажигание необходимо выключить, отсчитав количество миганий, соответствующее цифре персонального кода.
В целях безопасности при введении неправильного кода охранная система на некоторое время нет реагирует на любые попытки аварийного отключения без брелка.
Тоже самое произойдет и в случае отсутствия действий со стороны водителя при трех сериях миганий светодиодного индикатора.
Деактивация KGB VS-4000
Как и у предыдущей охранной системы аварийное отключение KGB VS-4000 возможно как с применением персонального кода, так и без него. Для повышения противоугонных свойств автосигнализации рекомендуется запрограммировать пин-код. В случае если брелок не открывает двери необходимо выполнить следующие действия по деактивации охранной системы:
В случае введения пин-кода дается две попытки. При их неудачных попытках охранная система на время перестает реагировать на попытки ее деактивировать.
Аварийное снятие с охраны KGB FX 7
При отсутствии персонального кода аварийное снятие с охраны автосигнализации kgb fx 7 производится в следующей последовательности:
При наличие персонального кода необходимо разблокировать охрану аналогично KGB VS-4000. Единственным отличием FX 7 является возможность использования не двухзначного, а трехзначного пин-кода.
Страница 35
Выключение режима охраны
Двухшаговое выключение блокировок двигателя
Экстренное выключение охраны без набора персонального кода
Для использования данного режима его следует заранее запрограммировать
(функция 11, таблица 1).
Выключите режим охраны (одним из способов).
Второй этап выключения блокировок двигателя выполняется аналогично
экстренному выключению режимы охраны без брелка либо с вводом
персонального кода, либо без него (см. ниже).
Способ выключения охраны без брелка (с вводом кода или без ввода) определяется
программируемой функцией 9, таблица 1.
Откройте дверь автомобиля ключом.
• начнуться сигналы тревоги
или габариты вспыхнут 4 раза
(если режим охраны включался без брелка)
В течение 20 секунд включите зажигание и нажмите сервисную кнопку
[Страница 26/39] — Руководство: Автосигнализация KGB FX-3 VER.2
© Saturn Marketing Ltd.
26
ПРОГРАММИРОВАНИЕ ФУНКЦИЙ И ПАРАМЕТРОВ РАБОТЫ
ПРОГРАММИРОВАНИЕ ФУНКЦИЙ СИСТЕМЫ
Некоторые функции и параметры работы сигнализации могут быть изменены с помощью сервисной
кнопки и брелока без необходимости доступа к центральному блоку. Перечень функций приведен в таб-
лице ниже.
Порядок программирования следующий:
1. Включите зажигание.
2. Нажмите сервисную кнопку 6 раз.
3. Выключите зажигание. Последуют 6 вспышек светодиода и 6 сигналов сирены, индицирующих вход в
режим программирования.
4. Нажмите сервисную кнопку необходимое число раз, равное номеру выбранной функции. Каждое на-
жатие сервисной кнопки будет сопровождаться загоранием светодиодного индикатора и короткими
длинными звуковыми сигналами.
5. В течение 10 секунд нажмите кнопку
I
или
II
брелока коротко (0,5 сек) или длительно (3 сек), в зави-
симости от желаемого состояния выбранной функции. В подтверждение последует 1, 2, 3 или 4 ко-
ротких звуковых сигнала сирены и брелока, в зависимости от установленного значения функции.
6. Для перехода к следующей функции нажмите сервисную кнопку, а затем нажатием кнопки брелока
установите нужное значение функции. Повторите эту процедуру для всех функций, требующих изме-
нений.
7. Для выхода из режима программирования включите зажигание или дождитесь автоматического вы-
хода системы. В подтверждение последуют 5 вспышек габаритов.
Существует возможность сброса значений всех программируемых функций на заводские установки.
Для этого необходимо:
1. Включить зажигание и нажать сервисную кнопку 10 раз.
2. Выключить зажигание. Прозвучат 10 сигналов сирены, индицирующих вход в режим сброса на заво-
дские установки.
3. Нажать сервисную кнопку 1 раз. Последует 1 сигнал сирены.
4. Нажать кнопку
I
брелока. Последует 1 короткий звуковой сигнал брелока, подтверждающий сброс на
заводские установки.
5. Для выхода из режима сброса включите зажигание или дождитесь автоматического выхода системы.
В подтверждение последуют 5 вспышек габаритов и мелодичный сигнал брелока.
Как включить звук на сигнализации кгб
Автосигнализация KGB модели FX-7 – современное охранное устройство, позволяющее программно включать и настраивать большое число опций.
Эту систему могут устанавливать даже на новые авто, и тогда монтаж проводится в дилерском центре. При эксплуатации системы на первых порах у владельцев возникают вопросы, и касаются они в основном автозапуска. Сигналку или сам автомобиль повредить неправильными действиями нельзя, но потерять возможность пользоваться автозапуском – можно.«Механика» или «автомат»?
Допустим, сигнализация была установлена на автомобиль с механической коробкой. Тогда на дисплее должна постоянно гореть надпись «Manual». Если это не выполнено, не используйте автозапуск ни при каких условиях.
Пусть монтаж был проведен без ошибок и надпись на дисплее присутствует. Тогда в ходе эксплуатации нужно будет выполнять подготовку:
- Оставляя авто на стоянке, задействуют ручной тормоз.
- Изымают ключ, но мотор работает. Если этого не происходит, добавьте в последовательность новое действие: перед «шагом 2» нажимают и отпускают клавишу 2.
- После изъятия ключа или после нажатия на кнопку, если оно выполнялось, за 30 секунд нужно покинуть салон и закрыть двери.
- Можно включить режим охраны, нажав кнопку 1.
Проводите указанную последовательность, чтобы мотор можно было завести автозапуском.
Итак, повторим, как нужно поступать в разных случаях:
- Если монтаж был выполнен на авто с АКП, надпись должна отсутствовать, а подготовку проводить не требуется;
- Для машин с МКП возможны два варианта: надпись есть – подготовку проводят, надписи нет – автозапуском не пользуются.
В ходе выполнения процедуры подготовки на дисплее появляется значок «дым». Его появление означает то, что поддержка зажигания включилась. Повторим, что для машин с АКП эти сведения не актуальны: поддерживать зажигание не нужно, так как «подготовка» не проводится в принципе.
Есть отзывы, где владельцы говорят, что после нажатия кнопки 2 значок «дым» не появляется, а вместо этого следуют сигнал и моргание «габаритами». Значит, поддержка зажигания будет включаться при изъятии ключа – так в данном случае были сделаны настройки (параметр 12).
Как управлять автозапуском
Дистанционный запуск двигателя выполняется так: длительно жмут клавишу 1, затем кнопку 3 нажимают коротко. Длительное нажатие – это удерживание кнопки до мелодичного сигнала (1-2 секунды). Все же, перед тем как выполнять дистанционный запуск, рекомендуется провести обязательную проверку:
- Мотор должен быть заведен. В этом случае по нажатию кнопки 3 дисплей отображает значок «дым».
- Если двигатель заглушен, нажатие кнопки 3 не приводит к появлению пиктограммы дыма.
Проверку выполняют один раз, чтобы убедиться в правильности монтажа.
Если мотор уже работает
Заглушить двигатель будет просто: клавишу 2 нажимают длительно, а кнопку 3 затем – коротко. Мотор можно и не глушить, а просто отключить охрану (клавиша 2) и в течение 30 секунд включить зажигание. Затем нужно обязательно снять авто с ручника или нажать педаль тормоза. Первое действие подходит для машин с МКП.
Здесь рассматривались действия, выполняемые после старта двигателя автозапуском. В штатной инструкции все шаги будут перечислены тоже.
Автозапуск по температуре и таймеру
Можно настроить запуск, срабатывающий при выполнении одного из условий: температура понизилась, прошло заданное время и т.д. Все опции доступны в курсорном режиме:
- Клавишу 3 удерживают, пока не последует мелодичный и короткий сигнал;
- Начинает мигать курсор – эту функцию в ходе эксплуатации используют часто;
- Чтобы включить запуск по таймеру, курсор сдвигают к значку Fixed Start и нажимают клавишу 1;
- Значок Temp Start соответствует запуску по температуре – выберите опцию и задействуйте ее кнопкой 1;
- Можно настроить и разовый запуск, выполняемый в заданное время: опции соответствует символ Clock Start.
Перемещать курсор нужно нажатиями кнопки 3. А выключить любую из опций можно так: включают курсор, выбирают значок, коротко жмут на клавишу 2. Ничего сложного.
В инструкции сказано, что перед тем, как задействовать опцию Clock Start, всегда выполняют два действия: устанавливают время срабатывания и проверяют, правильно ли были настроены часы. Обе функции рассматриваются дальше.
Настройка часов и времени автозапуска
Взяв брелок, нажмите и удерживайте кнопку 3. Последуют звуковые сигналы: мелодичный, короткий, два коротких. Кнопку отпускают, а затем выставляют показания часов:
- Увеличивают или уменьшают значение нажатием кнопки 1 или 2;
- Переключиться между часами и минутами можно нажатием третьей клавиши;
- Можно будет подождать или нажать кнопку 3 длительно – значение сохранится.
Будильник настраивают похожим способом, но до шага 1, когда индикатор начнет мигать, нужно будет дважды нажать клавишу 3. А шаг 3 должен выглядеть по-другому: кнопку 3 нажимают коротко. Затем первой клавишей включают звук зуммера либо клавишей 2 его отключают.
Когда будильник уже настроен, можно будет задействовать символ Clock Start (разовый запуск).
Сам брелок допустимо настраивать вне зоны действия сигналки, о чем говорят почти все отзывы. Затем, чтобы включить ту или иную опцию, брелок располагают уже в области действия системы. Но для срабатывания запуска, в том числе по будильнику, подносить пульт к автомобилю будет не обязательно. В штатной инструкции сказано это же.
Программирование
Опции, связанные с автозапуском, настраиваются программно. Они собраны в таблице, которую приводят в инструкции:
Чтобы получить доступ к настройкам, выполняют действия:
- Зажигание отключают;
- Кнопку Valet нажимают 6 раз, затем включают зажигание;
- Следуют 6 сигналов;
- Нажатиями на кнопку Valet выбирают номер опции.
Взяв брелок и нажимая на клавишу, задают новое значение.
Для выбора цифры 4 поступают так: кнопку 1 жмут длительно и коротко.
Не нужны отзывы, чтобы понять следующее:
- Значение функции 11 менять не рекомендуется;
- Для функции 9 запрет будет более сильным;
- Опции 12 присваивают значение 2 или 3, чтобы устранить проблемы, возникающие при срабатывании поддержки зажигания.
Вообще сигналка КГБ рассматриваемой модели – доработанная копия «Старлайна B9». Претензий к указанным системам нет, за исключением медлительности брелока. Впрочем, эффект проявляется только в ходе настройки. Выбор оставим за пользователем.
«FX-7» и дальность связи
Страница 14
KGB FX-5 «Инструкция по эксплуатации и установке системы»
© Saturn Marketing Ltd.
ВКЛЮЧЕНИЕ РЕЖИМА ОХРАНЫ СО ЗВУКОВЫМИ СИГНАЛАМИ
Перед включением режима охраны убедитесь, что зажигание выключено, двери, капот и багажник на-
дежно закрыты, стояночный тормоз включен. Для включения режима охраны нажмите и отпустите кноп-
ку
должна быть запрограммирована для включения / выключения режима охраны)
1 звуковой сигнал и 1 вспышка габаритов подтвердят включение режима охраны. Автоматическое запи-
рание замков дверей произойдет, если они подключены к сигнализации. Светодиодный индикатор нач-
нет мигать, показывая, что автомобиль охраняется.
На дисплее брелока отобразятся иконки
, последует короткий звуковой сигнал.
Внимание! Если двери, капот или багажник окажутся плохо закрытыми, или неисправен один из кно-
почных выключателей дверей, капота или багажника или не включен стояночный тормоз, то сигнали-
зация предупредит об этом 4 звуковыми сигналами и 4 вспышками габаритов. Смотри пункт «Самоди-
агностика при включении режима охраны».
ВКЛЮЧЕНИЕ РЕЖИМА БЕСШУМНОЙ ОХРАНЫ
Перед включением режима охраны убедитесь, что зажигание выключено, двери, капот, багажник на-
дежно закрыты, стояночный тормоз включен. Для включения режима бесшумной охраны установите
курсор на иконку
и нажмите кнопку
1 вспышка габаритов подтвердит включение режима охраны. Автоматическое запирание замков дверей
произойдет, если они подключены к сигнализации. Светодиодный индикатор начнет мигать, показывая,
что автомобиль охраняется.
На дисплее брелока отобразятся иконки
, последует короткий звуковой сигнал.
Внимание! Если двери, капот или багажник окажутся плохо закрытыми, или неисправен один из кно-
почных выключателей дверей, капота, багажника или не включен стояночный тормоз, то сигнали-
зация предупредит об этом 4 звуковыми сигналами брелока и 4 вспышками габаритов. Смотри
пункт «Самодиагностика при включении режима охраны».
ВКЛЮЧЕНИЕ РЕЖИМА ОХРАНЫ ПРИ РАБОТАЮЩЕМ ДВИГАТЕЛЕ
В сигнализации предусмотрена возможность включения режима охраны при работающем двигателе.
Это может быть необходимо при кратковременной остановке. Максимальное время, в течение которого
двигатель будет работать, определяется запрограммированной функцией №1.
Режим охраны включается в следующем порядке:
1. При работающем двигателе включите стояночный тормоз.
2. При работающем двигателе нажмите и удерживайте кнопку
брелока до появления 3 вспышек габа-
ритов или мелодичного сигнала брелока. На дисплее брелока отобразится иконка
мя работы двигателя. Светодиодный индикатор загорится постоянно.
3. Выключите зажигание и выньте ключ из замка зажигания. Двигатель будет продолжать работать.
4. В течение 30 секунд покиньте автомобиль, закройте все двери, капот, багажник и нажмите кнопку
брелока. 1 сигнал сирены и 1 вспышка габаритов подтвердят включение режима охраны при работаю-
щем двигателе. Зоны зажигания и датчика удара будут исключены из охраны. Автоматическое запира-
ние замков дверей произойдет, если они подключены к сигнализации.
Брелок подаст 1 короткий звуковой сигнал. На дисплее отобразятся иконки
После автоматической остановки двигателя режим охраны останется включенным. Зоны зажигания и
датчика удара будут взяты под охрану. Светодиодный индикатор начнет мигать.
Охранный комплекс сегодня не только обеспечивает защиту машины от угона, но и повышает комфортность пользователя дополнительными функциями: доводчиками стеклоподъемников, автозапуском, геолокацией.
Хорошим выбором может стать надежная и несложная «сигналка» KGB TFX-5, в ее инструкции можно найти полную информацию об установке системы, настройке и дальнейшей эксплуатации.
Технические характеристики
Температурные режимы нормальной работы: для пейджера — 0… +400°С, сирены — -30… 850°С, самой системы — -40… +850 С.
- Сигнализация работает не больше чем с 4 приемопередатчиками.
- С помощью системы можно организовать 6 зон охраны.
- Рабочие токи в активном режиме минимальны — до 25 мА.
- Напряжение питания — 12 В, от бортовой сети.
- 1200 м — радиус работы приемника на открытой местности.
- 600 м — дальность двухсторонней связи брелока и машины.
- Сигнализация КГБ TFX 5 с автозапуском работает на частоте 433,5 МГц.
Комплектация
Элементная база комплекса включает:
- центральный блок;
- брелоки-передатчики: с ЖК-дисплеем и обратной связью с 3 кнопками и дополнительный с 4;
- для измерения температуры в салоне служит специальный датчик, встроенный в блок антенны вместе с кнопкой вызова водителя;
- датчик удара двухуровневый;
- индикатор светодиодный;
- сирена;
- Valet — сервисная кнопка автосигнализации KGB;
- клавиша «Антиограбления»;
- выключатели концевые;
- комплект проводов с разъемами;
- батарейки, наклейки;
- инструкция, памятка, талон гарантии.
Функции
Охранный комплекс выполняет следующие функции защиты:
- На ЖК-дисплей брелока приходит оповещение о срабатывании системы.
- В режиме охраны при срабатывании датчиков включаются сигналы тревоги в форме звука и света.
- Режимы «Паника» и «Антиограбление» включаются дистанционно, а последний еще и кнопкой.
- Имеется способность иммобилайзера.
- Блокировка ДВС сохраняется даже при удалении сигнализации.
К сервисным возможностям сигнализации KGB FX-5 можно отнести:
- охрану без шума и с работающим мотором;
- включение защиты без брелока и звука;
- способность встать на охрану пассивно и повторно;
- разные варианты отпирания дверей;
- наличие будильника, таймера, термометра;
- режим поиска.
Кроме того, с использованием системы у владельца авто появляется возможность заводить и греть мотор на расстоянии, программировать FX-5 так, чтобы запуск производился в нужное время или при запрограммированной температуре воздуха, учитывая особенности типа двигателя (бензин или дизель), вид трансмиссии.
Преимущества и недостатки
По отзывам установщиков и пользователей, FX-5 обладает достоинствами:
- Небольшая стоимость при хорошем соотношении цена-качество.
- Процесс установки и настройки доступно описан в мануале.
- Расширенный функционал.
- Мощная сирена, входящая в комплект.
- Уверенная и надежная работа дистанционного запуска ДВС.
Недостатки, присущие комплексу:
- Большое количество ложных срабатываний при ошибках в установке и настройке.
- Брак в брелоке, встречающийся относительно часто и вынуждающий пользователя повторно нажимать кнопки.
- При неправильной настройке датчика удара его чувствительность позволяет злоумышленнику снять, например, дворники.
Инструкция по установке
В комплект поставки входит инструкция по установке ФХ-5. Перед монтажом оборудования нужно отключить аккумулятор автомобиля.
Порядок установки системы:
- Определяют место расположения центрального блока. Крепят его с помощью саморезов к машине.
- Ставят сирену под капот в место, которое не нагревается, направив ее вниз рупором.
- Кнопку Valet лучше расположить в скрытой для злоумышленника, но доступной для владельца авто точке салона.
- Монтируют кнопку «Антиограбление».
- Приемопередатчик размещают на лобовом стекле с помощью скотча или наклейки. Закрепляют антенну, светодиодный индикатор.
- В систему охлаждения врезают датчик температуры охлаждающей жидкости.
- «Концевики» ставят на капот, багажник и в двери в разъемы, имеющиеся в машине.
- В центральной части кузова располагают датчик удара. Крепят саморезами и потом настраивают.
В KGB FX-5 инструкция к сигнализации содержит нужные схемы подключения элементов:
- основного блока;
- 6- и 18-контактных разъемов;
- электроприводов замков.
Инструкция по эксплуатации
Инструкция по применению охранного комплекса содержит рекомендации по программированию и настройке:
- кнопок и кодов брелока;
- режимов защиты и энергосбережения;
- турботаймера и антиограбления.
Руководство предлагает программировать систему с помощью кнопки Valet. Для входа в режим нужно:
- При включенном зажигании нажать на сервисную кнопку 6 раз, затем зажигание выключить.
- Подтверждением правильности действий будет 6 звуковых сигналов и светодиодный индикатор моргнет 6 раз.
- Выбрать по таблице нужную для программирования функцию.
- Клавишей брелока выставить требуемое значение.
Режим энергосбережения устанавливается и снимается следующим образом:
- Нажать и удерживать до двух мелодичных сигналов кнопку со значком в форме солнца на брелоке.
- Перевести индикатор на иконку с надписью Save и изображением аккумулятора.
- Первой кнопкой активировать сберегающий режим (второй деактивировать).
- Удержание значка солнца до звукового сигнала — выход из программирования.
Включить защиту при работающем двигателе можно так:
- При заведенном моторе включить «ручник».
- Нажать и удерживать 1 кнопку пейджера, пока пульт не издаст мелодичный звук и габариты не моргнут 3 раза. При этом диод индикаторный будет гореть непрерывно, на дисплее отобразится работающая машина.
- При выключении зажигания и вытаскивании ключа двигатель должен работать.
- За 30 секунд нужно выйти из автомобиля, закрыть двери и нажать на брелоке кнопку 1.
Значки и кнопки на брелке
Инструкция по эксплуатации содержит подробное описание назначения индикаторов на ЖК-дисплее и кнопок брелока.
Основной брелок имеет следующие индикаторы:
- открытие или закрытие замков дверей, капота и багажника;
- выключение ручного тормоза;
- удар по кузову;
- охрана со звуком и без;
- режим Валет;
- мотор работает;
- работа 2 допканала;
- автостарт по температуре воздуха;
- состояние батареи;
- наличие связи;
- включение зажигания;
- 1 или 2 половина дня;
- ежедневный запуск по времени;
- температура и время;
- таймер и др.
Назначение кнопок брелока:
- 1 кнопка — остановка и старт двигателя удаленно при удержании более 3 секунд или выполнение запрограммированной команды;
- 2 — кнопка при 3-секундном надавливании открывает дверь багажника, а также реализует функцию, соответствующую положению курсора на ЖК-дисплее при кратковременном нажатии;
- поиск активируется при одновременном коротком нажатии на клавиши 1, 2, а если удерживать обе кнопки 3 секунды, то включится режим «Паника»;
- выбор оповещения откроется при нажатии сразу кнопок 1 и 3;
- таймер можно установить, нажав 2 и 3;
- кнопка 3 при кратком клике осуществляет движение курсора по иконкам, при трехсекундном удержании можно посмотреть и выставить будильник, таймер, часы, энергосбережение, а подождав 6 секунд, становится возможным задать команду кнопке № 1.
Как включить автозапуск
Чтобы настроить и запустить ДВС дистанционно или воспользоваться функцией автоматического запуска в ТФХ-5 по температуре, нужно:
- В авто с механической коробкой включить нейтральную передачу и паркинг при АКПП.
- Поставить машину на «ручник».
- Расположить автомобиль в проветриваемом месте.
После этого, если перевести курсор 3 кнопкой брелока на иконку Start и подтвердить нажатием кнопки 2, то мигнут габариты, сработает сирена и прозвучит мелодия брелока. Все это означает, что теперь включен режим ежедневного автозапуска.
Чтобы подготовить машину с МКПП к удаленному пуску мотора, потребуется предварительная подготовка:
- при работающем моторе включить нейтральную передачу и ручной тормоз;
- выключить зажигание, вынуть ключ при запущенном двигателе;
- за 30 секунд выйти из машины, закрыть двери, включить «сигналку».
Программированием комплекса можно задать время прогрева, температуру автозапуска, время 1 прокрутки.
Сигнальный путь JNK Caenorhabditis elegans активирует экспрессию генов стресс-ответа путем подавления репрессорного комплекса Fos / HDAC
Образец цитирования: Hattori A, Mizuno T, Akamatsu M, Hisamoto N, Matsumoto K (2013) Сигнальный путь активирует экспрессию генов стресс-ответа путем подавления репрессорного комплекса Fos / HDAC. PLoS Genet 9 (2): e1003315. https://doi.org/10.1371/journal.pgen.1003315
Редактор: Даниэль А.Гарсин, Научный центр здоровья Техасского университета в Хьюстоне, Соединенные Штаты Америки
Поступила: 30.08.2012; Принята к печати: 20 декабря 2012 г .; Опубликовано: 21 февраля 2013 г.
Авторские права: © 2013 Hattori et al. Это статья в открытом доступе, распространяемая в соответствии с условиями лицензии Creative Commons Attribution License, которая разрешает неограниченное использование, распространение и воспроизведение на любом носителе при условии указания автора и источника.
Финансирование: Эта работа была поддержана программами субсидий для научных исследований в Японии (TM, NH и KM), Научным фондом Такеда (TM и NH) и Мемориальным фондом Уэхара (NH). . AH был поддержан исследовательским сообществом JSPS. Финансирующие организации не играли никакой роли в дизайне исследования, сборе и анализе данных, принятии решения о публикации или подготовке рукописи.
Конкурирующие интересы: Авторы заявили, что никаких конкурирующих интересов не существует.
Введение
Пути передачи сигналов митоген-активируемой протеинкиназы (MAPK) эволюционно консервативны в эукариотических клетках и передают сигналы в ответ на различные внеклеточные стимулы. Каждый путь состоит из трех классов протеинкиназ: MAPK, MAPK-киназа (MAPKK) и MAPK-киназа-киназа (MAPKKK) [1], [2]. MAPKKK фосфорилирует и активирует MAPKK, который, в свою очередь, активирует MAPK. Этот каскад активации может быть обращен фосфатазами. В частности, члены семейства MAPK-фосфатаз (MKP) могут удалять фосфатные группы из активированного MAPK [1], [2].Были идентифицированы три подгруппы MAPK: киназа, регулируемая внеклеточными сигналами (ERK), N-терминальная киназа c-Jun (JNK) и киназы p38 [1], [2]. JNK и p38 MAPK действуют как ключевые медиаторы стресса и передачи иммунных сигналов у млекопитающих. Было показано, что MKK4 и MKK7 MAPKK активируют JNK, а MKK3 и MKK6 MAPKK служат основными активаторами p38 MAPK. Специфические MAPKK сами фосфорилируются и активируются специфическими MAPKKK. Различные MKP проявляют разную активность в отношении ERK, JNK и p38.
Модельные организмы беспозвоночных, такие как Drosophila melanogaster и Caenorhabditis elegans , полезны для понимания эффектов и взаимодействий белков JNK, особенно потому, что они поддаются анализу экспрессии цитопротекторных генов и конкретного вклада различных тканей [3], [4]. Недавние исследования на C. elegans показали, что компоненты передачи сигналов JNK MAPK высоко консервативны между C. elegans и млекопитающими.Одним из таких путей C. elegans JNK является путь KGB-1, состоящий из MAPKKK MLK-1 типа MLK, MAPKK MEK-1 типа MKK7 и MAPK KGB-1 типа JNK [5]. Путь KGB-1 необходим для защиты от тяжелых металлов и стресса сворачивания белков [5], [6], [7] и регулирует транскрипционные ответы на бактериальные порообразующие токсины [8]. Другим компонентом этого пути является MKP VHP-1, который негативно регулирует путь KGB-1 путем дефосфорилирования KGB-1 [5]. Однако компоненты, которые функционируют ниже по ходу пути KGB-1, еще предстоит выяснить.
Различные мишени фосфорилирования JNK были идентифицированы в системах млекопитающих, включая членов семейства транскрипционных факторов основной области лейциновой молнии (bZIP), таких как ATF2 и Jun [9], [10]. Комплекс активирующего белка 1 (AP-1) составляет важную подгруппу факторов транскрипции bZIP [9], [10]. Белки-компоненты AP-1 взаимодействуют как гомодимеры или гетеродимеры, связывают ДНК через консервативные домены bZIP и регулируют транскрипцию своих генов-мишеней. Большое количество исследований поддерживает модель, в которой внеклеточные стимулы запускают фосфорилирование AP-1 с помощью JNK, что приводит к перепрограммированию экспрессии целевого гена [11], [12].Учитывая важность динамики хроматина в контроле экспрессии генов, недавняя работа была сосредоточена на факторах, взаимодействующих с AP-1, которые могут опосредовать модификацию и ремоделирование хроматина, особенно на ферментах, которые обратимо модифицируют гистоновые хвосты путем ацетилирования. Таким образом, было обнаружено, что комплекс гистондеацетилазы (HDAC) ингибирует путь JNK [13], [14]. Репрессия гена комплексом HDAC снимается фосфорилированием Jun, которое вызывает его диссоциацию от промотора [15], [16]. Эти находки подтверждают, что динамика хроматина может играть центральную роль в клеточном ответе на передачу сигналов JNK.
Чтобы понять роль передачи сигналов KGB-1 в стрессовой реакции тяжелых металлов, мы провели скрининг белков, которые могут взаимодействовать с KGB-1, и идентифицировали FOS-1, гомолог Fos C. elegans , и показали, что он действует ниже по течению. КГБ-1. Кроме того, мы идентифицировали два гена, экспрессия которых индуцируется медью KGB-1-зависимым образом: kreg-1 и kreg-2 ( KGB-1 регулируемых генов ). Мы обнаружили, что FOS-1 подавляет транскрипцию за счет рекрутирования гистондеацетилазы HDA-1 класса I на промотор.Биохимические анализы продемонстрировали, что фосфорилирование KGB-1 ингибирует самоассоциацию FOS-1 и связывание с промотором kreg-1 . Эти результаты предполагают, что FOS-1 и HDA-1 играют ингибирующую роль в ответе на стресс, связанный с тяжелыми металлами, и что путь KGB-1 придает толерантность к тяжелым металлам путем фосфорилирования и тем самым негативно регулирует FOS-1.
Результаты
KGB-1 взаимодействует с FOS-1 и фосфорилирует его.
Чтобы идентифицировать компоненты, которые работают после КГБ-1, мы проверили C.elegans смешанной стадии кДНК библиотеки дрожжевым двугибридным методом для выделения белков, которые взаимодействуют с KGB-1. Обычно киназа-отрицательные (KN) формы протеинкиназ постоянно связываются со своим субстратом. Поэтому в качестве приманки мы использовали KGB-1 (K67R), форму KN, в которой Lys-67 в АТФ-связывающем мотиве мутировал на аргинин. На этом экране мы идентифицировали 10 белков, которые взаимодействуют с KGB-1 (Таблица S1). Одним из них является FOS-1, ортолог фактора транскрипции Fos млекопитающих [10], [17].Поскольку Fos является известным субстратом MAPK во многих системах, мы рассматривали FOS-1 как вероятный субстрат KGB-1. Белок FOS-1 похож на другие белки Fos в том, что он обладает основным ДНК-связывающим доменом, областью лейциновой молнии и карбоксильным концом, богатым остатками серина и треонина, которые являются типичными сайтами фосфорилирования (рис. 1А). Ген fos-1 кодирует две изоформы FOS-1, FOS-1A и FOS-1B [17]. Поскольку FOS-1A ранее был охарактеризован как регулятор инвазии якорных клеток во время развития нематод [17], мы сосредоточили наши исследования на форме FOS-1B (далее называемой FOS-1).Чтобы подтвердить взаимодействие между KGB-1 и FOS-1, мы совместно экспрессировали HA-tagged KGB-1 KN и T7-tagged FOS-1 в клетках COS-7, иммунопреципитировали HA-KGB-1 KN с анти-HA антителами, и зондировали T7-FOS-1 на вестерн-блоте с антителами против T7. Мы обнаружили, что KGB-1 KN коиммунопреципитируется с FOS-1 (рис. 1B), что указывает на то, что KGB-1 может физически связываться с FOS-1.
Рис. 1. FOS-1 фосфорилируется KGB-1.
(A) Схематическое изображение структур c-Fos человека и C.elegans FOS-1 белков. Темные коробки представляют собой основные области и области лейциновой молнии. Показаны шесть мотивов Ser / Thr-Pro. (B) Взаимодействие ФОС-1 с КГБ-1. Клетки COS-7 котрансфицировали векторами экспрессии, кодирующими T7-FOS-1 и HA-KGB-1 (K67R; KN), как указано. Экстракты цельных клеток (WCE) и иммунопреципитированные комплексы, полученные с анти-HA-антителами (IP), анализировали с помощью вестерн-блоттинга (WB). Эксперименты проводились пять раз с аналогичными результатами. (C, D) Фосфорилирование FOS-1 с помощью KGB-1.Клетки COS-7 котрансфицировали векторами экспрессии, кодирующими T7-FOS-1 (дикий тип; WT), T7-FOS-1 (T304A), HA-KGB-1 WT, HA-KGB-1 KN и FLAG- МЕК-1 как указано. Экстракты целых клеток инкубировали либо в отсутствие, либо в присутствии щелочной фосфатазы кишечника теленка (CIAP) перед анализом с помощью вестерн-блоттинга (C). Эксперименты проводились трижды с аналогичными результатами. (E) Димеризация FOS-1 ингибируется KGB-1-опосредованным фосфорилированием. Клетки COS-7 котрансфицировали векторами экспрессии, кодирующими T7-FOS-1 WT, GFP-FLAG-FOS-1 WT, HA-KGB-1 WT, HA-KGB-1 KN и FLAG-MEK-1, как указано .Экстракты цельных клеток и иммунопреципитированные комплексы, полученные с антителами против GFP, анализировали с помощью вестерн-блоттинга (WB). Стрелки указывают положения фосфорилированных GFP-FLAG-FOS-1 и T7-FOS-1. Эксперименты проводились трижды с аналогичными результатами.
https://doi.org/10.1371/journal.pgen.1003315.g001
Физическая связь КГБ-1 с ФОС-1 предполагает, что ФОС-1 может быть целью фосфорилирования КГБ-1. Действительно, в клетках COS-7 совместная экспрессия KGB-1, активированного MEK-1, приводила к появлению более медленно мигрирующих форм белка FOS-1 при анализе с помощью электрофореза в SDS-полиакриламидном геле (SDS-PAGE) (рис. 1C). , переулок 2).Предварительная обработка экстрактов щелочной фосфатазой уменьшала интенсивность сдвигов полос (рис. 1С, дорожка 3), что является типичным индикатором дефосфорилирования. Экспрессия MEK-1 в отсутствие KGB-1 не вызывала какого-либо сдвига подвижности (рисунок S1A).
Белок FOS-1 содержит шесть предполагаемых сайтов фосфорилирования MAPK (S / TP): Ser-151, Thr-263, Thr-278, Thr-304, Thr-316 и Thr-318 (рис. 1A). Мы создали мутантную форму FOS-1, [FOS-1 (6A)], в которой все 6 остатков Ser / Thr были заменены на Ala.Когда мы проанализировали экстракты из клеток COS-7, трансфицированных FOS-1 (6A) вместе с активным KGB-1, мы не наблюдали медленно мигрирующих полос в SDS-PAGE (рисунок S2A, дорожка 12). Для идентификации специфического фосфорилированного остатка (ов) в FOS-1 мы ввели различные комбинации мутаций Ala в шесть остатков Ser / Thr. Мы наблюдали, что тройная мутация T304A, T316A, T318A полностью аннулировала фосфорилирование FOS-1 (рисунок S2B, дорожка 9), предполагая, что Thr-304, Thr-316 и / или Thr-318 являются потенциальными сайтами фосфорилирования.Далее мы создали три мутанта FOS-1, которые индивидуально изменили Thr-304, Thr-316 или Thr-318 на Ala, и обнаружили, что мутация FOS-1 (T304A) демонстрирует пониженное фосфорилирование KGB-1 (рис. 1D, линия 3 и Рисунок S2). Эти результаты предполагают, что Т304 является основным сайтом фосфорилирования. Однако мы также наблюдали небольшую более медленно мигрирующую полосу, указывающую на то, что существует некоторое остаточное фосфорилирование FOS-1 (T304A) и что Thr-316 и / или Thr-318 могут быть минорными сайтами фосфорилирования KGB-1. Чтобы подтвердить, что KGB-1 фосфорилирует FOS-1 по остатку Thr-304, мы создали антитела против фосфо-FOS-1, которые специфически распознают FOS-1, фосфорилированный по Thr-304.Трансфекция активным KGB-1, но не киназонегативным мутантом KGB-1 KN, привела к сильной реактивности FOS-1 с этим антителом (фиг. 1D, дорожки 1, 2). Напротив, мы обнаружили, что мутированная форма FOS-1 (T304A) не может быть обнаружена этим антителом (рис. 1D, дорожка 3), подтверждая, что она специфична для FOS-1, фосфорилированного по Thr-304.
Белки семейства Fos действуют как димеры, которые связывают ДНК и регулируют транскрипцию генов-мишеней [9], [10], [18]. Поэтому мы затем исследовали, подвергается ли FOS-1 гомодимеризации.FOS-1 был слит как с GFP, так и с FLAG и экспрессировался в клетках COS-7 вместе с T7-FOS-1. Мы иммунопреципитировали белок GFP-FLAG-FOS-1 антителами против GFP и тестировали на совместное осаждение T7-FOS-1 путем блоттинга с антителами против T7. Мы различали GFP-FLAG-FOS-1 и T7-FOS-1 на основании их разной молекулярной массы. Действительно, GFP-FLAG-FOS-1 легко коиммунопреципитируется с T7-FOS-1 (рис. 1E, дорожки 1, 2), что указывает на олигомеризацию двух белков, предположительно в виде димеров.Затем мы исследовали, коррелирует ли фосфорилирование KGB-1 со степенью самоассоциации FOS-1. Совместная экспрессия активного, но не неактивного KGB-1 приводила к снижению коиммунопреципитации T7-FOS-1 с GFP-FLAG-FOS-1 (рис. 1E, дорожки 3, 4). Затем мы исследовали состояние фосфорилирования самоассоциации FOS-1 с использованием антител против фосфо-FOS-1 и обнаружили, что фосфорилированная форма T7-FOS-1 не осаждается совместно с GFP-FLAG-FOS-1 (рис. 1E). , дорожка 3). Это указывает на то, что фосфорилирование ингибирует самоассоциацию FOS-1.Мы также создали мутант, предназначенный для имитации фосфорилирования FOS-1, путем замены остатка Thr-304 глутаминовой кислотой с целью изучения его потенциала самоассоциации. Однако при экспрессии в клетках COS-7 FOS-1 (T304E) демонстрировал более быструю миграцию на SDS-PAGE по сравнению с FOS-1 дикого типа (рис. S1B), что позволяет предположить, что структура FOS-1 (T304E) отличается от структуры. фосфорилированного FOS-1. Таким образом, эта мутация, по-видимому, не имитирует фосфорилирование FOS-1.
FOS-1 негативно регулирует стрессовую реакцию, опосредованную сигналом KGB-1.
Поскольку путь KGB-1 MAPK регулирует ответ на стресс тяжелыми металлами [5], [6], [7], мы проверили, регулирует ли FOS-1 также стрессовый ответ на тяжелые металлы.Существующие мутанты с потерей функции fos-1 нельзя было использовать для анализа токсичности тяжелых металлов, поскольку они обладают стерильным фенотипом (данные не показаны). Поэтому мы проверили влияние нокдауна fos-1 на стрессовую реакцию с использованием метода интерференции питающей РНК (РНКи). Животных помещали на чашки с агаром, содержащим ионы меди (Cu 2+ ), кормили штаммом бактерий, экспрессирующим двухцепочечную РНК для fos-1 , и их развитие отслеживали на предмет любых признаков измененной реакции на стресс тяжелыми металлами. .Как показано на рис. 2А, fos-1 РНКи не влияли на чувствительность к ионам Cu 2+ . Животные, обработанные fos-1 РНКи, проявляли фенотип вывернутой / выступающей вульвы у взрослых, как это наблюдалось у мутантов с потерей функции fos-1a [17]. Это указывает на то, что fos-1 RNAi действительно вызвала нокдаун fos-1 . В отличие от отсутствия эффекта у животных дикого типа, fos-1 РНКи подавляла чувствительность к ионам Cu 2+ у мутантов kgb-1 (km21) (Рисунок 2A и Рисунок S3), что позволяет предположить, что FOS -1 отрицательно регулирует толерантность к нагрузкам тяжелых металлов.
Рис. 2. Влияние ингибирования fos-1 на чувствительность к стрессу.
(A) Подавление фенотипа kgb-1 , чувствительного к тяжелым металлам, за счет истощения fos-1 . Каждое животное культивировали из эмбриогенеза на нормальных чашках, содержащих сульфат меди (40 мкМ), и засевали штаммом бактерий, экспрессирующим двухцепочечную РНК для fos-1 . Относительная жизнеспособность показана со стандартными ошибками. Планки погрешностей указывают 95% доверительный интервал. ** P <0.01 по результатам теста Стьюдента t . NS, не имеет значения. (B) Чувствительность к тяжелым металлам, вызванная сверхэкспрессией FOS-1 (T304A). Животных дикого типа, несущих трансген Phsp-16 :: t7 :: fos-1 в качестве внехромосомного массива, культивировали в эмбриогенезе на нормальных чашках, содержащих сульфат меди (100 мкМ). Относительная жизнеспособность показана со стандартными ошибками. ** P <0,01 согласно тесту Стьюдента t . NS, не имеет значения.
https: // doi.org / 10.1371 / journal.pgen.1003315.g002
Приведенные выше результаты повышают вероятность того, что KGB-1-опосредованное фосфорилирование FOS-1 Thr-304 снимает опосредованное FOS-1 ингибирование в ответ на стресс. Чтобы проверить эту возможность, мы экспрессировали FOS-1 дикого типа или нефосфорилируемый мутант FOS-1 (T304A) из промотора теплового шока ( Phsp-16 ) у животных дикого типа. Мы обнаружили, что экспрессия FOS-1 (T304A) привела к чувствительности к иону Cu 2+ по сравнению с экспрессией FOS-1 дикого типа (рис. 2B).Эти результаты предполагают, что фосфорилирование KGB-1 по Thr-304 негативно регулирует функцию FOS-1.
Идентификация генов, транскрипция которых активируется путем KGB-1
Чтобы понять, как путь KGB-1 модулирует активность гена, и определить физиологические процессы, в которых может быть задействована реакция на стресс тяжелыми металлами, мы исследовали изменения экспрессии генов у животных дикого типа и мутантных животных kgb-1 , подвергшихся воздействию тяжелых металлов. стресс путем проведения анализа микроматрицы (см. Материалы и методы) (Рисунок S4A и таблицы S2, S3, S4, S5, S6, S7).Исходя из этого, мы идентифицировали шесть kreg ( KGB-1-регулируемый ген ) генов, экспрессия которых регулируется KGB-1 (рисунок S4B и таблица S8). Среди них экспрессия двух генов увеличивалась в ответ на ионы Cu 2+ (Рисунок S4B и Таблица S8). Они получили обозначение kreg-1 и kreg-2 . Белок, кодируемый kreg-1 ( F53A9.2 ), представляет собой новый белок из 83 аминокислот с полигистидиновыми полосами, в то время как ген kreg-2 идентичен lys-3 , который кодирует лизоцим.Мы подтвердили наши данные микрочипа с помощью количественной ОТ-ПЦР в реальном времени (qRT-PCR) (рис. 3A и 3B). У животных дикого типа Cu 2+ индуцировал экспрессию как kreg-1 , так и kreg-2 , но у мутантов kgb-1 (km21) индукция обоих генов была значительно снижена. Чтобы определить, играют ли гены kreg функционально важные роли в устойчивости к стрессу тяжелых металлов у C. elegans in vivo, мы использовали РНКи для подавления экспрессии kreg-1 или kreg-2 , а затем исследовали стрессовая реакция.РНК против kreg-1 или kreg-2 вызвали частичную чувствительность к ионам Cu 2+ (Рисунок 3C и Рисунок S5). Ген kreg-2 / lys-3 кодирует секретируемый лизоцим, который предположительно участвует в антибактериальной защите [19]. Это повысило вероятность того, что бактерии могут играть роль в восприимчивости к стрессу, вызванному тяжелыми металлами. Чтобы проверить эту возможность, мы кормили червей жизнеспособными бактериями, а не бактериями, убитыми нагреванием, и спрашивали, влияет ли это на их чувствительность к тяжелым металлам.Мы обнаружили, что тепловая обработка бактерий не влияла ни на чувствительность к тяжелым металлам у животных дикого типа, ни на фенотип, чувствительный к тяжелым металлам, вызванный мутациями kgb-1 и lys-3 (данные не показаны). Таким образом, бактерии, по-видимому, не играют никакой роли в восприимчивости к стрессу тяжелых металлов, и остается неясным, как LYS-3 может защищать от стресса тяжелых металлов.
Рисунок 3. Путь KGB-1 регулирует экспрессию kreg генов.
(A, B) Влияние иона меди на экспрессию kreg-1 (A) и kreg-2 (B).Животных дикого типа и мутантных животных kgb-1 и культивировали на чашках, засеянных штаммом бактерий. Через 3 дня после вылупления животных обрабатывали сульфатом меди (1 мМ) в течение 1 часа и выделяли общую РНК. Экспрессию генов анализировали с помощью qRT-PCR. Данные сравниваются с использованием одностороннего дисперсионного анализа. ** P <0,01. (C) Чувствительность к тяжелым металлам, вызванная ингибированием kreg генов. eri-1 мутантных животных культивировали в эмбриогенезе на нормальных чашках, содержащих сульфат меди (100 мкМ), и засевали штаммами бактерий, экспрессирующих указанную двухцепочечную РНК.Относительная жизнеспособность показана со стандартными ошибками. Планки погрешностей указывают 95% доверительный интервал. ** P <0,01 согласно тесту Стьюдента t . (D, E) Влияние иона меди на экспрессию репортера kreg-1 . Животных дикого типа и мутантных животных kgb-1 , несущих трансген Pkreg-1 :: venus в качестве внехромосомного массива, культивировали на чашках, засеянных штаммом бактерий, экспрессирующих двухцепочечную РНК для vhp-1 . Через 3 дня после вылупления животных обрабатывали сульфатом меди (1 мМ) в течение 1 часа.Затем этих животных переносили на чашки с NGM и инкубировали в течение 3 часов. Флуоресцентные изображения (Венера) показаны в D. Масштабная шкала: 100 мкм. «Слабый» относится к животным, у которых в кишечнике Венера присутствовала в низких количествах. «Сильный» означает, что Венера присутствовала в больших количествах в большей части кишечника. Процентное содержание животных в каждой категории экспрессии указано в E. Показано количество (n) исследованных животных.
https://doi.org/10.1371/journal.pgen.1003315.g003
Для анализа in vivo паттернов экспрессии kreg-1 и разработки инструментов для дальнейшего анализа мы создали венеру Pkreg-1 :: . Репортер , состоящий из промотора kreg-1 , управляющего экспрессией venus .Животные дикого типа, несущие репортер Pkreg-1 :: venus , демонстрировали слабую экспрессию Венеры в отсутствие Cu 2+ (фиг. 3D и 3E). Однако экспрессия Pkreg-1 :: venus достоверно индуцировалась в кишечнике животных после инкубации с Cu 2+ (фиг. 3D и 3E). Чтобы подтвердить, что репортер Pkreg-1 :: venus ведет себя аналогично эндогенной мРНК kreg-1 , мы проверили, зависит ли индукция Pkreg-1 :: venus от пути KGB-1 MAPK, который регулируется отрицательно. фосфатазой VHP-1 [5].В отличие от животных дикого типа, очень небольшая экспрессия Pkreg-1 :: venus была индуцирована Cu 2+ у мутантов kgb-1 (km21) (Фигуры 3D и 3E). Обработка животных vhp-1 РНКи приводила к конститутивной экспрессии трансгена Pkreg-1 :: venus у животных дикого типа, но не у животных kgb-1 (km21) (рис. 3D и 3E). Таким образом, репортер Pkreg-1 :: venus индуцируется в ответ на стресс тяжелыми металлами посредством активации пути KGB-1.
FOS-1 действует как репрессор индукции
kreg-1 , опосредованной путем KGB-1Чтобы понять роль FOS-1 в индукции kreg-1 в ответ на стресс Cu 2+ , мы исследовали влияние fos-1 RNAi на экспрессию Pkreg-1 :: venus в C. elegans . Обработка fos-1 РНКи заметно увеличивала экспрессию в кишечнике Pkreg-1 :: venus даже в отсутствие Cu 2+ (фиг. 4).Эффект fos-1 RNAi на экспрессию kreg-1 и kreg-2 был дополнительно подтвержден с помощью qRT-PCR (фигура S6). Эти результаты повысили вероятность того, что FOS-1 функционирует как репрессор для индукции гена, активируемого путем KGB-1. Чтобы проверить эту гипотезу, мы провели анализ эпистаза с использованием fos-1 РНКи и kgb-1 (km21) мутантов. Мы наблюдали, что, хотя экспрессия репортерного гена Pkreg-1 :: venus была снижена у мутантов kgb-1 (km21) , обработка fos-1 РНКи была эпистатичной для этого и приводила к увеличению kreg-1. репортерной активности (рис. 4).Это указывает на то, что FOS-1 функционирует ниже по течению от KGB-1 как репрессор индукции kreg-1 с помощью Cu 2+ .
Рисунок 4. FOS-1 репрессирует экспрессию kreg-1 .
Животных дикого типа и kgb-1 мутантных животных, несущих трансген Pkreg-1 :: venus в качестве внехромосомного массива, культивировали на чашках, засеянных штаммом бактерий, экспрессирующих двухцепочечную РНК для fos-1 . Флуоресцентные изображения (Венера) показаны на A.Масштабная линейка: 100 мкм. «Слабый» относится к животным, у которых в кишечнике Венера присутствовала в низких количествах. «Сильный» означает, что Венера присутствовала в больших количествах в большей части кишечника. Процентное содержание животных в каждой категории экспрессии указано в B. Показано количество (n) исследованных животных.
https://doi.org/10.1371/journal.pgen.1003315.g004
Инкубация с Cu 2+ индуцировала экспрессию Pkreg-1 :: venus в кишечнике способом, зависящим от пути KGB-1.Это наблюдение предполагает, что активация пути KGB-1 в кишечнике имеет решающее значение для защиты от стресса, связанного с тяжелыми металлами. В соответствии с этим MEK-1, MAPKK в пути KGB-1, экспрессируется в клетках кишечника [6], [20]. Однако ранее мы показали, что экспрессия MEK-1 в эпидермисе может спасти чувствительный к Cu 2+ фенотип нуль-мутантов mek-1 [6]. Чтобы проверить, придает ли экспрессия MEK-1 в кишечнике мутантов mek-1 устойчивость к стрессу тяжелых металлов, мы экспрессировали кДНК mek-1 в кишечнике с использованием промотора elt-2 .Мутант с делецией mek-1 (ks54) , несущий Pelt-2 :: mek-1 , проявлял устойчивость к стрессу тяжелых металлов (фигура S7). Репортер Pkreg-1 :: venus может не иметь области, необходимой для его экспрессии в эпидермисе.
Белки Fos связываются с Jun или другими белками bZIP с образованием димерного комплекса AP-1, который регулирует экспрессию генов [9], [10], [18]. Фактически, подобно белкам Fos и Jun млекопитающих и Drosophila, C. elegans FOS-1 и JUN-1 образуют гетеродимеры [18], [21].Чтобы проверить, играет ли C. elegans jun-1 ту же роль, что и fos-1 в модуляции экспрессии kreg-1 , мы лечили животных дикого типа с помощью jun-1 РНКи, однако это не увеличивало кишечную Pkreg-1 :: экспрессия venus (рисунок S8A). ATF-7 является членом семейства факторов транскрипции bZIP и функционирует в врожденном иммунитете, опосредованном путем PMK-1 p38 [22]. Поэтому мы протестировали эффект atf-7 РНКи на репортерную активность Pkreg-1 :: venus и аналогичным образом не наблюдали никакого эффекта (рисунок S8A).В соответствии с этими результатами, ни нокдаун jun-1 , ни мутация потери функции atf-7 (qd22) не привели к повышенной чувствительности к стрессу тяжелых металлов у животных дикого типа или подавлению стресс-чувствительного фенотипа kgb-1 мутантов (Рисунок S8B и S8C). Таким образом, JUN-1 и ATF-7 не участвуют в стрессовой реакции тяжелых металлов, опосредованной путем KGB-1.
Домен bZIP Fos связывает консенсусную последовательность TGA (C / G) TCA, называемую TPA-чувствительным элементом (TRE) [23].Промоторная область гена kreg-1 содержит два связывающих мотива TRE, названных TRE1 и TRE2 (рис. 5А). Чтобы определить, требуются ли эти мотивы TRE для опосредованной FOS-1 репрессии экспрессии Pkreg-1 :: venus , мы удалили каждый мотив независимо в репортере Pkreg-1 :: venus (рис. 5А). Делеция TRE1 ( Pkreg-1Δtre1 :: venus ) не влияла на характер экспрессии трансгена (фиг. 5B и 5C). Напротив, делеция TRE2 ( Pkreg-1Δtre2 :: venus ) приводила к конститутивной экспрессии как у животных дикого типа, так и у мутантных животных kgb-1 (km21) (Фиг.5B и 5C).Кроме того, мы обнаружили, что обработка fos-1 РНКи не усиливала конститутивную экспрессию трансгена Pkreg-1Δtre2 :: venus (рис. 5B и 5C). Таким образом, сайт связывания TRE2 необходим в цис-системе для опосредования репрессии kreg-1 с помощью FOS-1. Эти результаты подтверждают возможность того, что FOS-1 негативно регулирует экспрессию kreg-1 через сайт TRE2 в промоторе.
Рисунок 5. FOS-1 негативно регулирует экспрессию kreg-1 через сайт TRE2.
(A) Схематическое изображение структуры промотора kreg-1 . Два участка TRE представлены темными прямоугольниками. (B, C) Влияние делеции сайтов TRE на экспрессию репортера kreg-1 . Животных дикого типа и мутантных животных kgb-1 , несущих трансген Pkreg-1Δtre1 :: venus или Pkreg-1Δtre2 :: venus в качестве внехромосомного массива, культивировали на чашках, засеянных штаммом бактерий, экспрессирующих двухцепочечную РНК. для фос-1 .Флуоресцентные изображения (Венера) показаны на B. Масштабная шкала: 100 мкм. «Слабый» относится к животным, у которых в кишечнике Венера присутствовала в низких количествах. «Сильный» означает, что Венера присутствовала в больших количествах в большей части кишечника. Процентное содержание животных в каждой категории экспрессии указано в C. Показано количество (n) исследованных животных.
https://doi.org/10.1371/journal.pgen.1003315.g005
Чтобы проверить, связывается ли FOS-1 напрямую с промотором kreg-1 через TRE2, мы провели тесты иммунопреципитации хроматина (ChIP).Клетки 293 эмбриональной почки человека (HEK) котрансфицировали репортером Pkreg-1 :: venus вместе либо с T7-FOS-1, либо с T7-hGrhl2 отрицательным контролем. Лизаты подвергали иммунопреципитации антителами против Т7, и количественный анализ ПЦР выполняли для амплификации фрагментов ДНК, содержащихся в иммунопреципитированных комплексах. ПЦР-анализ показал, что FOS-1 эффективно связывается с промотором kreg-1 , тогда как белок Grhl2 человека отрицательного контроля — нет (фиг. 6A).Мы смогли обнаружить связывание FOS-1 с трансгеном Pkreg-1Δtre1 :: venus (данные не показаны), но не с трансгеном Pkreg-1Δtre2 :: venus (рис. 6A), что указывает на то, что FOS-1 связывается с промотор kreg-1 через взаимодействие с мотивом TRE2.
Фиг. 6. ДНК-связывающая активность FOS-1 ингибируется KGB-1-опосредованным фосфорилированием.
(A) FOS-1 связывается с сайтами TRE2. Клетки HEK293 котрансфицировали конструкцией Pkreg-1 :: venus вместе с векторами экспрессии, кодирующими T7-FOS-1 или T7-hGrhl2, как указано.Для анализов иммунопреципитации хроматина иммунопреципитированные комплексы, полученные с антителами против Т7, анализировали с помощью количественной ПЦР. Данные сравниваются с использованием одностороннего дисперсионного анализа. ** P <0,01. Иммунопреципитированные T7-FOS-1 и T7-hGrhl2 отслеживали с помощью вестерн-блоттинга. (B, C) Влияние фосфорилирования FOS-1 с помощью KGB-1 на активность связывания TRE2. Клетки COS-7 котрансфицировали векторами экспрессии, кодирующими T7-FOS-1, HA-KGB-1 WT, HA-KGB-1 KN и FLAG-MEK-1, как указано. Для анализов задержки геля экстракты клеток инкубировали с зондами замедления TRE2.Антитела против Т7 или нормальный мышиный IgG добавляли в реакциях связывания (B). Экспрессию T7-FOS-1, HA-KGB-1 и FLAG-MEK-1 контролировали с помощью вестерн-блоттинга. Эксперименты проводились трижды с аналогичными результатами.
https://doi.org/10.1371/journal.pgen.1003315.g006
Как показано выше, самоассоциация FOS-1 предотвращается KGB-1-опосредованным фосфорилированием. Затем мы выяснили, влияет ли фосфорилирование FOS-1 на его способность взаимодействовать с элементом TRE2 промотора kreg-1 .Экстракты клеток, полученные из клеток COS-7, экспрессирующих T7-FOS-1, инкубировали с зондами и анализировали с помощью анализа задержки геля. Мы обнаружили, что FOS-1 был способен связываться с зондом, содержащим оптимальную последовательность TRE2, но не с зондом, в котором основные 6 оснований TRE2 были удалены (рис. 6B, дорожки 1, 2, 5). Чтобы дополнительно подтвердить взаимодействие FOS-1 с элементом TRE2, мы использовали сайт-направленный мутагенез для преобразования консенсусной последовательности TGAGTCA в AAGCTTA в элементе TRE2. Было показано, что подобное изменение ингибирует взаимодействие AP-1-ДНК [24].Действительно, мы наблюдали, что FOS-1 не может связываться с мутантным зондом TRE2 (фиг. 6B, дорожка 6). Кроме того, комплекс белок-ДНК был суперсмещен путем предварительной инкубации с антителом против Т7 (фиг. 6В, дорожка 3), что указывает на то, что T7-FOS-1 участвует в этом комплексе. Когда MEK-1 и KGB-1 коэкспрессировались с T7-FOS-1 в клетках COS-7, ассоциация FOS-1 с оптимальным зондом TRE2 снижалась (рис. 6C, дорожки 1-3). Это снижение зависело от киназной активности KGB-1 (фиг. 6C, дорожка 4).Таким образом, фосфорилирование FOS-1 с помощью KGB-1 снижает ассоциацию FOS-1 с промотором его целевого гена. Взятые вместе, эти результаты предполагают, что путь KGB-1 активирует транскрипцию генов-мишеней путем фосфорилирования FOS-1, что ингибирует самоассоциацию FOS-1 и связывание с его промотором-мишенью.
C. elegans гистондеацетилаза HDA-1 функционирует как негативный регулятор индукции kreg-1 , опосредованной путем KGB-1Как FOS-1 репрессирует транскрипцию kreg-1 ? Учитывая важность динамики хроматина в контроле экспрессии генов, недавние работы были сосредоточены на партнерах взаимодействия AP-1, способных к ремоделированию и модификации хроматина [13] — [16], [25], [26].Сообщалось, что AP-1 во время врожденного иммунного ответа рекрутирует HDAC1, член семейства гистондеацетилаз класса I (HDAC), на промотор гена, кодирующего антибактериальный белок, где он деацетилирует гистоны, связанные с промотором [ 26]. Поэтому мы исследовали, могут ли HDACs влиять на экспрессию Pkreg-1 :: venus . C. elegans обладает тремя генами HDAC, hda-1 , hda-2 и hda-3 , которые кодируют гомологи HDAC класса I [27], [28].Мы обнаружили, что обработка hda-1 РНКи приводила к конститутивной экспрессии репортера Pkreg-1 :: venus у животных дикого типа (фиг. 7A и 7B). Кроме того, нокдаун hda-1 значительно восстановил потерю кишечной экспрессии Pkreg-1 :: venus у мутантов kgb-1 (km21) (Фигуры 7A и 7B). Мы также обнаружили, что hda-1 РНКи мало влияет на конститутивную экспрессию, вызванную делецией Δtre2 репортера Pkreg-1 :: venus (рис. 7A и 7B), что указывает на негативную регуляцию kreg- 1. Для экспрессии HDA-1 необходим мотив TRE2 в промоторе.Кроме того, мы наблюдали с помощью qRT-PCR, что hda-1 RNAi усиливали экспрессию гена kreg-2 (рисунок S9), подтверждая, что этот эффект не специфичен только для kreg-1 .
Рис. 7. HDA-1 работает совместно с FOS-1.
(A, B) Влияние истощения hda-1 на экспрессию репортера kreg-1 . Животных дикого типа и мутантных животных kgb-1 , несущих трансгены Pkreg-1 :: venus в качестве внехромосомного массива, культивировали на чашках, засеянных штаммом бактерий, экспрессирующих двухцепочечную РНК для hda-1 .Флуоресцентные изображения (Венера) показаны в A. Масштабная шкала: 100 мкм. «Слабый» относится к животным, у которых в кишечнике Венера присутствовала в низких количествах. «Сильный» означает, что Венера присутствовала в больших количествах в большей части кишечника. Процентное содержание животных в каждой категории экспрессии указано в B. Показано количество (n) исследованных животных. (C) Взаимодействие HDA-1 с FOS-1. Клетки HEK293 котрансфицировали конструкцией Pkreg-1 :: venus и векторами экспрессии, кодирующими FLAG-HDA-1 и T7-FOS-1, как указано.Экстракты цельных клеток и иммунопреципитированные комплексы, полученные с антителами против FLAG, анализировали с помощью вестерн-блоттинга. Интенсивность сигнала FOS-1 в коиммунопреципитатах с HDA-1 была определена количественно и нормализована к таковой в экстрактах цельных клеток. Показаны относительные уровни иммунопреципитированного FOS-1. Эксперименты проводились трижды с аналогичными результатами. (D) Подавление фенотипа kgb-1 , чувствительного к тяжелым металлам, за счет истощения hda-1 . Каждое животное культивировали из эмбриогенеза на нормальных чашках, содержащих сульфат меди (40 мкМ), и засевали штаммом бактерий, экспрессирующим двухцепочечную РНК для hda-1 .Относительная жизнеспособность показана со стандартными ошибками. Планки погрешностей указывают 95% доверительный интервал. ** P <0,01 согласно тесту Стьюдента t . NS, не имеет значения.
https://doi.org/10.1371/journal.pgen.1003315.g007
Затем мы спросили, может ли FOS-1 взаимодействовать с HDA-1. T7-FOS-1 и FLAG-HDA-1 коэкспрессировались в клетках HEK293. Мы иммунопреципитировали FLAG-HDA-1 антителами против FLAG и зондировали T7-FOS-1 с помощью вестерн-блоттинга с антителами против T7.Нам не удалось обнаружить ассоциации между FOS1- и HDA-1 (рис. 7C, дорожка 1). Однако, если мы трансфицировали репортер Pkreg-1 :: venus вместе с T7-FOS-1 и FLAG-HDA-1, мы могли бы обнаружить связь между FOS-1 и HDA-1 (рис. 7C, дорожка 3). . Кроме того, удаление сайта TRE2 из репортера Pkreg-1 :: venus уменьшило это взаимодействие (рис. 7C, дорожка 4). Эти результаты предполагают, что HDA-1 и FOS-1 могут связываться с промотором kreg-1 .
Наконец, мы исследовали, способствует ли HDA-1 ответ на стресс тяжелыми металлами. Нокдаун hda-1 с помощью РНКи у животных дикого типа не повлиял на их чувствительность к ионам Cu 2+ (фигура 7D). Напротив, нокдаун hda-1 с помощью РНКи подавлял чувствительность к ионам Cu 2+ у мутантов kgb-1 (km21) . Таким образом, HDA-1 негативно регулирует стрессовую реакцию тяжелых металлов, что согласуется с наблюдением, что экспрессия kreg-1 подавляется HDA-1.
Discussion
Каскады JNK MAPK являются ключевыми модулями передачи сигналов, контролирующими различные пути передачи сигналов у эукариот. Путь C. elegans KGB-1 JNK регулирует стрессовую реакцию на тяжелые металлы [5], [6], [7]. В этом исследовании мы представляем функциональные доказательства, показывающие, что FOS-1, фактор транскрипции bZIP, гомологичный человеческому Fos, и HDA-1, член семейства гистондеацетилаз класса I, являются ключевыми компонентами, функционирующими ниже по течению в KGB-1-опосредованном путь стрессовой реакции (рис. 8).В отсутствие стресса FOS-1 и HDA-1 действуют совместно, подавляя транскрипцию генов-мишеней, участвующих в стрессовой реакции тяжелых металлов. В ответ на стресс активированный KGB-1 снимает эту репрессию, фосфорилируя FOS-1. Таким образом, мы обеспечиваем механистическую связь между фосфорилированием FOS-1, степенью его димеризации и его биологической активностью / функцией.
Рис. 8. Предлагаемая модель пути KGB-1 в стрессовой реакции.
В отсутствие стресса тяжелыми металлами FOS-1 образует гомодимеры и связывается с мотивом TRE2 в промоторе-мишени kreg .Димеризация FOS-1 усиливает привлечение HDA-1 к промотору. Репрессорный комплекс FOS-1 / HDA-1 репрессирует транскрипцию kreg генов-мишеней (левая панель). В присутствии тяжелых металлов путь KGB-1 активируется, и FOS-1 фосфорилируется с помощью KGB-1. Фосфорилирование FOS-1 приводит к переключению с димера на мономер, что приводит к диссоциации репрессорного комплекса FOS-1 / HDA-1 от целевого промотора, который активирует транскрипцию kreg генов (правая панель).
https://doi.org/10.1371/journal.pgen.1003315.g008
Идентификация генов-мишеней ниже пути KGB-1
Ключевым шагом в понимании пути JNK KGB-1 является идентификация нижестоящих целей, которые активируются KGB-1 и которые выполняют фактическую защитную функцию. Анализ экспрессии генов, сравнивающий мутанты дикого типа и kgb-1, привел к идентификации двух мишеней пути KGB-1, а именно kreg-1 и kreg-2 / lys-3 .Обе мишени транскрипционно индуцируются стрессом, обе требуют пути KGB-1 для их полной индукции, и обе необходимы для защиты животного от стресса, связанного с тяжелыми металлами. Эти данные предполагают, что активация пути KGB-1 приводит к увеличению продукции этих белков, что, в свою очередь, приводит к защите и защите от стресса тяжелыми металлами.
Идентичность одного из этих генов особенно показательна: белок, кодируемый kreg-1 , содержит полигистидиновые участки, которые, как хорошо известно, связывают ионы металлов (например,грамм. Ni 2+ , Cu 2+ , Co 2+ и Zn 2+ ) и широко используется в качестве аффинной метки [29]. Предыдущее исследование также показало, что Hpn, белок из 60 аминокислот с полигистидиновыми участками в Helicobacter pylori , предпочтительно связывает ион Cu 2+ и способен придавать устойчивость к меди при экспрессии в Escherichia coli [30]. Таким образом, мы предполагаем, что белок KREG-1 может придавать устойчивость к стрессу Cu 2+ за счет хелатирования этого иона посредством этих полигистидиновых участков.
Роль ФОС-1 в пути КГБ-1
В этом исследовании мы идентифицировали фактор транскрипции FOS-1 bZIP как нисходящий компонент пути KGB-1. FOS-1 был выделен как белок, который связывается с KGB-1, и мы показали, что KGB-1 фосфорилирует FOS-1 в C-концевой регуляторной области. Fos и Jun факторов транскрипции bZIP являются частью комплексов факторов транскрипции AP-1 [18], [23]. Эти факторы транскрипции гомологичны в двух соседних доменах: основной области и мотиве лейциновой молнии, которые необходимы для связывания ДНК и димеризации факторов соответственно.Действительно, C. elegans FOS-1 действует как активатор экспрессии специфичного для сперматозоидов гена plc-1 , образуя гетеродимеры с JUN-1 [21]. Кроме того, полногеномный скрининг РНКи идентифицировал fos-1 и jun-1 как гены, важные для KGB-1-опосредованного пути защиты против порообразующих токсинов, вырабатываемых почвенными бактериями [8]. Таким образом, вероятно, что путь JNK-AP-1 играет роль в защите от порообразующих токсинов, регулируя транскрипционные ответы.Однако мы обнаружили, что JUN-1 не участвует в пути стрессового ответа, опосредованном KGB-1. Мы продемонстрировали, что FOS-1 способен образовывать гомодимеры и действует как репрессор экспрессии своего целевого гена. Димеризация FOS-1, скорее всего, служит для повышения его аффинности связывания ДНК с промоторами-мишенями, и поэтому вероятно, что партнер связывания FOS-1 C. elegans определяет, функционирует ли FOS-1 как репрессор или активатор.
Было высказано предположение, что факторы транскрипции bZIP могут переключаться между режимом репрессора и активатора, что иллюстрируется регуляцией транскрипции C.elegans ATF-7 и дрожжевой Sko1p в результате активации MAPK [22], [31]. Активация пути PMK-1 p38 MAPK в ответ на инфекцию патогеном приводит к фосфорилированию PMK-1 ATF-7, что приводит к переключению ATF-7 с репрессора транскрипции на активатор [22]. У дрожжей Sko1p фосфорилируется посредством пути Hog1p MAPK в ответ на осмотический стресс, и это превращает Sko1p из репрессора в активатор [31]. Здесь мы обнаружили, что истощение FOS-1 подавляло чувствительность к тяжелым металлам у мутантов kgb-1 , но не влияло на чувствительность к тяжелым металлам у животных дикого типа.Эти результаты убедительно свидетельствуют о том, что FOS-1 просто действует как репрессор транскрипции стрессовой реакции тяжелых металлов, опосредованной путем KGB-1. Таким образом, регуляция FOS-1 стрессовой реакции тяжелых металлов, по-видимому, не включает переключение его активности регуляции транскрипции.
Наш анализ, показывающий фосфорилирование FOS-1 с помощью KGB-1 и его биологические последствия, предоставил некоторые новые молекулярные знания о регуляции FOS-1. Мы обнаружили, что фосфорилирование блокирует образование димера FOS-1 и что это приводит к снижению связывания с промотором генов-мишеней.Мы предполагаем, что димерный FOS-1 связывает ДНК с более высоким сродством, чем мономерная форма. Основываясь на этих данных, мы предполагаем, что активация пути KGB-1 в ответ на стресс с тяжелыми металлами приводит к фосфорилированию FOS-1, что приводит к переключению FOS-1 с димера на мономер и, как следствие, к потере связывания с промотором (Рисунок 8). .
Механизм опосредованного FOS-1 / HDA-1 контроля экспрессии генов в пути KGB-1
Как FOS-1 действует как репрессор транскрипции kreg-1 ? Наши результаты предполагают, что гистондеацетилаза HDA-1 взаимодействует с FOS-1, подавляя транскрипцию гена kreg-1 (рис. 8).Было показано, что многие факторы транскрипции рекрутируют белковые комплексы, которые локально изменяют ацетилирование гистонов. Рекрутирование HDAC может приводить к репрессии транскрипции, тогда как рекрутирование гистонацетилтрансферазы может приводить к активации транскрипции. Эти результаты предполагают, что FOS-1 действует как репрессор транскрипции, рекрутируя HDA-1 на промотор гена kreg-1 . Следовательно, весьма вероятно, что KGB-1 активирует экспрессию kreg-1 путем подавления репрессорного комплекса FOS-1 / HDA-1 (Рисунок 8).В этой модели FOS-1 образует гомодимеры и связывается с мотивом TRE2 в промоторе kreg-1 . Димеризация FOS-1 может также усиливать рекрутирование HDA-1 на промотор. Таким образом, репрессорный комплекс FOS-1 / HDA-1 может функционировать для предотвращения непреднамеренной активации генов kreg в отсутствие стресса тяжелыми металлами. При сигнале стресса тяжелым металлом KGB-1 активируется и фосфорилирует FOS-1, что приводит к диссоциации димера FOS-1 и диссоциации репрессорного комплекса FOS-1 / HDA-1 с промотора kreg-1 , приводя к активации экспрессии kreg-1 .
Способность Fos действовать как репрессор также описана в Drosophila [14]. HDAC рекрутируется на промоторы, занятые нефосфорилированными DFos, и репрессирует транскрипцию своих генов-мишеней. JNK-опосредованное фосфорилирование DFos не только высвобождает корепрессорный комплекс HDAC и приводит к активации за счет дерепрессии, но также демаскирует функцию гистонацетилтрансферазы и приводит к повышению эффективности транскрипции. Однако механизм C.elegans Дерепрессия FOS-1, описанная здесь, представляет собой уникальный случай, когда фосфорилирование фактора транскрипции приводит к снижению димеризации, связыванию ДНК и потере ассоциации HDAC. Сравнивая Drosophila Fos и C. elegans FOS-1, мы обнаружили, что значительная гомология присутствует только в смежных мотивах основной и лейциновой застежки-молнии. Кроме того, аминокислотная последовательность области, фланкирующей сайты фосфорилирования, не консервативна между Drosophila Fos и C.elegans FOS-1 [32]. Тем не менее, основные механизмы JNK-опосредованного фосфорилирования Fos и его эффектов на образование репрессорных комплексов Fos / HDAC эволюционно законсервированы между C. elegans и Drosophila . Это открытие, таким образом, раскрывает общий основной механизм, с помощью которого путь передачи сигналов JNK модулирует активность факторов транскрипции bZIP семейства Fos.
Таким образом, мы описали механизм регуляции транскрипции, посредством которого KGB-1 активирует экспрессию генов стрессового ответа, способствуя диссоциации репрессорного комплекса FOS-1 / HDA-1.Это новое открытие, которое может дать ценную информацию о реакции на стресс в контексте всего организма. Это значительно улучшило бы наше понимание стрессовой реакции, опосредованной передачей сигналов JNK, чтобы выяснить, как гены kreg придают толерантность к тяжелым металлам у C. elegans .
Материалы и методы
Плазмиды
Дрожжевой экспрессионный вектор для KGB-1, слитого с ДНК-связывающим доменом (DBD) LexA (K67R), был сконструирован путем вставки каждой кодирующей последовательности в pBTM116.Экспрессионные векторы млекопитающих для HA-меченного эпитопом KGB-1 (HA-KGB-1) и FLAG-меченного эпитопом MEK-1 (FLAG-MEK-1) были описаны ранее [5]. КДНК для fos-1 была выделена в рамках проекта Y. Kohara EST (Национальный институт генетики, Мисима, Япония). КДНК для hda-1 и Grhl2 человека амплифицировали с помощью ПЦР из библиотек кДНК C. elegans и человека, соответственно, и полностью секвенировали. Конструкции экспрессии млекопитающих для T7-FOS-1, GFP-FLAG-FOS-1, FLAG-HDA-1 и T7-hGrhl2 были сконструированы путем вставки каждой кодирующей последовательности в вектор, экспрессирующий белок, меченный эпитопом, под контролем цитомегаловируса ( CMV) промотор.Каждую кодирующую последовательность амплифицировали с помощью ПЦР с использованием наборов праймеров для создания сайтов рестрикции непосредственно перед первым кодоном и после стоп-кодона. Мутировавшие формы FOS-1 получали с помощью олигонуклеотид-направленной ПЦР, и мутации проверяли секвенированием ДНК. Для конструирования плазмид Phsp-16 :: t7 :: fos-1 каждый фрагмент t7 :: fos-1 из векторов экспрессии T7-FOS-1 млекопитающих был субклонирован в вектор pPD49.78. Технологию клонирования шлюза (Invitrogen) использовали для конструирования плазмиды Pkreg-1 :: venus для экспрессии на животных.Плазмида Pkreg-1 :: venus была сконструирована путем слияния кодирующей последовательности venus с геномным фрагментом 2,8 т.п.н., содержащим промотор kreg-1 . Делеции Pkreg-1 :: venus были сделаны с помощью олигонуклеотид-направленной ПЦР, и делеции были проверены секвенированием ДНК. Плазмида Pelt-2 :: mek-1 :: venus была сконструирована путем слияния трех фрагментов ДНК в следующем порядке: геномный фрагмент 2,9 т.п.н., содержащий промотор elt-2 , кодирующую последовательность mek-1 , и кодирующая последовательность venus .Плазмиды Pmek-1 :: mek-1 :: venus , Pttx-3 :: gfp и sur-5 :: gfp были описаны ранее [6], [33], [34].
Антитела
Кроличьи поликлональные антитела против фосфо-FOS-1 были индуцированы против синтетического фосфопептида, CSNTGL (P) TPSGQP [(p), фосфорилированный], который соответствует C-концевой части FOS-1 и очищен с помощью аффинности. Использовали моноклональное антитело против HA 16B12 (Covance), моноклональное антитело против FLAG M2 (Sigma), моноклональное антитело против T7 (Novagen) и поликлональное антитело против GFP (Clontech).
C. elegans штаммовВсе штаммы поддерживали на чашках со средой для роста нематод (NGM) при 20 ° C и кормили бактериями штамма OP50, как описано [35]. В данном исследовании использовались аллели N2 Bristol как дикого типа, kgb-1 (km21) , mek-1 (ks54) , atf-7 (qd22) и eri-1 (mg366) . . Штаммы, несущие трансген Phsp-16 :: t7 :: fos-1 , были получены путем инъекции этой ДНК вместе с плазмидой sur-5 :: gfp , которая экспрессирует GFP в ядрах большинства соматических клеток от эмбриогенеза, в гонады молодых взрослых животных N2, как описано [36].Штаммы, несущие трансген Pkreg-1 :: venus , были получены путем инъекции этой ДНК вместе с плазмидой Pttx-3 :: gfp , которая экспрессирует GFP в паре интернейронов AIY, в гонады молодых взрослых N2. животные.
Стресс-чувствительность
Анализы влияния трансгенов fos-1 на токсичность тяжелых металлов проводили следующим образом. Животных выращивали и позволяли откладывать яйца на чашки NGM, засеянные бактериями штамма OP50.Эмбрионы, экспрессирующие GFP, переносили на планшеты NGM, содержащие указанные концентрации сульфата меди. После инкубации в течение 1 дня при 20 ° C количество вылупившихся эмбрионов определяли путем подсчета невылупившихся эмбрионов. После дополнительной инкубации в течение 3 дней либо при 20 ° C, либо при 33 ° C в течение 1 часа дважды в день подсчитывали животных, которые достигли взрослого возраста. Процент взрослых особей рассчитывали путем умножения количества взрослых особей на 100 и деления на количество вылупившихся животных. Относительную жизнеспособность оценивали путем деления процентной доли взрослых особей в присутствии тяжелых металлов на процентную долю взрослых особей в отсутствие тяжелых металлов.
Анализы влияния РНКи на токсичность тяжелых металлов выполняли следующим образом. Животных выращивали и позволяли откладывать яйца на чашки NGM, засеянные бактериями штамма OP50. Эмбрионы переносили на чашки NGM, содержащие указанные концентрации сульфата меди, и засевали бактериями штамма HT115, несущими плазмиды, экспрессирующие соответствующие двухцепочечные РНК для fos-1 , kreg-1 , kreg-2 , jun-1 или hda-1 .После инкубации в течение 1 дня при 20 ° C количество вылупившихся эмбрионов определяли путем подсчета невылупившихся эмбрионов. Подсчет взрослых животных проводили через 4 дня после кладки яиц. Относительную жизнеспособность оценивали, как описано выше.
Выделение РНК, микрочип и qRT – PCR в реальном времени
Взрослых червей каждого штамма инкубировали с H 2 O или 1 мМ сульфатом меди в течение 1 часа. Затем получали тотальную РНК с использованием реагента Trizol (Invitrogen) с последующей обработкой ДНКазой I, экстракцией фенолом / хлороформом и осаждением этанолом.РНК растворяли в воде и использовали в качестве матрицы для анализа микрочипов всего генома и qRT-PCR в реальном времени. Обработка микроматрицы Affymetrix GeneChip была выполнена один раз компанией Takara Bio Inc. в соответствии с протоколом производителя (Affymetrix). Вкратце, тотальную РНК получали из животных дикого типа и мутантных животных kgb-1 , подвергнутых воздействию ионов Cu 2+ или оставленных без лечения (контроль). Биотинилированную кРНК гибридизовали с чипами Affymetrix Genechips, содержащими зонды против 22 500 транскриптов.qRT-PCR выполняли с помощью системы 7300 RT-PCR в реальном времени (Applied Biosystems) с использованием SYBR Premix Ex Taq (Takara). Стандартная кривая была построена из разбавленной РНК, полученной от животных дикого типа, и уровни экспрессии гена были нормализованы до экспрессии act-1 .
Идентификация
kreg геновРезультаты микроматрицы использовали в качестве начального скрининга для идентификации генов, экспрессия которых увеличивалась в ответ на ионы Cu 2+ и способом, зависящим от KGB-1.Мы выбрали гены-мишени следующим образом (рисунок S4A). Сначала сравнивали уровни экспрессии транскриптов между животными, получавшими или не получавшими лечение Cu 2+ (таблицы S2 и S3). Было выбрано 334 гена, которые более чем в 2 раза активировались Cu 2+ у животных дикого типа (Таблица S4). Во-вторых, мы сравнили индукцию гена, опосредованную Cu 2+ , у животных дикого типа с мутантными животными kgb-1 , чтобы идентифицировать гены, на индукцию которых влияло kgb-1 .Мы идентифицировали 66 генов, индукция которых с помощью Cu 2+ у мутантов kgb-1 была <50% индукции, наблюдаемой у животных дикого типа (Таблица S5). В-третьих, мы сравнили базальные уровни экспрессии у животных дикого типа и мутантных животных kgb-1 , поскольку базальная активность KGB-1 может быть обнаружена у животных дикого типа [5], [6]. Мы идентифицировали 50 генов, базальная экспрессия которых была снижена или не изменена у мутантов kgb-1 по сравнению с животными дикого типа (Таблица S6). Наконец, данные были обработаны вручную, чтобы удалить гены, экспрессия которых больше не прогнозировалась с использованием данных, доступных в Wormbase.Из этого мы выбрали 13 лучших генов, экспрессия которых в значительной степени индуцировалась Cu 2+ у животных дикого типа (таблица S7). Затем мы повторно исследовали регуляцию этих генов более количественно с помощью qRT-PCR (рисунок S4B). Из этого мы получили окончательный список из 6 генов, на регуляцию которых воспроизводимо влияло kgb-1 (Таблица S8).
Данные микрочипов для животных дикого типа, обработанных / необработанных Cu 2+ , и животных с мутантами kgb-1, обработанных / необработанных Cu 2+ , были депонированы в NCBI-GEO под номерами доступа. GSE42703.Для просмотра записей GSE42703 созданы следующие ссылки: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE42703
Репортерный анализ
животных дикого типа и kgb-1 мутантных животных, несущих трансген Pkreg-1 :: venus в качестве внехромосомного массива, культивировали на чашках, засеянных штаммом бактерий, экспрессирующих соответствующие двухцепочечные РНК для vhp-1 , fos-1 , jun-1 , atf-7 или hda-1 .Через 3 дня после вылупления животных обрабатывали сульфатом меди (1 мМ) в течение 1 часа. Затем этих животных переносили на чашки с NGM и инкубировали в течение 3 часов. Перечислены процентные доли животных в каждой категории экспрессии. «Слабый» относится к животным, у которых в кишечнике Венера присутствовала в низких количествах. «Сильный» означает, что Венера присутствовала в больших количествах в большей части кишечника.
Обработка фосфатазой, иммунопреципитация и анализы ChIP
Для обработки фосфатазой клеточные лизаты инкубировали с или без щелочной фосфатазы кишечника теленка (NEB) при 36 ° C в течение 5 минут.Иммунопреципитацию из клеток COS-7 проводили, как описано ранее [37]. Для иммунопреципитации из клеток HEK293 клетки предварительно обрабатывали 1% параформальдегидом в PBS в течение 10 минут и глицином до конечной концентрации 0,125 M в течение 5 минут и собирали. Анализ ChIP выполняли с использованием ChIP-IT Express Enzymatic Shearing (Active Motif) в соответствии с инструкциями производителя. Вкратце, экстракты растворимого хроматина получали из 2 × 10 8 клеток HEK293 и иммунопреципитировали моноклональными антителами против Т7 и магнитными гранулами протеина G (VERITAS) в течение ночи.Иммунопреципитированные комплексы ДНК-гистон инкубировали в течение ночи при 65 ° C для обратного перекрестного связывания, а затем обрабатывали РНКазой A и протеазой K. Очищенные фрагменты ДНК подвергали количественной ПЦР.
Анализ задержки гелеобразования
Трансфицированные клетки COS-7 лизировали в буфере для лизиса, содержащем 20 мМ HEPES (pH 7,4), 150 мМ NaCl, 12,5 мМ β-глицерофосфат, 1,5 мМ MgCl 2 , 2 мМ EGTA, 10 мМ NaF, 2 мМ дитиотреитол, 1 мМ Na 3 VO 4 , 1 мМ фенилметилсульфонилфторид, 100 ед. / мл апротинина, 0.5% Тритон Х-100. Реакции связывания проводили при комнатной температуре в течение 30 минут путем инкубации клеточных экстрактов и Cy5.5-меченных зондов замедления в связывающем буфере, содержащем 25 мМ Трис (pH 7,9), 250 мМ KCl, 1 мМ ЭДТА, 5% глицерин, 1 мМ дитиотреитол. , 0,25 мг / мл BSA, 0,1% Triton X-100 и 0,1 мкг / мл поли (dI) • poly (dC). Образцы анализировали на 3–12% полиакриламидных гелях. Для экспериментов с суперсдвигом в реакциях связывания добавляли антитела против Т7 или нормальный мышиный IgG (Santa Cruz) (1 мкг на дорожку).Последовательности зондов задержки геля следующие: зонд TRE2, 5′-AATTGCTGAGTCACAGACAT-3 ‘; мутантный зонд TRE2, 5’-AATTGCAAGCTTACAGACAT-3 ‘; зонд, удаляющий основные 6 оснований TRE2, 5’-AAATAATTGCCAGACATTAC-3 ‘. TRE2 и мутировавший TRE2 подчеркнуты.
Скрининг двугибридных дрожжей
Плазмиду LexA DBD-KGB-1 (K67R) использовали в качестве приманки для скрининга библиотеки кДНК Caenorhabditis elegans в pACTII [38]. Плазмида-приманка и кДНК библиотеки были совместно трансформированы в репортерный штамм L40 Saccharomyces cerevisiae [ MAT a, trp1 , leu2 , his3 , LYS2 :: — HIS3 , URA3 : 🙁 lexAop ) 8 — LacZ ].Дрожжевые клетки высевали на чашку с синтетической средой, не содержащей гистидина и содержащей 3-аминотриазол, и оставляли для роста при 30 ° C. Трансформанты, выращенные на чашках с селективной средой, затем снова наносили штрихами на чашки с селективной средой. Плазмиды собирали из колоний, которые росли на чашках с селективной средой, и подвергали секвенированию ДНК.
Вспомогательная информация
Рисунок S1.
ФОС-1 фосфорилируется КГБ-1. (А) Фосфорилирование FOS-1 КГБ-1. Клетки COS-7 котрансфицировали векторами экспрессии, кодирующими T7-FOS-1, HA-KGB-1 и FLAG-MEK-1, как указано.Экстракты целых клеток анализировали вестерн-блоттингом. (B) Влияние мутации T304E на FOS-1. Клетки COS-7 трансфицировали векторами экспрессии, кодирующими T7-FOS-1 WT и FOS-1 (T304E), как указано. Экстракты целых клеток анализировали вестерн-блоттингом.
https://doi.org/10.1371/journal.pgen.1003315.s001
(TIF)
Рисунок S2.
Сайты фосфорилирования ФОС-1 КГБ-1. (A, B) Клетки COS-7 котрансфицировали векторами экспрессии, кодирующими варианты T7-FOS-1, HA-KGB-1 WT, HA-KGB-1 KN и FLAG-MEK-1, как указано.Экстракты целых клеток анализировали вестерн-блоттингом. В вариантах FOS-1 каждый остаток Ser или Thr был заменен на Ala.
.https://doi.org/10.1371/journal.pgen.1003315.s002
(TIF)
Рисунок S3.
Влияние ингибирования fos-1 на стрессочувствительность. Каждое животное культивировали из эмбриогенеза на нормальных чашках, содержащих сульфат меди (40 мкМ), и засевали штаммом бактерий, экспрессирующим двухцепочечную РНК для fos-1 . Процент червей, достигших зрелости через 4 дня после откладки яиц, показан со стандартными ошибками.Планки погрешностей указывают 95% доверительный интервал. ** P <0,01 согласно тесту Стьюдента t . NS, не имеет значения.
https://doi.org/10.1371/journal.pgen.1003315.s003
(TIF)
Рисунок S4.
Идентификация kreg генов. (A) Блок-схема для скрининга микрочипов. Приведены сравнения между группами, подвергнутыми разному лечению. Было обнаружено 334 гена, экспрессия которых повышалась более чем в 2 раза у животных дикого типа, получавших / не леченных Cu 2+ .Из этих 334 генов 66 генов показали> 2-кратную повышающую регуляцию у животных дикого типа, обработанных Cu 2+ / обработанных Cu 2+ , kgb-1 животных. Из этих 66 генов 50 показали увеличение или отсутствие изменений у необработанных животных дикого типа / необработанных кгb-1 животных. (B) qRT-PCR анализ генов, выделенных из микроматрицы. Животных дикого типа и мутантных животных kgb-1 и культивировали на чашках, засеянных штаммом бактерий. Через 3 дня после вылупления животных обрабатывали сульфатом меди (1 мМ) в течение 1 часа и выделяли общую РНК.Экспрессию генов анализировали с помощью qRT-PCR, и шесть генов были идентифицированы как kreg ( KGB-1-регулируемый ген ). Данные сравниваются с использованием одностороннего дисперсионного анализа. * P <0,05, ** P <0,01. NS, не имеет значения.
https://doi.org/10.1371/journal.pgen.1003315.s004
(TIF)
Рисунок S5.
Чувствительность к тяжелым металлам, вызванная ингибированием генов kreg . eri-1 мутантных животных культивировали в эмбриогенезе на нормальных чашках, содержащих сульфат меди (100 мкМ), и засевали штаммами бактерий, экспрессирующих указанную двухцепочечную РНК.Процент червей, достигших зрелости через 4 дня после откладки яиц, показан со стандартными ошибками. Планки погрешностей указывают 95% доверительный интервал. ** P <0,01 согласно тесту Стьюдента t . NS, не имеет значения.
https://doi.org/10.1371/journal.pgen.1003315.s005
(TIF)
Рисунок S6.
FOS-1 репрессирует экспрессию kreg . Животных дикого типа и мутантных животных kgb-1 культивировали на чашках, засеянных штаммом бактерий, экспрессирующих двухцепочечную РНК для fos-1 .Выделяли тотальную РНК и анализировали экспрессию kreg-1 (A) и kreg-2 (B) с помощью qRT-PCR. Данные сравниваются с использованием одностороннего дисперсионного анализа. ** P <0,01.
https://doi.org/10.1371/journal.pgen.1003315.s006
(TIF)
Рисунок S7.
Экспрессия mek-1 в кишечнике определяет устойчивость к стрессу тяжелых металлов. Каждое животное культивировали из эмбриогенеза на нормальных чашках, содержащих сульфат меди (100 мкМ). Относительная жизнеспособность показана со стандартными ошибками.Планки погрешностей указывают 95% доверительный интервал. ** P <0,01 согласно тесту Стьюдента t .
https://doi.org/10.1371/journal.pgen.1003315.s007
(TIF)
Рисунок S8.
Воздействие JUN-1 и ATF-7 на путь КГБ-1. (A) Влияние JUN-1 и ATF-7 на экспрессию kreg-1 . Животных дикого типа, несущих трансген Pkreg-1 :: venus в качестве внехромосомного массива, культивировали на чашках, засеянных штаммом бактерий, экспрессирующих двухцепочечную РНК для fos-1 , jun-1 или atf- 7 .«Слабый» относится к животным, у которых в кишечнике Венера присутствовала в низких количествах. «Сильный» означает, что Венера присутствовала в больших количествах в большей части кишечника. Перечислено процентное содержание животных в каждой категории экспрессии. Показано количество (n) исследованных животных. (B) Влияние JUN-1 на чувствительность к тяжелым металлам. Каждое животное культивировали из эмбриогенеза на нормальных чашках, содержащих сульфат меди (40 мкМ), и засевали штаммом бактерий, экспрессирующим двухцепочечную РНК для jun-1 .Процент червей, достигших зрелости через 4 дня после откладки яиц, показан со стандартными ошибками. Планки погрешностей указывают 95% доверительный интервал. ** P <0,01 согласно тесту Стьюдента t . NS, не имеет значения. (C) Влияние ATF-7 на чувствительность к тяжелым металлам. Каждое животное культивировали из эмбриогенеза на нормальных чашках, содержащих сульфат меди (40 мкМ). Процент червей, достигших зрелости через 4 дня после откладки яиц, показан со стандартными ошибками.
https://doi.org/10.1371 / journal.pgen.1003315.s008
(TIF)
Рисунок S9.
Влияние истощения hda-1 на экспрессию генов kreg-1 и kreg-2 . Животных дикого типа и мутантных животных kgb-1 культивировали на чашках, засеянных штаммом бактерий, экспрессирующих двухцепочечную РНК для hda-1 . Выделяли тотальную РНК и анализировали экспрессию kreg-1 (A) и kreg-2 (B) с помощью qRT-PCR. Данные сравниваются с использованием одностороннего дисперсионного анализа.** P <0,01.
https://doi.org/10.1371/journal.pgen.1003315.s009
(TIF)
Таблица S1.
Список взаимодействующих с KGB-1 белков, выделенных двугибридным скринингом дрожжей. Библиотека кДНК смешанной стадии C. elegans была подвергнута скринингу дрожжевым двугибридным методом для выделения белков, которые взаимодействуют с KGB-1. На этом экране мы идентифицировали 10 белков, которые взаимодействуют с KGB-1.
https://doi.org/10.1371/journal.pgen.1003315.s010
(XLS)
Таблица S2.
Сравнение уровней экспрессии транскриптов между животными дикого типа с обработкой Cu 2+ или без нее. Был проведен анализ микроматрицы для изучения изменений экспрессии генов у животных дикого типа, подвергшихся стрессу тяжелых металлов. Уровни экспрессии транскриптов сравнивали у животных дикого типа с обработкой Cu 2+ или без нее.
https://doi.org/10.1371/journal.pgen.1003315.s011
(XLSX)
Таблица S3.
Сравнение уровней экспрессии транскриптов у мутантных животных kgb-1 с обработкой Cu 2+ или без нее.Для изучения изменений экспрессии генов у мутантных животных kgb-1 , подвергшихся стрессу тяжелых металлов, был проведен анализ микроматрицы. Уровни экспрессии транскрипта сравнивали у мутантных животных kgb-1 с обработкой Cu 2+ или без нее.
https://doi.org/10.1371/journal.pgen.1003315.s012
(XLSX)
Таблица S4.
Список генов, которые активируются Cu 2+ у животных дикого типа. Анализ микроматрицы проводили для изучения изменений экспрессии генов у животных дикого типа и мутантных животных kgb-1 , подвергшихся стрессу тяжелых металлов.Было выбрано 334 гена, которые более чем в 2 раза активировались Cu 2+ у животных дикого типа.
https://doi.org/10.1371/journal.pgen.1003315.s013
(XLSX)
Таблица S5.
Список генов, индукция которых с помощью Cu 2+ у мутантов kgb-1 была <50% индукции, наблюдаемой у животных дикого типа. Среди 334 генов, перечисленных в таблице S4, мы идентифицировали 66 генов, индукция которых с помощью Cu 2+ у мутантов kgb-1 была <50% индукции, наблюдаемой у животных дикого типа.
https://doi.org/10.1371/journal.pgen.1003315.s014
(XLSX)
Таблица S6.
Список генов, базальная экспрессия которых была снижена или не изменена у мутантов kgb-1 по сравнению с животными дикого типа. Среди 66 генов, перечисленных в Таблице S5, мы идентифицировали 50 генов, базальная экспрессия которых была снижена или не изменена у мутантов kgb-1 по сравнению с животными дикого типа.
https://doi.org/10.1371/journal.pgen.1003315.s015
(XLSX)
Таблица S7.
Список из тринадцати основных генов, экспрессия которых в значительной степени индуцировалась Cu 2+ у животных дикого типа. Среди 50 генов, перечисленных в Таблице S6, мы вручную удалили гены, экспрессия которых больше не прогнозируется, и отобрали 13 лучших генов, экспрессия которых была значительно индуцирована Cu 2+ у животных дикого типа.
https://doi.org/10.1371/journal.pgen.1003315.s016
(XLSX)
Важные термины и фразы, встречающиеся в КРАСНЫЕ ФАЙЛЫ объясняются ниже.
|
Байден санкционирует Белый дом против России: NPR
Активист российской оппозиции Алексей Навальный во время заседания суда в Москве в прошлом месяце.Навальный, отравленный в прошлом году, был заключен в тюрьму в России по возвращении из Германии. Мосгорсуд / ТАСС через Getty Images скрыть подпись
переключить подпись Мосгорсуд / ТАСС через Getty ImagesАктивист российской оппозиции Алексей Навальный во время судебного заседания в Москве в прошлом месяце.Навальный, отравленный в прошлом году, был заключен в тюрьму в России по возвращении из Германии.
Мосгорсуд / ТАСС через Getty ImagesОбновлено в 13:15 ET
Администрация Байдена, сигнализируя о более жесткой позиции в отношении России, чем при Белом доме Трампа, объявила во вторник новые санкции против семи высокопоставленных кремлевских чиновников в ответ на прошлогоднее отравление лидера оппозиции Алексея Навального.
Старшие должностные лица администрации, разговаривая с журналистами по телеконференции, заявили, что санкции также включают экспортный контроль в отношении 14 сторон — девяти российских, трех немецких и одного швейцарского, а также трех российских государственных научно-исследовательских институтов, большинство из которых, как полагают, причастны к производство химических и биологических агентов.
Позже Министерство финансов опубликовало список лиц, подпадающих под санкции. Это: Александр Бортинков, директор Федеральной службы безопасности России, или ФСБ, основного преемника КГБ; Александр Калашников, директор ФСИН России; Сергей Кириенко, заместитель главы администрации президента России Владимира Путина и бывший премьер-министр; Генеральный прокурор России Игорь Краснов; заместители министра обороны полковникГенерал Алексей Криворучко и генерал армии Павел Попов; и Андрей Ярин, директор Управления президента России по внутренней политике.
Минфин также объявил о санкциях в отношении ФСБ и ГРУ, российской военной разведки.
В своем заявлении госсекретарь Энтони Блинкен заявил, что действия были предприняты «для того, чтобы дать четкий сигнал о том, что применение Россией химического оружия и нарушение прав человека имеют серьезные последствия. Любое применение химического оружия неприемлемо и противоречит международным нормам.»
Официальные лица США заявили, что эти действия согласовывались с Европейским союзом, хотя правозащитники ранее критиковали ЕС за то, что он не нацелился на наиболее важных российских чиновников, предположительно причастных к этому. Во вторник ЕС объявил о новых санкциях против высокопоставленных российских чиновников. нападение и преследование Навального, самого известного политического врага Путина.
«Мы во многом догоняем ЕС и Великобританию», — сказал один из официальных лиц США, отметив, что европейские официальные лица объявили о некоторых из своих санкций Октября и добавляем к этим санкциям во вторник.
В ходе телефонной конференции во вторник официальные лица также объявили, что оценка американской разведки с «высокой степенью уверенности» пришла к выводу, что российские разведчики «использовали нервно-паралитическое вещество, известное как Новичок, для отравления лидера российской оппозиции Алексея Навального 20 августа 2020 года».
Выступая на пресс-конференции в Женеве в понедельник, специальные докладчики Организации Объединенных Наций Агнес Калламар и Ирен Хан заявили, что они пришли к такому же выводу о том, что «Россия несет ответственность за попытку произвольного убийства г-на Ф.Навальный »
Кремль отрицает свою причастность к нападению на Навального, но токсикологические тесты в Германии, где лидер оппозиции проходил лечение, определили, что это вещество — новичок советской эпохи, который, по мнению большинства экспертов, можно было получить только через государственного деятеля.
Представители администрации также отметили, что Россия использовала Новичок в попытке убийства Сергея Скрипаля, бывшего офицера российской разведки, совершенного в США в 2018 году.K.
По возвращении в Россию после лечения в Германии 44-летний Навальный был немедленно арестован и позже приговорен к двум годам колонии строгого режима. В последние недели тысячи протестующих в России были арестованы после того, как публично заявили о своей поддержке Навального.
На брифинге во вторник представители администрации Байдена повторили призыв к освобождению Навального. В прошлом месяце Европейский суд по правам человека сделал аналогичное заявление, но Кремль отказал ему.
Последние санкции Белого дома призваны сигнализировать о более жесткой линии в отношении России. Администрация Трампа отказалась принимать меры против России после нападения на Навального, которое высокопоставленные чиновники администрации Байдена назвали покушением на убийство.
«Тон и тема нашего разговора с Россией и наших разговоров о России будут сильно отличаться от того, что вы видели в предыдущей администрации», — сказал один чиновник.
Администрация Байдена планировала дальнейшие шаги в ответ на то, что официальные лица назвали «рядом дестабилизирующих действий» со стороны России.
Согласно искам, имущество, принадлежащее лицам, подпадающим под санкции, может быть конфисковано США, и гражданам США запрещено вести с ними дела. Практические последствия санкций ограничены: у семи российских чиновников практически нет финансовых интересов в Соединенных Штатах.
Отравление Навального — одна из четырех областей напряженности между США и Россией, которые администрация Байдена изучает с момента вступления в должность в январе.Официальные лица заявили, что ответ на кибер-хакерскую атаку SolarWinds, предположительно российского происхождения, также находится в стадии рассмотрения, и объявление ожидается в течение нескольких недель.
«Соединенные Штаты не стремятся перезагрузить наши отношения с Россией, и мы не стремимся к их эскалации», — сказал журналистам один из официальных лиц, отметив, что администрация Байдена готова работать с Россией в областях, которые являются взаимовыгодными, такими как как о пятилетнем продлении нового договора СНВ по ядерному оружию, о котором было объявлено в январе после его приостановки администрацией Трампа.
«Мы ожидаем, что эти отношения станут проблемой, и мы готовы к этому», — сказал чиновник. «Учитывая поведение России в последние месяцы, несомненно, будут противоборствующие элементы, и мы не будем уклоняться от них».
Администрация Обамы ввела санкции в отношении Москвы за ее вмешательство в президентские выборы 2016 года, выслав из страны десятки российских дипломатов.
Но бывший президент Дональд Трамп в целом относился к России мягче.Он неоднократно отрицал доказательства американских спецслужб, которые подтверждали российские взломы на выборах. Трамп также преуменьшил значение атаки SolarWinds, несмотря на то, что его госсекретарь Майк Помпео назвал ее «очень значительным усилием».
Зависящее от возраста изменение защитных способностей передачи сигналов JNK сокращает продолжительность жизни Caenorhabditis elegans.
Зависящее от возраста изменение защитных способностей передачи сигналов JNK сокращает продолжительность жизни Caenorhabditis elegans.
Твумази-Боатенг К., Wang T.W., Tsai L., Lee K.H., Salehpour A., Bhat S., Tan M.W., Shapira M.
Пути стресс-активируемой протеинкиназы (SAPK) представляют собой эволюционно законсервированные сигнальные модули, которые организуют защитные реакции на неблагоприятные условия окружающей среды. Однако при определенных условиях их активация может быть вредной. Таким образом, активация пути SAPK с-Jun N-терминальной киназы (JNK) обостряет ряд разнообразных патологий, многие из которых типичны для пожилого возраста. Контексты, определяющие, является ли результат передачи сигналов JNK защитным или пагубным, до конца не изучены.Здесь мы показываем, что возраст животного определяет такой контекст. Гомолог JNK Caenorhabditis elegans, KGB-1, обеспечивает защиту от тяжелых металлов и стресса сворачивания белков у развивающихся животных. Однако мы обнаружили, что с наступлением зрелого возраста деятельность КГБ-1 становится пагубной, снижая стрессоустойчивость и продолжительность жизни. Генетический анализ в сочетании с флуоресцентной визуализацией связывает этот фенотипический переключатель с возрастной антагонистической модуляцией DAF-16 / FOXO: активация KGB-1 усиливает ядерную локализацию DAF-16 и транскрипционную активность во время развития, но снижает ее у взрослых.Анализ эпистаза показал, что DAF-16 был необходим и достаточен для объяснения некоторых, но не всех, вредных фенотипов, зависимых от kgb-1. Идентификация раннего взросления как точки, после которой вклад активности KGB-1 меняется с положительного на вредный, проливает новый свет на участие передачи сигналов JNK в возрастных патологиях. Более того, возрастная зависимость от обратного развития имеет интригующие последствия для нашего понимания старения.
Ячейка старения 11: 659-667 (2012) [PubMed] [Europe PMC]
--- количество: 29638 Страница 1 запрос: y104h22d.1? Inline = 1 & разновидности = meeting_abstract полученные результаты: - автор: - класс: автор id: Ло, Юнь-Хуа этикетка: Ло, Юнь-Хуа - класс: автор id: Чанг, Тиффани этикетка: Чанг, Тиффани - класс: автор id: Сюй, Юнг-Чен этикетка: Hsu, Jung-Chen - класс: автор id: Ян, Фанг-Юнг этикетка: Ян, Фанг-Юнг - класс: автор id: Ле, Сон Тхо этикетка: Le, Son Tho - класс: автор id: Ван, Джон label: Ван, Джон описание: Большинство половых видов дают примерно равное соотношение полов в потомстве.У нематод отклонения от равного соотношения полов возникают у самоплодотворяющих видов-гермафродитов, которые несколько раз эволюционировали независимо друг от друга. Гермафродиты производят потомство преимущественно гермафродитов, в то время как сыновья наблюдаются редко, что соответствует высокой теоретической стоимости потомства мужского пола у этих видов. В роду Caenorhabditis три известных вида гермафродитов также иногда производят самцов. Когда скрещивание происходит у C. elegans, соотношение потомков самок и самцов составляет ~ 1: 1, как и у большинства половых видов.Напротив, предыдущее исследование показало, что у C. briggsae соотношение полов у C. briggsae смещено в сторону женщин (~ 2: 1), что, возможно, вызвано конкуренцией между мужской X- и O-несущей спермой. эволюционировали из-за вероятных преимуществ для отцов, которые производят больше дочерей, поскольку одинокий гермафродит, но не сын, может создать популяцию. В качестве альтернативы, другие условия, такие как местная конкуренция самцов, могут быть выбраны для предвзятого отношения к женщинам. В первой модели только виды-гермафродиты должны иметь смещенные по самкам соотношения полов, в то время как во второй, самки / самцы могут иметь смещенные по самкам соотношения полов.Чтобы проверить эти две возможности, мы провели эксперименты по скрещиванию с третьим видом гермафродитов, C. tropicalis, а также с 12 видами самок / самцов. Мы обнаружили, что C. tropicalis дает соотношение полов в потомстве ~ 1: 1. Для особей женского / мужского пола пять показали соотношение полов примерно 1: 1, а семь других дали соотношение полов, предвзятое самками. Эти результаты предполагают, что факторы, отличные от гермафродитизма (или в дополнение к нему), были отобраны для эволюции предвзятого отношениями полов в этой кладе. журнал: International Worm Meeting этикетка: Ло, Юн-Хуа и др.(2015) Международная конференция по червям «Предвзятость отношения полов в Caenorhabditis». название: класс: бумага выделять: description_all: - У большинства половых видов соотношение полов в потомстве примерно одинаковое. - Когда скрещивание происходит у C. elegans, соотношение потомков самок и самцов составляет ~ 1 : 1 , как и у большинства половых видов - ", C. tropicalis, а также 12 самок / самцов видов ." - Мы обнаружили, что C. tropicalis дает соотношение полов в потомстве ~ 1 : 1 . - Для разновидностей самка / самец пять показали соотношение ~ 1 : 1 , в то время как семь других дали пол с предвзятым отношением к самкам. id: WBPaper00048143 этикетка: Ло, Юн-Хуа и др. (2015) Международная конференция по червям «Предвзятость отношения полов в Caenorhabditis». other_names: ~ таксономия: ~ other_unique_ids: - wm2015ab782 page_type: paper тип бумаги: - meeting_abstract таксономия: ~ wbid: WBPaper00048143 год: 2015 - автор: - класс: человек id: WBPerson172 этикетка: Felix MA - класс: человек id: WBPerson132 этикетка: Delattre M описание: «Сравнение родственных видов часто позволяет провести подробный генетический анализ эволюционных процессов.Здесь мы выступаем за использование нематоды Caenorhabditis elegans (и нескольких других видов рабдитид) в качестве модельных систем для микроэволюционных исследований. По сравнению с видами Drosophila, которые были основой таких исследований, C. elegans имеет способ размножения с самооплодотворением, более короткий жизненный цикл и удобный анализ фенотипической изменчивости на уровне клеток. Однако данных о популяционной генетике и экологии пока мало. Мы рассматриваем молекулярные, поведенческие и внутривидовые полиморфизмы развития популяций C.elegans, Oscheius sp. 1 и Pristionchus pacificus. Сосредоточившись на развитии вульвы, которое было хорошо охарактеризовано у нескольких видов, мы обсуждаем взаимосвязь между паттернами вариаций: (1) для данного генотипа (варианты развития), (2) после мутагенеза (изменчивость), (3) в разных популяциях один и тот же вид (полиморфизм) и (4) между близкородственными видами. Эти исследования показали, что эволюционные вариации между родственными видами влияют на те признаки, которые демонстрируют фенотипические варианты развития, которые являются мутабельными и полиморфными внутри вида." журнал: Bioessays этикетка: "Delattre M et al. (2001) Bioessays \" Микроэволюционные исследования нематод: начало. \ "" название: класс: бумага выделять: description_all: - Сравнение родственных видов часто позволяет провести подробный генетический анализ эволюционных процессов. - Здесь мы выступаем за использование нематоды Caenorhabditis elegans (и некоторых других видов рабдитид). - внутривидовые полиморфизмы поведения и развития популяций C.elegans, Oscheius sp. 1 - «между моделями вариаций: ( 1 ) для данного генотипа (варианты развития), (2) после мутагенеза» - родственные виды . id: WBPaper00004844 этикетка: "Delattre M et al. (2001) Bioessays \" Микроэволюционные исследования нематод: начало. \ "" other_names: ~ таксономия: ~ other_unique_ids: - 10.1002 / bies.1116 - cgc4844 page_type: paper тип бумаги: - рассмотрение таксономия: ~ wbid: WBPaper00004844 год: 2001 - автор: - класс: человек id: WBPerson3620 этикетка: Lee SJ - класс: человек id: WBPerson10123 этикетка: Hwang AB описание: Незначительное снижение митохондриального дыхания продлевает продолжительность жизни многих видов, в том числе C.elegans. Недавно мы показали, что индуцируемый гипоксией фактор 1 (HIF-1) необходим для приобретения большой продолжительности жизни мутантами со сниженным дыханием у C. elegans. Мы предположили, что повышенные уровни активных форм кислорода (АФК), продуцируемые мутантами дыхания, увеличивают активность HIF-1 и приводят к такому долголетию. В этой исследовательской перспективе мы обсуждаем наши выводы и недавние достижения в отношении роли ROS и HIF-1 в старении, уделяя особое внимание долголетию, вызванному пониженным дыханием.журнал: Aging (Олбани, штат Нью-Йорк) этикетка: "Hwang AB et al. (2011) Aging (Albany NY) \" Регулирование продолжительности жизни митохондриальным дыханием: связь HIF-1 и ROS. \ "" название: класс: бумага выделять: description_all: - Незначительное снижение митохондриального дыхания увеличивает продолжительность жизни многих видов , включая C. elegans. - Недавно мы показали, что индуцируемый гипоксией фактор 1 (HIF- 1 ) необходим для получения длительного - Мы предположили, что повышенный уровень активных форм кислорода разновидностей (АФК), продуцируемых мутантами дыхания. - увеличить активность HIF- 1 и привести к этому долголетию.- перспектива исследования, мы обсуждаем наши выводы и последние достижения в отношении роли ROS и HIF- 1 id: WBPaper00038219 этикетка: "Hwang AB et al. (2011) Aging (Albany NY) \" Регулирование продолжительности жизни митохондриальным дыханием: связь HIF-1 и ROS. \ "" other_names: ~ таксономия: ~ other_unique_ids: ~ page_type: paper тип бумаги: - рассмотрение таксономия: ~ wbid: WBPaper00038219 год: 2011 - автор: - класс: человек id: WBPerson10169 этикетка: Kroetz MB - класс: человек id: WBPerson49340 этикетка: Heaton A - класс: человек id: WBPerson49344 этикетка: Glaberman S - класс: человек id: WBPerson49342 этикетка: Milligan E - класс: человек id: WBPerson49343 этикетка: Weir S - класс: человек id: WBPerson49341 этикетка: Faulconer E описание: «Проведение испытаний на токсичность на нескольких видах с разной степенью эволюционного родства может предоставить важную информацию о том, как химическая чувствительность варьируется между видами, и может помочь точно определить биологические факторы чувствительности видов.Такие знания в конечном итоге могут быть использованы для разработки более совершенных моделей прогнозной оценки экологического риска для нескольких видов и выявления особо уязвимых видов. Однако лабораторные тесты на токсичность с участием нескольких видов также могут быть ресурсоемкими, особенно когда каждый вид имеет уникальные условия содержания. Здесь мы проводим тесты на летальность с двумя металлами, хлоридом меди и хлоридом цинка, на пяти различных видах нематод, которые имеют гнездо по степени эволюционного родства: Caenorhabditis briggsae, Caenorhabditis elegans, Oscheius myriophila, Oscheius tipulae и Pristionchus pacificus.Все виды были успешно культивированы и протестированы одновременно с ограниченными ресурсами, демонстрируя, что недорогие, многовидовые системы тестирования токсичности нематод достижимы. Результаты показывают, что P. pacificus наиболее чувствителен к обоим металлам. Напротив, C. elegans был наименее чувствительным видом к меди, но вторым по чувствительности к цинку, что указывает на то, что видовые отношения не обязательно предсказывают чувствительность видов. Испытание на токсичность с дополнительными видами нематод и типами химикатов возможно и поможет сформировать более обобщенные выводы об относительной чувствительности видов.Эта статья защищена авторским правом. Все права защищены." журнал: Environ Toxicol Chem этикетка: Heaton A et al. (2020) Environ Toxicol Chem «Межвидовые различия в ответах нематод на металлы». название: класс: бумага выделять: description_all: - биологические факторы чувствительности видов . - моделировать и определять особо уязвимые виды . - когда каждый вид имеет уникальные условия содержания.- ", что указывает на то, что отношения видов не обязательно предсказывают чувствительность видов ". - более обобщенные выводы об относительной чувствительности видов . id: WBPaper00059307 этикетка: Heaton A et al. (2020) Environ Toxicol Chem «Межвидовые различия в ответах нематод на металлы». other_names: ~ таксономия: ~ other_unique_ids: - 10.1002 / и др. 4689 page_type: paper тип бумаги: - Журнальная статья таксономия: ~ wbid: WBPaper00059307 год: 2020 - автор: - класс: автор id: Anderson RV этикетка: Anderson RV - класс: автор id: Коулман, округ Колумбия этикетка: Coleman DC описание: Оптимальные температуры для развития популяции были определены для шести видов нематод, питающихся бактериями, из восьми из восьми температур в диапазоне от 5 до 40 C.Четыре вида - сожительствующие виды. Диапазон температур, в которых происходит развитие популяций (ширина температурной ниши), у сожительствующих видов различен. Это различие может быть средством уменьшения конкуренции между видами, тем самым повышая температуры, при которых можно эксплуатировать среду обитания. журнал: Journal of Nematology этикетка: "Anderson RV et al. (1982) Journal of Nematology \" Температурные реакции нематод: измерение ниши в популяциях нематод, питающихся бактериями.\ "" название: класс: бумага выделять: description_all: - Оптимальные температуры для развития популяции определены для шести видов кормящихся бактериями. - Четыре из разновидностей живут вместе разновидностями . - характер развития популяции (ширина температурной ниши) различен для сожительствующих видов - Эта разница может быть средством уменьшения конкуренции между видами , что приводит к повышению температуры. id: WBPaper00000844 этикетка: "Anderson RV et al.(1982) Journal of Nematology \ "Температурные реакции нематод: измерение ниши в популяциях нематод, питающихся бактериями \" ". other_names: ~ таксономия: ~ other_unique_ids: - cgc844 page_type: paper тип бумаги: - Журнальная статья таксономия: ~ wbid: WBPaper00000844 год: 1982 - автор: - класс: автор id: Van Beeumen JJ этикетка: Van Beeumen JJ - класс: человек id: WBPerson1540 этикетка: Vanfleteren JR - класс: автор id: Van Bun SM этикетка: Van Bun SM описание: нематода Caenorhabditis elegans экспрессирует один вид h3A и один вид молекул h5, по крайней мере два вида h2 (h2.1, h2.2), два вида h3B (h3B.1, h3B.2) и 2-4 вида h4 (h4.1 и h4.3 и неназначенная микрогетерогенность Ile / Leu в h4). К настоящему времени исследование их первичных структур завершено, и все они, за исключением микрогетерогенности Ile / Leu в h4, были отнесены к белковым пятнам на двумерных гелях. Одно пятно, ранее обозначенное как h4.2, вероятно, представляет собой расщепленный на С-конце h4.1. Относительное содержание изогистонов было практически одинаковым, если они были получены из яиц, беременных взрослых особей или пострепродуктивных стареющих червей.Однако степень посттрансляционной модификации, особенно ацетилирования гистонов h3A, h3B и h4, снижалась в пожилом возрасте. журнал: FEBS Lett этикетка: "Vanfleteren JR et al. (1989) FEBS Lett \" Гистоны Caenorhabditis elegans: нет доказательств наличия изоформ, специфичных для стадии. Обзор.\"" название: класс: бумага выделять: description_all: - Нематода Caenorhabditis elegans экспрессирует один вид h3A и один вид молекул h5, при - минимум два вида h2 (h2.1, h2.2), два вида h3B (h3B. 1 , h3B.2) и 2-4 вида h4 (h4 .1 и - степень посттрансляционной модификации, однако, особенно ацетилирования гистонов h3A, h3B и h4 видов id: WBPaper00001214 этикетка: "Vanfleteren JR et al. (1989) FEBS Lett \" Гистоны Caenorhabditis elegans: нет доказательств наличия изоформ, специфичных для стадии. Обзор.\"" other_names: ~ таксономия: ~ other_unique_ids: - cgc1214 - 10.1016 / 0014-5793 (89) 81541-8 page_type: paper тип бумаги: - Журнальная статья таксономия: ~ wbid: WBPaper00001214 год: 1989 - автор: - класс: человек id: WBPerson1826 этикетка: Бернард Лаковски описание: Благодаря многочисленным проектам EST и генома для различных видов нематод, теперь существует огромное количество информации об эволюции генов у нематод, если кто-то знает, где искать. Из итеративных раундов бласт-поиска, множественного выравнивания последовательностей и филогенетического анализа можно частично предсказать последовательность гомологов многих C.elegans даже у очень разных видов нематод. Я проделал это для ряда генов, которые нас интересуют в лаборатории, и получил некоторые удивительные результаты. Например, у C. elegans есть три гена семейства пресенилинов: sel-12, hop-1 и spe-4. Гены sel-12 и hop-1 играют частично повторяющуюся роль в регуляции передачи сигналов lin-12 и glp-1, в то время как spe-4 требуется специально для сперматогенеза. Хотя пресенилины присутствуют во всех растениях и животных, HOP-1 и SPE-4 являются наиболее разными из известных пресенилинов.Удивительно, но наиболее дивергентный ген пресенилина spe-4 хорошо сохраняется в широком диапазоне видов нематод, что свидетельствует о древнем происхождении этого семейства генов. Однако филогенетический анализ показывает, что, хотя гены хмеля-1 сильно консервативны, они обнаруживаются только у видов Caenorhabditis. У других видов нематод гены пресенилина гораздо более близки к пресенилинам насекомых и позвоночных. Мы также рассмотрели эволюцию супрессоров генов пресенилина (spr).Этот анализ показывает, что некоторые гены spr имеют очень недавнее происхождение, некоторые присутствуют только у нематод, а другие более древние. Наконец, филогенетический анализ генов кутикулина C. elegans предполагает, что многие разрезанные гены имеют явные гомологи у множества видов, включая вид клады I Trichanella sprialis, что позволяет предположить, что эти семейства генов присутствовали у самых ранних предковых видов нематод. журнал: International Worm Meeting этикетка: Бернард Лаковски (2007) Международная встреча по червям "Анализ данных об эволюции генов в других проектах генома нематод." название: класс: бумага выделять: description_all: - Например, у C. elegans есть три гена семейства пресенилинов: sel-12, hop- 1 и spe-4. сел - -12 и гены hop- 1 играют частично повторяющуюся роль в регуляции передачи сигналов lin-12 и glp- 1 , в то время как spe - Хотя пресенилины присутствуют во всех растениях и животных, HOP- 1 и SPE-4 являются самыми разными - встречается у разновидностей Caenorhabditis.- у древнейших предковых нематод видов . id: WBPaper00029734 этикетка: Бернард Лаковски (2007) Международная встреча по червям «Сбор данных об эволюции генов в других проектах генома нематод». other_names: ~ таксономия: ~ other_unique_ids: - wm2007ab1258 page_type: paper тип бумаги: - meeting_abstract таксономия: ~ wbid: WBPaper00029734 год: 2007 - автор: - класс: человек id: WBPerson1712 этикетка: Cutter AD - класс: человек id: WBPerson172 этикетка: Felix MA - класс: человек id: WBPerson3263 этикетка: Braendle C описание: Быстрые темпы открытия видов опережают скорость описания видов во многих таксонах.Эта проблема особенно остро стоит в отношении нематод Caenorhabditis, где обозначение отдельных видов значительно улучшило бы их видимость и использование для биологических исследований, учитывая тысячи ученых, изучающих Caenorhabditis. Описание и наименование видов у Caenorhabditis затруднено, отчасти из-за присутствия морфологически загадочных видов, несмотря на полную биологическую репродуктивную изоляцию и часто огромную молекулярную дивергенцию. С целью ускорения определения видов здесь мы предлагаем и применяем пересмотренную схему диагностики и описания видов в этой группе.Наше решение ставит репродуктивную изоляцию в приоритет над традиционными морфологическими признаками как ключевую особенность в определении и диагностике новых видов, что отражает как практические соображения, так и концептуальное обоснование. Критерии дивергенции последовательности ДНК помогают определить приоритет скрещиваний для установления паттернов репродуктивной изоляции среди многих известных науке видов Caenorhabditis, таких как штрих-код ДНК с внутренним транскрибированным рибосомным спейсером-2 (ITS2). Применяя этот подход, мы предоставляем новые обозначения названий видов для 15 различных биологических видов, тем самым увеличивая количество названных видов Caenorhabditis в лабораторной культуре почти в 3 раза.Мы ожидаем, что улучшенная доступность этих видов для исследовательского сообщества расширит возможности для изучения и ускорит наше понимание разнообразных биологических явлений. журнал: PLoS One этикетка: "Felix MA et al. (2014) PLoS One \" Оптимизированная система для диагностики видов Caenorhabditis (Nematoda: Rhabditidae) с обозначениями названий для 15 различных биологических видов \ "". название: класс: бумага выделять: description_all: - Быстрые темпы открытия видов опережают скорость описания видов для многих таксонов.- Эта проблема особенно остро стоит в отношении нематод Caenorhabditis, где наименование отдельных видов может - С целью ускорения определения видов здесь мы предлагаем и применяем пересмотренную схему для видов - Принимая этот подход, мы даем новые названия видов для 15 различных биологических видов . - ", что увеличивает количество названных видов Caenorhabditis в лабораторной культуре почти в 3 раза." id: WBPaper00045155 этикетка: "Felix MA et al. (2014) PLoS One \" Оптимизированная система для диагностики видов Caenorhabditis (Nematoda: Rhabditidae) с обозначениями названий для 15 различных биологических видов \ "". other_names: ~ таксономия: ~ other_unique_ids: - 10.1371 / journal.pone.0094723 page_type: paper тип бумаги: - Журнальная статья таксономия: ~ wbid: WBPaper00045155 год: 2014 - автор: - класс: человек id: WBPerson606 этикетка: Ralf J.Sommer - класс: человек id: WBPerson7152 лейбл: Робби Рэй описание: Нематоды из рода Pristionchus живут в тесной ассоциации с рядом видов жуков. Например, Pristionchus pacificus обитают на восточных жуках, Pristionchus maupasi - на жуках-жуках, а Pristionchus entomophagus - на навозных жуках. Мы исследовали возможность того, что Pristionchus может иметь тесную связь с бактериями, присутствующими внутри каждого вида жуков. Мы выделили пять распространенных видов бактерий (виды Pseudomonas и Bacillus) от личинок Pristionchus dauer и протестировали хемотаксический ответ P.pacificus (штаммы Калифорния и Вашингтон), P. maupasi и P. entomophagus к этим бактериям. Нематод также подвергали воздействию бактерий для оценки размера расплода и патогенности. В анализах хемотаксиса все виды Pristionchus положительно ответили на три вида Pseudomonas, но были плохо привлечены к двум видам Bacillus. В экспериментах по размеру выводка нематоды производили меньше яиц у видов Bacillus, чем у трех видов Pseudomonas. Ни одна из пяти бактерий не вызвала гибель видов Pristionchus.В отдельном эксперименте мы собрали навозных жуков и жуков и провели крупномасштабное секвенирование видов бактерий, присутствующих внутри. Наша главная цель - выяснить отношения, которые виды Pristionchus могут иметь с бактериями и связанными с ними жуками. Будут представлены бактериальные библиотеки, выделенные от каждого вида жуков. журнал: International Worm Meeting этикетка: Робби Рэй и др. (2007) Международная встреча по червям «Тритрофические взаимодействия видов Pristionchus». название: класс: бумага выделять: description_all: - Мы выделили пять распространенных бактериальных видов (Pseudomonas и Bacillus разновидности ) из Pristionchus dauer. - В анализах хемотаксиса все виды Pristionchus положительно ответили на три вида Pseudomonas. - но их мало привлекали два вида Bacillus .- виды . - Ни одна из пяти бактерий не вызвала гибель вида Pristionchus. id: WBPaper00030054 этикетка: Робби Рэй и др. (2007) Международная встреча по червям «Тритрофические взаимодействия видов Pristionchus». other_names: ~ таксономия: ~ other_unique_ids: - wm2007ab395 page_type: paper тип бумаги: - meeting_abstract таксономия: ~ wbid: WBPaper00030054 год: 2007 - автор: - класс: человек id: WBPerson6897 этикетка: Mizuno, Tomoaki - класс: человек id: WBPerson10112 этикетка: Хаттори, Аюна - класс: человек id: WBPerson1068 этикетка: Хисамото, Наоки - класс: человек id: WBPerson1315 этикетка: Мацумото, Кунихиро описание: Путь киназы JNK MAP (MAPK) играет ключевую роль в различных стрессовых реакциях эволюционно различных видов.У C. elegans JNK-подобный путь MAPK, состоящий из MLK-1 MAPKKK, MEK-1 MAPKK и KGB-1 MAPK, контролирует стрессовую реакцию. Ранее мы обнаружили, что KGB-1 негативно регулирует FOS-1, фактор транскрипции bZIP, гомологичный человеческому Fos, посредством его фосфорилирования FOS-1 в ответ на стресс тяжелыми металлами. Однако нижележащая цель FOS-1 не была идентифицирована. Чтобы идентифицировать гены, экспрессия которых регулируется путем KGB-1, мы выполнили анализ ДНК-микрочипов, и результаты были подтверждены количественной ПЦР.Мы идентифицировали три гена kreg (регулируемый KGB-1 ген), kreg-1 ~ 3, экспрессия которых индуцировалась медью KGB-1-зависимым образом. Кроме того, их индукция была увеличена у животных с нокдауном fos-1. Нокдаун Крег-1 ~ 3 вызвал частичную чувствительность к тяжелым металлам. Взятые вместе, эти данные предполагают, что KGB-1 индуцирует экспрессию генов, включая kreg-1 ~ 3, путем негативной регуляции FOS-1 в ответ на стресс тяжелыми металлами. журнал: International Worm Meeting этикетка: Hattori, Ayuna et al.(2011) Международная конференция по червям «Сигнальный путь KGB-1 JNK негативно регулирует фактор транскрипции FOS-1 при стрессовой реакции». название: класс: бумага выделять: description_all: - киназный (MAPK) путь играет ключевую роль в различных ответах на стресс эволюционно различных видов - В C. elegans путь MAPK, подобный JNK, состоит из MLK- 1 MAPKKK, MEK- 1 MAPKK и KGB- 1 MAPK. контроль - Ранее мы обнаружили, что KGB- 1 негативно регулирует FOS- 1 , фактор транскрипции bZIP, гомологичный - Мы идентифицировали три гена kreg (регулируемый ген KGB- 1 ), kreg- 1 ~ 3, экспрессия которых индуцировалась медью - в зависимости от КГБ 1 .id: WBPaper00038947 этикетка: Hattori, Ayuna et al. (2011) Международная конференция по червям «Сигнальный путь KGB-1 JNK негативно регулирует фактор транскрипции FOS-1 при стрессовой реакции». other_names: ~ таксономия: ~ other_unique_ids: - wm2011ab253 page_type: paper тип бумаги: - meeting_abstract таксономия: ~ wbid: WBPaper00038947 год: 2011 виды: ~ тип: бумага uri: search / paper / y104h22d.1% 3Finline = 1 & sizes = meeting_abstract
Сигнализация при врожденном иммунном ответе
Абад, п., Gouzy, J., Aury, J.-M., Castagnone-Sereno, P., Danchin, E.G.J., Deleury, E., Perfus-Barbeoch, L., Anthouard, V., Artiguenave, F., Blok, V.C., et al. (2008). Последовательность генома многолетних растений-паразитов нематоды Meloidogyne incognita. Nat. Biotechnol. 26, 909-915. Абстрактный Статья
Aballay, A., и Ausubel, F.M. (2001). Запрограммированная гибель клеток, опосредованная ced-3 и ced-4, защищает Caenorhabditis elegans от гибели, опосредованной Salmonella typhimurium.Proc. Natl. Акад. Sci. США 98, 2735-2739. Абстрактный Статья
Aballay, A., Drenkard, E., Hilbun, L.R., and Ausubel, F.M. (2003). Врожденный иммунный ответ Caenorhabditis elegans, запускаемый Salmonella enterica, требует наличия интактного LPS и опосредуется сигнальным путем MAPK. Curr. Биол. 13, 47-52. Абстрактный Статья
Арен, Д., Толандер, М., Фекете, К., Раджашекар, Б., Фриман, Э., Йоханссон, Т., и Тунлид, А. (2005). Сравнение гена экспрессия в ловушках и вегетативных гифах нематофагового гриба Monacrosporium haptotylum. Microbiology 151, 789-803. Абстрактный Статья
Акира С., Уэмацу С. и Такеучи О. (2006). Распознавание патогенов и врожденный иммунитет.Ячейка 124, 783-801. Абстрактный Статья
Алегадо, Р.А., Кэмпбелл, М.С., Чен, В.К., Слуц, С.С., и Тан, М.В. (2003). Характеристика медиаторов микробной вирулентности и врожденный иммунитет с использованием модели «хозяин-патоген» Caenorhabditis elegans. Клетка. Microbiol. 5, 435-444. Абстрактный Статья
Алегадо, Р.А., Тан М.В. (2008). Устойчивость к антимикробным пептидам способствует сохранению Salmonella typhimurium в кишечнике C. elegans. Клетка. Microbiol. 10, 1259–1273. Абстрактный Статья
Альпер С., Макбрайд С.Дж., Лакфорд Б., Фридман Дж.Х. и Шварц Д.А. (2007). Специфика и сложность врожденного иммунного ответа Caenorhabditis elegans. Мол. Клетка. Биол.27, 5544-5553. Абстрактный Статья
Альпер С., МакЭлви М.К., Апфельд Дж., Лакфорд Б., Фридман Дж. Х. и Шварц Д.А. (2009). Зародышевые линии C. elegans регулируют различные сигнальные пути для контроля продолжительности жизни и врожденного иммунитета. J. Biol. Chem. 285, 1822-1828 гг. Абстрактный Статья
Андерсен, Э.К., Блум, Дж., Герке, Дж. П., Кругляк, Л. (2014). Вариант нейропептидного рецептора npr-1 является основным детерминантом роста и физиологии Caenorhabditis elegans. PLoS Genet. 10, e1004156. Абстрактный Статья
Андерсен, Э. К., Герке, Дж. П., Шапиро, Дж. А., Криссман, Дж. Р., Гош, Р., Блум, Дж. С., Феликс, М. А., и Кругляк, Л. (2012). Селективное сканирование на уровне хромосом формирует геномное разнообразие Caenorhabditis elegans.Nat. Genet. 44, 285-290. Абстрактный Статья
Андерсон, А., Лоренсон-Шафер, Х., Партридж, Ф.А., Ходжкин, Дж., И Макмаллан, Р. (2013). Серотонинергические хемосенсорные нейроны модифицируют иммунный ответ C. elegans, регулируя передачу сигналов G-белка в эпителиальных клетках. PLoS Pathog. 9, e1003787. Абстрактный Статья
Аргуэлло, Р.Дж., Родригес, С. Р., Гатти, Э., Пьер, П. (2014). Регуляция синтеза белка, столп силы для врожденный иммунитет? Curr. Opin. Иммунол. 32, 28-35. Абстрактный Статья
Артюхин А.Б., Шредер Ф.С. и Эйвери, Л. (2013). Зависимость от плотности при голодании личинок Caenorhabditis. Sci. Реп.3, 2777. Абстрактный Статья
Эш, А., Belicard, T., Le Pen, J., Sarkies, P., Frezal, L., Lehrbach, N.J., Félix, M.A., and Miska, E.A. (2013). Удаление полиморфизм в гомологе RIG-I Caenorhabditis elegans приводит к отключению вирусной РНК и противовирусному иммунитету. eLife 2, e00994. Абстрактный Статья
Ausubel, F.M. (2005). Сохранены ли сигнальные пути врожденного иммунитета у растений и животных? Nat.Иммунол. 6, 973-979. Абстрактный Статья
Баньяи Л. и Патти Л. (1998). Гомологи амебапура Caenorhabditis elegans. Биохим. Биофиз. Acta 1429, 259-264. Абстрактный Статья
Баррьер А. и Феликс М.А. (2005). Высокое местное генетическое разнообразие и низкий уровень ауткроссинга в природных популяциях Caenorhabditis elegans.Curr. Биол. 15, 1176–1184. Абстрактный Статья
Бэррон, Г.Л. (1977). Грибки, уничтожающие нематод, Topics in Mycobiology No. 1 (Guelph, Ont. Canada: Lancester press). Абстрактный Статья
Барсайт Д., Лавджой Д.А. и Литгоу Г.Дж. (2001). Продолжительность жизни и устойчивость к тяжелым металлам у долгоживущих мутантов daf-2 и age-1 Caenorhabditis elegans.FASEB J. 15, 627-634. Абстрактный Статья
Бишоф, Л.Дж., Као, С.Ю., Лос, Ф.С., Гонсалес, М.Р., Шен, З., Бриггс, С.П., ван дер Гут, Ф.Г., и Ароян, Р.В. (2008). Активация развернутого белкового ответа необходима для защиты от бактериального порообразующего токсина in vivo. PLoS Pathog. 4, e1000176. Абстрактный Статья
Boehnisch, C., Вонг, Д., Хабиг, М., Изерман, К., Михилс, Н.К., Редер, Т., Мэй, Р.С., и Шуленбург, Х. (2011). Протистского типа лизоцимы нематоды Caenorhabditis elegans способствуют устойчивости к патогенному Bacillus thuringiensis. PLoS One 6, e24619. Абстрактный Статья
Больц, Д.Д., Тенор, Дж. Л., и Абаллай, А. (2010). Консервативный PMK-1 / p38 MAPK необходим для тканеспецифического иммунного ответа Caenorhabditis elegans на инфекцию Yersinia pestis.J. Biol. Chem. 285, 10832-10840. Абстрактный Статья
Брандт, Дж. П., и Рингстад, Н. (2015). Передача сигналов Toll-подобных рецепторов способствует развитию и функционированию необходимых сенсорных нейронов. для C. elegans поведение избегания патогенов. Curr. Биол. 25, 2228-2237. Абстрактный Статья
Буркевиц, К., Чоу, К.П., Ли, Э.С., Деонарин, А., и Стрэндж, К. (2012). Характеристика протеостазной роли накопление глицерина, деградация белка и синтез белка во время осмотического стресса у C. elegans. PLoS One 7, e34153. Абстрактный Статья
Капра, Э.Дж., Скрованек, С.М., Кругляк, Л. (2008). Сравнительный анализ экспрессии двух C.elegans изолирует. PLoS One 3, e4055. Абстрактный Статья
Чавес, В., Мохри-Шиоми, А., и Гарсин, Д.А. (2009). Ce-Duox1 / BLI-3 генерирует активные формы кислорода в качестве защитного механизма врожденного иммунитета у Caenorhabditis elegans. Заразить. Иммун. 77, 4983-4989. Абстрактный Статья
Чой, К.П., Стрэндж К. (2008). Полногеномный скрининг РНКи и репортеры агрегации белков in vivo выявляют деградацию поврежденных белков в качестве эссенциальной реакции на гипертонический стресс. Являюсь. J. Physiol. Cell Physiol. 295, C1488-1498. Абстрактный Статья
Чоу, Т.К., Чиу, Х.С., Куо, С.Дж., Ву, К.М., Сю, В.Дж., Чиу, В.Т., и Чен, К.С. (2013). Энтерогеморрагическая Escherichia coli O157: H7 Шига-подобный токсин 1 необходим для полной патогенности и активации митоген-активируемой протеинкиназы p38 путь в Caenorhabditis elegans.Клетка. Microbiol. 15, 82-97. Абстрактный Статья
Christophides, G.K., Zdobnov, E., Barillas-Mury, C., Birney, E., Blandin, S., Blass, C., Brey, P.T., Collins, F.H., Danielli, A., Dimopoulos, G., et al. (2002). Связанные с иммунитетом гены и семейства генов у Anopheles gambiae. Science 298, 159–165. Абстрактный Статья
Чуанг, К.Ф. и Баргманн К. (2005). Белок с повторами Toll-интерлейкина 1 в синапсе определяет асимметричный пахучий рецептор. экспрессия посредством передачи сигналов ASK1 MAPKKK. Genes Dev. 19, 270-281. Абстрактный Статья
Cipollo, J.F., Awad, A.M., Costello, C.E., and Hirschberg, C.B. (2004). srf-3, мутант Caenorhabditis elegans, устойчивый к бактериальной инфекции и связыванию биопленок, дефицит гликоконъюгатов.J. Biol. Chem. 279, 52893-52903. Абстрактный Статья
Клаудио, Н., Далет, А., Гатти, Э., и Пьер, П. (2013). Картирование перекрестка иммунной активации и клеточного стресса пути ответа. EMBO J. 32, 1214-1224. Абстрактный Статья
Коэн, Л.Б., Трёмель Э.Р. (2015). Микробный патогенез и защита хозяина у нематоды C. elegans. Curr. Opin. Microbiol. 23, 94-101. Абстрактный Статья
Куллон, Д.Д., Джонс, К.Л., Тодд, Т.К., Карр, Британская Колумбия, и Герман, М.А. (2009). Геномный ответ Caenorhabditis elegans на почвенные бактерии предсказывает генетические эффекты, специфичные для окружающей среды, на жизненные черты. PLoS Genet. 5, e1000503.Абстрактный Статья
Couillault, C., Fourquet, P., Pophillat, M., and Ewbank, J.J. (2012). Независимая от UPR специфическая для инфекции роль BiP / GRP78 белок в контроле экспрессии антимикробного пептида в эпидермисе C. elegans. Virulence 3, 299-308. Абстрактный Статья
Couillault, C., Пуйоль, Н., Ребоул, Дж., Сабатье, Л., Гишоу, Дж. Ф., Кохара, Ю., Юбанк, Дж. Дж. (2004). TLR-независимое управление врожденного иммунитета у Caenorhabditis elegans с помощью адаптерного белка TIR-домена TIR-1, ортолога SARM человека. Nat. Иммунол. 5, 488-494. Абстрактный Статья
Курт А., Чжан Дж., Миннерли Дж. И Цзя К. (2014). Активность кишечной аутофагии важна для защиты хозяина от Инфекция Salmonella typhimurium у Caenorhabditis elegans.Деве. Комп. Иммунол. 45, 214-218. Абстрактный Статья
Дай, Л.Л., Гао, Дж.Х., Цзоу, К.Г., Ма, Ю.С., и Чжан, К.К. (2015). mir-233 модулирует ответ развернутого белка у C. elegans во время инфекции Pseudomonas aeruginosa. PLoS Pathog. 11, e1004606. Абстрактный Статья
де Боно, М., и Баргманн К. (1998). Естественные вариации гомолога рецептора нейропептида Y изменяют социальное поведение и пищевой ответ C. elegans. Ячейка 94, 679-689. Абстрактный Статья
Диркинг, К., Полановска, Дж., Оми, С., Энгельманн, И., Гут, М., Лембо, Ф., Юбанк, Дж. Дж., И Пуйоль, Н. (2011). Необычное регулирование белка STAT с помощью переносчика семейства SLC6 в C.elegans эпидермальный врожденный иммунитет. Клеточный микроб-хозяин 9, 425-435. Абстрактный Статья
Dijksterhuis, J., Veenhuis, M., and Harder, W. (1990). Ультраструктурное исследование спаек и начальных стадий инфицирования нематода — конидиями Drechmeria coniospora. Mycol. Res. 94, 1-8. Абстрактный Статья
Дишоу, Л.J., Haire, R.N., Litman, G.W. (2012). Геном амфиоксуса дает уникальное представление об эволюции иммунитета. Краткий. Функц. Геномика 11, 167-176. Абстрактный Статья
Дрейс, К., Маклафлин, С., и Дарби, К. (2009). Caenorhabditis elegans BAH-1 — это белок DUF23, экспрессируемый в шовных клетках и необходимый для связывания микробной биопленки с кутикулой.PLoS One 4, e6741. Абстрактный Статья
Дрекслер, К. (1941). Некоторые гифомицеты паразитируют на свободноживущих терриколистных нематодах. Фитопатология 31, 773-802. Статья
Дрикамер К. и Додд Р. Б. (1999). Лектин-подобные домены C-типа у Caenorhabditis elegans: предсказания на основе полной последовательности генома.Гликобиология 9, 1357-1369. Абстрактный Статья
Дю Паскье, Л. (2005). Удовлетворение потребности в врожденном и адаптивном иммунитете в процессе эволюции. Сканд. J. Immunol. 62 Дополнение 1, 39-48. Абстрактный Статья
Данбар, Т.Л., Ян, З., Балла, К.М., Смелкинсон, М.Г., Трёмель Э. Р. (2012). C. elegans обнаруживает индуцированное патогеном ингибирование трансляции для активации иммунной передачи сигналов. Cell Host Microbe 11, 375-386. Абстрактный Статья
Эденс, В.А., Шарлинг, Л., Ченг, Г., Шапира, Р., Кинкейд, Дж. М., Ли, Т., Иденс, Х.А., Танг, X., Саллардс, К., Флаэрти, D.B., et al. (2001). Сшивание тирозином внеклеточного матрикса катализируется Duox, мультидоменной оксидазой / пероксидазой с гомология субъединице оксидазы фагоцитов gp91phox.J. Cell Biol. 154, 879-891. Абстрактный Статья
Энгельманн, И., Гриффон, А., Тичит, Л., Монтанана-Санчис, Ф., Ван, Г., Рейнке, В., Уотерстон, Р.Х., Хиллиер, Л.В., и Юбанк, J.J. (2011). Комплексный анализ изменений экспрессии генов у C. elegans, спровоцированных бактериальной и грибковой инфекцией. PLoS One 6, e19055. Абстрактный Статья
Энгельманн, И., и Пуйоль, Н. (2010). Врожденный иммунитет C. elegans. Adv. Exp. Med. Биол. 708, 105-121. Абстрактный Статья
Ермолаева, М.А., Сегреф, А., Даховник, А., Оу, Х.Л., Шнайдер, Й.И., Утермёлен, О., Хоппе, Т., и Шумахер, Б. (2013). Повреждение ДНК в половых клетках вызывает врожденный иммунный ответ, который вызывает системную стрессоустойчивость. Nature 501, 416-420.Абстрактный Статья
Эстес, К.А., Данбар, Т.Л., Пауэлл, Дж.Р., Осубель, Ф.М., и Трёмель, Э.Р. (2010). Фактор транскрипции bZIP zip-2 обеспечивает ранний ответ на инфекцию Pseudomonas aeruginosa у Caenorhabditis elegans. Proc. Natl. Акад. Sci. США. 107, 2153-2158. Абстрактный Статья
Эстес, К.А., Шумовски С.С., Трёмель Э.Р. (2011). Нелитический выход внутриклеточных паразитов из кишечных клеток C. elegans на основе актина. PLoS Pathog. 7, e1002227. Абстрактный Статья
Эванс, Э.А., Кавли, Т., и Тан, М.В. (2008). Pseudomonas aeruginosa подавляет иммунитет хозяина, активируя инсулиноподобный сигнальный путь DAF-2 у Caenorhabditis elegans. PLoS Pathog. 4, e1000175.Абстрактный Статья
Ewbank, J.J. (2002). Решая обе стороны уравнения «хозяин-патоген» с помощью Caenorhabditis elegans. Микробы заражают. 4, 247-256. Абстрактный Статья
Ewbank, J.J. Сигнализация в иммунном ответе (23 января 2006 г.), WormBook, ed. Модель C.elegans Research Community, WormBook, doi / 10.1895 / wormbook.1.83.1, http://www.wormbook.org. Абстрактный Статья
Эубанк, Дж. Дж., И Пуйоль, Н. (2010). Клеточный гомеостаз: справиться с перегрузкой ER во время иммунного ответа. Curr. Биол. 20, Р452-455. Абстрактный Статья
Феликс, М.A., Ashe, A., Piffaretti, J., Wu, G., Nuez, I., Bélicard, T., Jiang, Y., Zhao, G., Franz, C.J., Goldstein, L.D., et al. (2011). Естественное и экспериментальное заражение нематод Caenorhabditis новыми вирусами, родственными нодавирусам. PLoS Biol. 9, e1000586. Абстрактный Статья
Феликс, М.А., и Брандл, К. (2010). Естественная история Caenorhabditis elegans. Curr. Биол. 20, R965-969.Абстрактный Статья
Феликс, М.А., и Дюво, Ф. (2012). Динамика популяций и распределение местообитаний природных популяций Caenorhabditis elegans и C. briggsae. BMC Biol. 10, 59. Абстрактный Статья
Фукусигэ, Т., Хокинс, М.Г., и МакГи, Дж. Д. (1998).GATA-фактор elt-2 необходим для формирования кишечника Caenorhabditis elegans. Dev. Биол. 198, 286-302. Абстрактный Статья
Гарсин Д.А., Вильянуэва Дж. М., Бегун Дж., Ким, Д. Х., Сифри, К. Д., Колдервуд, С. Б., Рувкун, Г., и Осубель, Ф.М. (2003). Долгоживущие мутанты daf-2 C. elegans устойчивы к бактериальным патогенам. Наука 300, 1921 год. Абстрактный Статья
Джордж-Райзен, Дж.Б., Шокли К.Р., Трояновски Н.Ф., Лэмб А.Л., Райзен Д.М. (2014). Динамически выраженный прионоподобный белки образуют кутикулу в глотке Caenorhabditis elegans. Биол. Открыт 3, 1139-1149. Абстрактный Статья
Gravato-Nobre, M.J., Nicholas, H.R., Nijland, R., O’Rourke, D., Whittington, D.E., Yook, K.J., and Hodgkin, J. (2005). Несколько гены влияют на чувствительность Caenorhabditis elegans к бактериальному патогену Microbacterium nematophilum.Генетика 171, 1033-1045. Абстрактный Статья
Гравато-Нобре, М.Дж., Страуд, Д., О’Рурк, Д., Дарби, К., и Ходжкин, Дж. (2011). Гены гликозилирования экспрессируются в шовных клетках определить комплексные поверхностные свойства и бактериальную адгезию к кутикуле Caenorhabditis elegans. Генетика 187, 141-155. Абстрактный Статья
Гюртлер, К., Карти, М., Кирни, Дж., Шаттген, С.А., Динг, А., Фицджеральд, К.А., и Боуи, А.Г. (2014). SARM регулирует CCL5 продуцирование в макрофагах путем стимулирования рекрутирования факторов транскрипции и РНК-полимеразы II на промотор Ccl5. J. Immunol. 192, 4821-4832. Абстрактный Статья
Ха, Э.М., О, К.Т., Бэ, Ю.С., и Ли, В.Дж. (2005). Прямая роль двойной оксидазы в кишечном иммунитете дрозофилы. Science 310, 847-850. Абстрактный Статья
Хаммелл, К.М., Карп, X., и Амброс, В. (2009). Цепь обратной связи с участием miRNAs let-7-family и DAF-12 интегрирует сигналы окружающей среды и время развития у Caenorhabditis elegans. Proc. Natl. Акад. Sci. США. 106, 18668-18673. Абстрактный Статья
Хаскинс, К.А., Рассел, Дж. Ф., Гэддис, Н., Дрессман, Х. К., и Абаллай, А. (2008). Гены ответа на развернутый белок регулируются by CED-1 необходимы для врожденного иммунитета Caenorhabditis elegans. Dev. Cell 15, 87-97. Абстрактный Статья
Хаттори А., Мизуно Т., Акамацу М., Хисамото Н. и Мацумото К. (2013). Сигнальный путь JNK Caenorhabditis elegans активирует экспрессию генов стресс-ответа, подавляя репрессорный комплекс Fos / HDAC.PLoS Genet. 9, e1003315. Абстрактный Статья
Хендерсон, С.Т., и Джонсон, Т.Э. (2001). daf-16 объединяет факторы развития и окружающей среды, чтобы опосредовать старение у нематоды Caenorhabditis elegans. Curr. Биол. 11, 1975-1980 гг. Абстрактный Статья
Хертвек, М., Гобель, К., и Баумейстер, Р. (2004). SGK-1 C. elegans является критическим компонентом киназного комплекса Akt / PKB, контролирующим реакцию на стресс и продолжительность жизни. Dev. Cell 6, 577-588. Абстрактный Статья
Ходжкин, Дж., Феликс, М.А., Кларк, Л.К., Страуд, Д., и Гравато-Нобре, М.Дж. (2013). Два штамма Leucobacter обладают комплементарной вирулентностью в отношении Caenorhabditis, включая смерть от червя-звездообразования.Curr. Биол. 23, 2157-2161. Абстрактный Статья
Ходжкин Дж., Кувабара П.Э. и Корнелиуссен Б. (2000). Новый бактериальный патоген Microbacterium nematophilum вызывает морфологические изменения у нематоды C. elegans. Curr. Биол. 10, 1615-1618. Абстрактный Статья
Хёкендорф, А., Станисак, М., Лейппе, М. (2012). Сапозиноподобный белок SPP-12 представляет собой противомикробный полипептид в нейронах глотки Caenorhabditis elegans и участвует в защите от естественного бактериального патогена. Биохим. J. 445, 205-212. Абстрактный Статья
Хувен, Р., Маккаллум, К.С., Круз, М.Р., и Гарсин, Д.А. (2011). Генерируемые Ce-Duox1 / BLI-3 активные формы кислорода запускают защитную активность SKN-1 посредством передачи сигналов p38 MAPK во время инфекции у C.elegans. PLoS Pathog. 7, e1002453. Абстрактный Статья
Höflich, J., Berninsone, P., Göbel, C., Gravato-Nobre, M.J., Libby, B.J., Darby, C., Politz, S.M., Hodgkin, J., Hirschberg, C.B., и Baumeister, R. (2004). Потеря активности переносчика сахаров нуклеотидов, кодируемых srf-3, у Caenorhabditis elegans изменяет поверхностную антигенность и предотвращает прикрепление бактерий.J. Biol. Chem. 279, 30440-30448. Абстрактный Статья
Сюй, А.Л., Мерфи, К.Т., и Кеньон, К. (2003). Регулирование старения и возрастных заболеваний с помощью DAF-16 и фактора теплового шока. Science 300, 1142-1145. Абстрактный Статья
Хуан Г., Ши Л.З. и Чи Х.(2009). Регуляция JNK и p38 MAPK в иммунной системе: интеграция сигналов, распространение и прекращение. Цитокин 48, 161-169. Абстрактный Статья
Хаффман Д.Л., Абрами Л., Сасик Р., Корбейл Дж., Ван дер Гут Ф.Г. и Ароян Р.В. (2004). Митоген-активированный белок киназные пути защищают от бактериальных порообразующих токсинов.Proc. Natl. Акад. Sci. США. 101, 10995-11000. Абстрактный Статья
Иноуэ, Х., Хисамото, Н., Ан, Дж. Х., Оливейра, Р. П., Нисида, Э., Блэквелл, Т. К., и Мацумото, К. (2005). Путь C. elegans p38 MAPK регулирует ядерную локализацию транскрипционного фактора SKN-1 при ответе на окислительный стресс. Genes Dev. 19, 2278-2283. Абстрактный Статья
Иорданов, М.S., Pribnow, D., Magun, J.L., Dinh, T.H., Pearson, J.A., Chen, S.L., и Magun, B.E. (1997). Риботоксический стресс ответ: активация стресс-активируемой протеинкиназы JNK1 ингибиторами пептидилтрансферазной реакции и Последовательно-специфическое повреждение РНК петли альфа-сарцин / рицин в 28S рРНК. Мол. Клетка. Биол. 17, 3373-3381. Абстрактный Статья
Иразоки, Дж.E., Troemel, E.R., Feinbaum, R.L., Luhachack, L.G., Cezairliyan, B.O., and Ausubel, F.M. (2010a). Отчетливый патогенез и ответы хозяина во время инфицирования C. elegans P. aeruginosa и S. aureus. PLoS Pathog. 6, e1000982. Абстрактный Статья
Irazoqui, J.E., Urbach, J.M., and Ausubel, F.M. (2010b). Эволюция врожденной защиты хозяина: идеи Caenorhabditis elegans и примитивных беспозвоночных.Nat. Rev. Immunol. 10, 47-58. Абстрактный Статья
Джейнвей, К.А., младший (1998). Послание президента Американской ассоциации иммунологов. Менее популярная дорога: роль врожденного иммунитета в адаптивном иммунном ответе. J. Immunol. 161, 539-544. Абстрактный Статья
Джейнвей, К.А., младший, и Меджитов, Р. (2002). Врожденное иммунное распознавание. Анну. Rev. Immunol. 20, 197-216. Абстрактный Статья
Каплан, Ф., Бадри, Д. В., Захария, К., Айредини, Р., Сандовал, Ф. Дж., Рой, С., Левин, Л. Х., Чжан, Ф., Робинетт, С. Л., Альборн, Х.Т. и др. (2009). Подавление бактериального притяжения и распознавания кворума в экссудатах Caenorhabditis elegans.J. Chem. Ecol. 35, 878-892. Абстрактный Статья
Као, С.Ю., Лос, Ф.С., Хаффман, Д.Л., Вачи, С., Клофт, Н., Хусманн, М., Карабрахими, В., Шварц, Дж. Л., Белье, А., Ха, C., et al. (2011). Глобальный функциональный анализ клеточных ответов на порообразующие токсины. PLoS Pathog. 7, e1001314. Абстрактный Статья
Като, Ю., Айзава, Т., Хосино, Х., Кавано, К., Нитта, К., и Чжан, Х. (2002). abf-1 и abf-2, гены антимикробных пептидов типа ASABF у Caenorhabditis elegans. Биохим. J. 361, 221-230. Абстрактный Статья
Кавли Т., Хе Ф. и Тан М.В. (2010a). Чтобы бороться с инфекциями, нужны нервы: выводы о нейроиммунных взаимодействиях от C. elegans. Дис. Модель. Мех.3, 721-731. Абстрактный Статья
Кавли Т. и Тан М.В. (2008). Нейроэндокринные сигналы модулируют врожденный иммунитет Caenorhabditis elegans посредством передачи сигналов инсулина. Nat. Иммунол. 9, 1415-1424. Абстрактный Статья
Кавли Т., Ву К. и Тан М.В.(2010b). Системная и присущая клетке роль передачи сигналов Gqα в регуляции врожденного иммунитета, оксидативный стресс и долголетие у Caenorhabditis elegans. Proc. Natl. Акад. Sci. США 107, 13788-13793. Абстрактный Статья
Кеньон, К., Чанг, Дж., Генш, Э., Руднер, А., Табтианг, Р. (1993). Мутант C. elegans, который живет вдвое дольше дикого тип.Nature 366, 461-464. Абстрактный Статья
Кешет Ю., Сегер Р. (2010). Сигнальные каскады киназы MAP: система из сотен компонентов регулирует различные набор физиологических функций. Методы Мол. Биол. 661, 3-38. Абстрактный Статья
Ким, Д.Х. (2013). Бактерии, старение и долголетие Caenorhabditis elegans. Анну. Преподобный Жене. 47, 233-246. Абстрактный Статья
Ким, Д.Х., Фейнбаум, Р., Аллоинг, Г., Эмерсон, Ф.Э., Гарсин, Д.А., Иноуэ, Х., Танака-Хино, М., Хисамото, Н., Мацумото, К., Tan, M.W., et al. (2002). Консервативный путь киназы p38 MAP при врожденном иммунитете Caenorhabditis elegans.Science 297, 623-626. Абстрактный Статья
Ким, Д.Х., Либерати, Н.Т., Мизуно, Т., Иноуэ, Х., Хисамото, Н., Мацумото, К., и Осубель, Ф.М. (2004). Интеграция путей MAPK Caenorhabditis elegans, опосредующих иммунитет и устойчивость к стрессу с помощью киназы MEK-1 MAPK и фосфатазы MAPK VHP-1. Proc. Natl. Акад. Sci. США. 101, 10990-10994. Абстрактный Статья
Кимура, К.Д., Тиссенбаум, Х.А., Лю, Ю., и Рувкун, Г. (1997). daf-2, ген, подобный рецептору инсулина, который регулирует продолжительность жизни и диапаузу у Caenorhabditis elegans. Science 277, 942-946. Абстрактный Статья
Кириенко Н.В., Осубель Ф.М., Рувкун Г. (2015). Митофагия придает устойчивость к опосредованной сидерофором гибели Pseudomonas aeruginosa. Proc. Natl. Акад. Sci. США. 112, 1821–1826.Абстрактный Статья
Кондо, М., Янасэ, С., Исии, Т., Хартман, П.С., Мацумото, К., и Исии, Н. (2005). Путь передачи сигнала p38 участвует в опосредованной окислительным стрессом транслокации DAF-16 в ядра Caenorhabditis elegans. Мех. Aging Dev. 126, 642-647. Абстрактный Статья
Кудлоу Б.А., Чжан Л. и Хань М. (2012). Систематический анализ ограниченных тканью miRISC показывает широкую роль микроРНК. в подавлении базовой активности ответа патогена C. elegans. Мол. Cell 46, 530-541. Абстрактный Статья
Курц, К.Л., Эубанк, Дж. Дж. (2003). Caenorhabditis elegans: новая генетическая модель для изучения врожденного иммунитета. Nat.Преподобный Жене. 4, 380-390. Абстрактный Статья
Курц, К.Л., Эубанк, Дж. Дж. (2007). Инфекция в блюде: высокопроизводительный анализ бактериального патогенеза. Curr. Opin. Microbiol. 10, 10-16. Абстрактный Статья
Labed, S.A., Omi, S., Гут, М., Эубанк, Дж. Дж., И Пуйоль, Н. (2012). Псевдокиназа NIPI-4 представляет собой новый регулятор экспрессии гена антимикробного пептида. PLoS One 7, e33887. Абстрактный Статья
Лабрусс, А., Шове, С., Куйо, К., Курц, К.Л., Эубанк, Дж. Дж. (2000). Caenorhabditis elegans является модельным хозяином для Salmonella typhimurium. Curr. Биол. 10, 1543-1545. Абстрактный Статья
Лэнг, С.Т., Ивенс, А., Батлер, В., Равикумар, С.П., Лэйнг, Р., Вудс, Д.Дж., Жиллар, Дж. (2012). Транскрипционный Ответ Caenorhabditis elegans на воздействие ивермектина позволяет идентифицировать новые гены, участвующие в реакции на снижение потребления пищи. PLoS One 7, e31367. Абстрактный Статья
Ламитина, С.Т., Стрэндж, К. (2004). Транскрипционные мишени сигнального пути инсулина DAF-16 защищают C.elegans от сильного гипертонического стресса. Являюсь. J. Physiol. Cell Physiol. 288, C467-474. Абстрактный Статья
Лэндис, Дж. Н., Мерфи, К. Т. (2010). Интеграция различных входов в регуляцию Caenorhabditis elegans DAF-16 / FOXO. Dev. Дин. 239, 1405–1412. Абстрактный Статья
Ли, Э.К. и Стрэндж К. (2012). GCN-2-зависимое ингибирование синтеза белка активирует транскрипцию осмочувствительного гена посредством передачи сигналов киназ WNK и Ste20. Являюсь. J. Physiol. Cell Physiol. 303, C1269-1277. Абстрактный Статья
Ли К., Шим Дж., Бэ Дж., Ким Ю. Дж. И Ли Дж. (2012). Стабилизация белка RNT-1, гомолога белка RUNX, родственного транскрипционному фактору (RUNX) Caenorhabditis elegans, окислительным стрессом через путь митоген-активируемой протеинкиназы.J. Biol. Chem. 287, 10444-10452. Абстрактный Статья
Ли, К.А., Ким, С.Х., Ким, Э.К., Ха, Э.М., Ю, Х., Ким, Б., Ким, М.Дж., Квон, Ю., Рю, Дж. Х., и Ли, У. Дж. (2013a). Бактериального происхождения урацил как модулятор иммунитета слизистых оболочек и гомеостаза кишечных микробов у дрозофилы. Cell 153, 797-811. Абстрактный Статья
Ли, С.H., Wong, R.R., Chin, C.Y., Lim, T.Y., Eng, S.A., Kong, C., Ijap, N.A., Lau, M.S., Lim, M.P., Gan, Y.H., et al. (2013b). Burkholderia pseudomallei подавляет иммунитет к Caenorhabditis elegans путем специфической деградации фактора транскрипции GATA. Proc. Natl. Акад. Sci. США. 110, 15067-15072. Абстрактный Статья
Лерой, М., Моссер, Т., Маньер, X., Альварес, Д.Ф., и Матич, И.(2012). Вызванная патогеном пластичность развития Caenorhabditis elegans оказывает горметическое влияние на устойчивость к биотическим и абиотическим стрессам. BMC Evol. Биол. 12, 187. Абстрактный Статья
Лян Б., Муссайф М., Куан С.Дж., Гаргус Дж.Дж. и Сзе Дж.Й. (2006). Серотонин нацелен на сигнальный путь DAF-16 / FOXO, чтобы модулировать стрессовые реакции. Cell Metab. 4, 429-440. Абстрактный Статья
Либерати, Н.Т., Фицджеральд, К.А., Ким, Д.Х., Фейнбаум, Р., Голенбок, Д.Т., и Осубель, Ф.М. (2004). Требование консервированного Белок домена устойчивости к Toll / интерлейкину-1 в иммунном ответе Caenorhabditis elegans. Proc. Natl. Акад. Sci. США. 101, 6593-6598. Абстрактный Статья
Лю Ф., Хе С. X., Ло Л. Дж., Цзоу К. Л., Чжао Ю. Х., Сайни Р., Хань С. Ф., Кнолкер Х.J., Wang, L.S., и Ge, B.X. (2013). Регуляция микроРНК рецепторами ядерного гормона контролирует врожденные иммунные ответы у C. elegans. PLoS Pathog. 9, e1003545. Абстрактный Статья
Лю Ю., Сэмюэл Б.С., Брин П.С. и Рувкун Г. (2014). Caenorhabditis elegans пути, которые наблюдают и защищают митохондрии. Nature 508, 406-410. Абстрактный Статья
Людвиг, А.Х., Израелит, Ю., Парк, Д., Малик, Р.У., Циммерман, А., Маханти, П., Фокс, Б.В., Бетке, А., Деринг, Ф., Риддл, D.L. и др. (2013). Чувствительность к феромонам регулирует продолжительность жизни Caenorhabditis elegans и устойчивость к стрессу с помощью деацетилазы SIR-2.1. Proc. Natl. Акад. Sci. США. 110, 5522-5527. Абстрактный Статья
Ludewig AH. и Шредер ФК. Передача сигналов аскарозидов у C.elegans (18 января 2013 г.), WormBook, ed. Исследовательское сообщество C. elegans, WormBook, doi / 10.1895 / wormbook.1.155.1, http://www.wormbook.org. Абстрактный Статья
Магуайр, С.М., Кларк, К.М., Нуннари, Дж., Пирри, Дж. К., и Алкема, М.Дж. (2011). Реакция на прикосновение C. elegans облегчает побег от хищных грибов. Curr. Биол. 21, 1326–1330. Абстрактный Статья
Махаджан-Миклош, С., Tan, M.W., Rahme, L.G., и Ausubel, F.M. (1999). Выявлены молекулярные механизмы вирулентности бактерий. с использованием модели патогенеза Pseudomonas aeruginosa-Caenorhabditis elegans. Ячейка 96, 47-56. Абстрактный Статья
Малло, Г.В., Курц, К.Л., Куйо, К., Пужоль, Н., Гранжо, С., Кохара, Ю., Эубанк, Дж. Дж. (2002). Индуцируемый антибактериальный система защиты в C.elegans. Curr. Биол. 12, 1209–1214. Абстрактный Статья
Mansisidor, A.R., Cecere, G., Hoersch, S., Jensen, MB, Kawli, T., Kennedy, L.M., Chavez, V., Tan, M.W., Lieb, J.D., and Гришок, А. (2011). Консервативный белок пальца PHD и эндогенная РНКи модулируют передачу сигналов инсулина у Caenorhabditis elegans. PLoS Genet. 7, e1002299. Абстрактный Статья
Марш, Э.К., ван ден Берг, М.С., и Мэй, Р.С. (2011). Баланс двух генов регулирует толерантность к Salmonella typhimurium у нематоды Caenorhabditis elegans. PLoS One 6, e16839. Абстрактный Статья
Мацудзава А., Саэгуса К., Ногучи Т., Садамицу К., Нисито Х., Нагаи С., Коясу С., Мацумото К., Такеда К. и Ичидзё, Х. (2005). АФК-зависимая активация пути TRAF6-ASK1-p38 избирательно требуется для TLR4-опосредованной врожденной иммунитет.Nat. Иммунол. 6, 587-592. Абстрактный Статья
Мацингер, П. (2002). Модель опасности: обновленное чувство собственного достоинства. Наука 296, 301-305. Абстрактный Статья
Макэлви, Дж., Бабб, К., и Томас, Дж. Х. (2003). Выходы транскрипции вилкообразного белка DAF-16 Caenorhabditis elegans.Ячейка старения 2, 111-121. Абстрактный Статья
Макэлви, Дж. Дж., Шустер, Э., Блан, Э., Томас, Дж. Х. и Джемс, Д. (2004). Общая транскрипционная сигнатура у личинок Caenorhabditis elegans Dauer и долгоживущих мутантов daf-2 предполагает участие системы детоксикации в обеспечении долголетия. J. Biol. Chem. 279, 44533-44543. Абстрактный Статья
МакЭван, Д.Л., Кириенко Н.В., Аусубель Ф.М. (2012). Ингибирование трансляции хозяина экзотоксином А Pseudomonas aeruginosa запускает иммунный ответ у Caenorhabditis elegans. Клеточный микроб-хозяин 11, 364-374. Абстрактный Статья
МакГи, Дж. Д., Фукусигэ, Т., Краузе, М. В., Миннема, С. Е., Гощинский, Б., Годет, Дж., Кохара, Ю., Боссингер, О., Чжао, Ю., Хаттра, Дж., и другие. (2009). ELT-2 является преобладающим фактором транскрипции, контролирующим дифференцировку и функцию кишечника C. elegans от эмбриона до взрослого человека. Dev. Биол. 327, 551-565. Абстрактный Статья
МакГрат, П.Т., Рокман, М.В., Циммер, М., Янг, Х., Макоско, Э.З., Кругляк, Л., и Баргманн, К.И. (2009). Количественное отображение дигенного поведенческого признака подразумевает изменение глобина у C.elegans сенсорное поведение. Нейрон 61, 692-699. Абстрактный Статья
Макмаллан Р., Андерсон А. и Нурриш С. (2012). Поведенческие и иммунные ответы на инфекцию требуют передачи сигналов Gαq-RhoA у C. elegans. PLoS Pathog. 8, e1002530. Абстрактный Статья
Значит, Т.К., Милонакис, Э., Тампакакис, Э., Колвин, Р. А., Сунг, Э., Пакетт, Л., Тай, М. Ф., Стюарт, К. Р., Пуккила-Уорли, R., Hickman, S.E., et al. (2009). Эволюционно консервативное распознавание и врожденный иммунитет к грибковым патогенам рецепторами скавенджера SCARF1 и CD36. J. Exp. Med. 206, 637-653. Абстрактный Статья
Меджитов Р.и Джейнвей С.А. младший (1998). Древняя система защиты хозяина. Curr. Opin. Иммунол. 10, 12-15. Абстрактный Статья
Меджитов Р., Шнайдер Д.С., Соарес М.П. (2012). Толерантность к болезням как стратегия защиты. Science 335, 936-941. Абстрактный Статья
Мело, Дж.А., Рувкун Г. (2012). Инактивация консервативных генов C. elegans задействует защиту, связанную с патогенами и ксенобиотиками. Ячейка 149, 452-466. Абстрактный Статья
Миллер Е.В., Гранди Л.Н., Джаннини Дж. А., Робинсон Дж. Д. и Пауэлл Дж. Р. (2015). Консервативный рецептор, связанный с G-белком FSHR-1 регулирует защитные реакции хозяина на инфекцию и окислительный стресс.PLoS One 10, e0137403. Абстрактный Статья
Милч, С.М., Зеебергер, П.Х., и Лепенис, Б. (2014). Лектин-подобный домен С-типа, содержащий белки Clec-39 и Clec-49 имеют решающее значение для иммунитета Caenorhabditis elegans против инфекции Serratia marcescens. Dev. Комп. Иммунол. 45, 67-73. Абстрактный Статья
Мизуно, Т., Хисамото, Н., Терада, Т., Кондо, Т., Адачи, М., Нисида, Э., Ким, Д.Х., Осубель, Ф.М., и Мацумото, К. (2004). MAPK-фосфатаза VHP-1 Caenorhabditis elegans опосредует новый JNK-подобный сигнальный путь в ответ на стресс. EMBO J. 23, 2226-2234. Абстрактный Статья
Мотии, М., Йошида, С., Морита, К., Кохара, Ю., и Уэно, Н. (1999). Идентификация трансформирующего фактора роста-β-регулируемого гены Caenorhabditis elegans путем дифференциальной гибридизации массивов кДНК.Proc. Natl. Акад. Sci. США 96, 15020-15025. Абстрактный Статья
Мор И., Зоненберг Н. (2012). Трансляция хозяина на стыке инфекции и иммунитета. Cell Host Microbe 12, 470-483. Абстрактный Статья
Морибе, Х., Конакава, Р., Кога, Д., Ушики, Т., Накамура, К., Мекада, Э. (2012). Тетраспанин необходим для выработки активных форм кислорода двойной оксидазной системой у Caenorhabditis elegans. PLoS Genet. 8, e1002957. Абстрактный Статья
Мухаммед М., Фукс Б. Б., Ву М. П., Брегер Дж., Коулман Дж. Дж. И Милонакис Э. (2012). Роль продукции мицелия и MAPK-опосредованный иммунный ответ у C.elegans-Fusarium модельная система. Med. Mycol. 50, 488-496. Абстрактный Статья
Мерфи, К.Т., МакКэрролл, С.А., Баргманн, К.И., Фрейзер, А., Камат, Р.С., Аринджер, Дж., Ли, Х., и Кеньон, К. (2003). Гены которые действуют ниже DAF-16 и влияют на продолжительность жизни Caenorhabditis elegans. Nature 424, 277-283. Абстрактный Статья
Натху, А.Н., Мёллер, Р.А., Вестлунд, Б.А., и Харт, А.С. (2001). Идентификация семейств генов нейропептидоподобных белков у Caenorhabditis elegans и других видов. Proc. Natl. Акад. Sci. США 98, 14000-14005. Абстрактный Статья
Николас, Х.Р., и Ходжкин, Дж. (2004a). Каскад киназ ERK MAP опосредует отек хвоста и защитный ответ на ректальную инфекцию у C.elegans. Curr. Биол. 14, 1256–1261. Абстрактный Статья
Николас, Х.Р., и Ходжкин, Дж. (2004b). Ответы на инфекцию и возможные стратегии распознавания в врожденной иммунной системе Caenorhabditis elegans. Мол. Иммунол. 41, 479-493. Абстрактный Статья
О’Рурк, Д., Бабан, Д., Демидова, М., Мотт, Р., и Ходжкин, Дж. (2006). Геномные кластеры, предполагаемые молекулы распознавания патогенов, и антимикробные гены индуцируются инфицированием C. elegans M. nematophilum. Genome Res. 16, 1005-1016. Абстрактный Статья
О, С.В., Мухопадхьяй, А., Диксит, Б.Л., Раха, Т., Грин, М.Р., и Тиссенбаум, Х.А. (2006). Идентификация прямых мишеней DAF-16, контролирующих продолжительность жизни, метаболизм и диапаузу, путем иммунопреципитации хроматина.Nat. Genet. 38, 251-257. Абстрактный Статья
Олофссон, Б. (2014). Обонятельный нейрон AWC способствует отказу от обычно вкусной пищи после хронического ограничения в питании. J. Exp. Биол. 217, 1790-1798. Абстрактный Статья
Оокума, С., Фукуда, М., и Нисида, Э. (2003). Идентификация транскрипционного гена-мишени DAF-16, scl-1, который регулирует продолжительность жизни и устойчивость к стрессу у Caenorhabditis elegans. Curr. Биол. 13, 427-431. Абстрактный Статья
Остерло, Дж. М., Янг, Дж., Руни, Т. М., Фокс, А. Н., Адальберт, Р., Пауэлл, Е. Х., Шихан, А. Е., Эйвери, М. А., Хакет, Р., Логан, M.A., et al.(2012). dSarm / Sarm1 необходим для активации пути гибели аксонов, вызванного повреждением. Наука 337, 481-484. Абстрактный Статья
Палаима, Э., Леймари, Н., Страуд, Д., Мизанур, Р.М., Ходжкин, Дж., Гравато-Нобре, М.Дж., Костелло, С.Е., и Чиполло, Дж. Ф. (2010). Мутант bus-2 Caenorhabditis elegans обнаруживает новый класс O-гликанов, влияющих на устойчивость бактерий.J. Biol. Chem. 285, 17662-17672. Абстрактный Статья
Папп Д., Чермели П. и Соти К. (2012). Роль SKN-1 / Nrf в резистентности к патогенам и иммуносенесценции у Caenorhabditis elegans. PLoS Pathog. 8, e1002673. Абстрактный Статья
Парсонс, Л.М., Сиполло, Дж.(2014). Пероральный прием Microbacterium nematophilum приводит к инфекции анальной области у Caenorhabditis elegans. Микробы заражают. 16, 356-361. Абстрактный Статья
Парсонс, Л.М., Мизанур, Р.М., Янковска, Э., Ходжкин, Дж., Д., О. Р., Страуд, Д., Гош, С., и Чиполло, Дж. Ф. (2014). Устойчивые к бактериальному патогену мутанты bus-4 Caenorhabditis elegans продуцируют измененные муцины. PLoS One 9, e107250.Абстрактный Статья
Партридж, Ф.А., Тирл, А.В., Гравато-Нобре, М.Дж., Шафер, В.Р., и Ходжкин, Дж. (2008). Гликозилтрансфераза BUS-8 C. elegans выполняет две различные и важные роли в морфогенезе эпидермиса. Dev. Биол. 317, 549-559. Абстрактный Статья
Пеллегрино, М.В., Наргунд, А.М., Кириенко, Н.В., Гиллис, Р., Фиорезе, К.Дж., Хейнс, К.М. (2014). Митохондриальный UPR-регулируемый врожденный иммунитет обеспечивает устойчивость к патогенной инфекции. Nature 516, 414-417. Абстрактный Статья
Пэн, Дж., Юань, К., Лин, Б., Паннеерселвам, П., Ван, X., Луан, XL, Лим, С.К., Люн, Б.П., Хо, Б., и Дин, Д.Л. (2010) . SARM подавляет как TRIF- и MyD88-опосредованная активация AP-1.Евро. J. Immunol. 40, 1738-1747. Абстрактный Статья
Посас Ф. и Сайто Х. (1997). Осмотическая активация пути HOG MAPK через Ste11p MAPKKK: роль каркаса Pbs2p MAPKK. Science 276, 1702–1705. Абстрактный Статья
Пауэлл, Дж.Р., Осубель Ф. (2008). Модели заражения Caenorhabditis elegans бактериальными и грибковыми патогенами. Методы Мол. Биол., 415, 403-427. Абстрактный Статья
Пауэлл, Дж. Р., Ким, Д. Х., Осубель, Ф. М. (2009). Связанный с G-белком рецептор FSHR-1 необходим для врожденного иммунного ответа Caenorhabditis elegans. Proc. Natl. Акад. Sci. США. 106, 2782-2787. Абстрактный Статья
Прадель, Э., Zhang, Y., Pujol, N., Matsuyama, T., Bargmann, C.I., and Ewbank, J.J. (2007). Обнаружение и предотвращение естественного продукт из патогенной бактерии Serratia marcescens, созданной Caenorhabditis elegans. Proc. Natl. Акад. Sci. США. 104, 2295–2300. Абстрактный Статья
Пужоль, Н., Цыповой, С., Зиглер, К., Милле, А., Астрейн, А., Гончаров, А., Джин, Ю., Чисхолм, А.Д., Эубанк, Дж. Дж. (2008a). Отчетливые врожденные иммунные реакции на инфекцию и ранение в эпидермисе C. elegans. Curr. Биол. 18, 481-489. Абстрактный Статья
Пуйоль, Н., Дэвис, П.А., Эубанк, Дж. Дж. (2012). Происхождение и функция противогрибковых пептидов C. elegans: открытые вопросы. Фронт. Иммунол. 3, 237. Абстрактный Статья
Пуйоль, Н., Линк, Э.М., Лю, Л.X., Курц, К.Л., Аллоинг, Г., Тан, М.В., Рэй, К.П., Солари, Р., Джонсон, К.Д., и Юбанк, Дж. Дж. (2001). Обратный генетический анализ компонентов пути передачи сигналов Toll у Caenorhabditis elegans. Curr. Биол. 11, 809-821. Абстрактный Статья
Пуйоль, Н., Зугасти, О., Вонг, Д., Куйо, К., Курц, К.Л., Шуленбург, Х., и Эубанк, Дж.Дж. (2008b). Противогрибковое врожденное иммунитет C. elegans усиливается за счет эволюционного разнообразия антимикробных пептидов. PLoS Pathog. 4, e1000105. Абстрактный Статья
Пуккила-Уорли, Р., Осубель, Ф.М., и Милонакис, Э. (2011). Инфекция Caenorhabditis elegans Candida albicans индуцирует противогрибковую иммунную защиту. PLoS Pathog. 7, e1002074. Абстрактный Статья
Пуккила-Уорли, Р., Фейнбаум, Р.Л., МакЭван, Д.Л., Конери, А.Л., Осубель, Ф.М. (2014). Эволюционно консервативный медиатор субъединица MDT-15 / MED15 связывает защитные врожденные иммунные реакции и детоксикацию ксенобиотиков. PLoS Pathog. 10, e1004143. Абстрактный Статья
Редди, К.С., Андерсен, Е.С., Кругляк, Л., Ким, Д.Х. (2009). Полиморфизм npr-1 является поведенческой детерминантой восприимчивости к патогенам C.elegans. Science 323, 382-384. Абстрактный Статья
Рен, М., Фэн, Х., Фу, Ю., Лэнд, М., и Рубин, К.С. (2009). Протеинкиназа D является важным регулятором врожденного иммунитета C. elegans. Иммунитет 30, 521-532. Абстрактный Статья
Рен, З., и Амброс, В.Р. (2015). МикроРНК Caenorhabditis elegans семейства let-7 действуют в цепях врожденного иммунного ответа и обеспечивают надежное время развития против патогенного стресса. Proc. Natl. Акад. Sci. США. 112, E2366-2375. Абстрактный Статья
Reynolds, R.M., and Phillips, P.C. (2013). Естественные вариации продолжительности жизни и реакции на стресс у нематоды Caenorhabditis remanei.PLoS One 8, e58212. Абстрактный Статья
Ричардсон, С.Э., Кинкель, С., Ким, Д.Х. (2011). Физиологическая передача сигналов IRE-1-XBP-1 и PEK-1 при развитии личинок Caenorhabditis elegans и иммунитете. PLoS Genet. 7, e1002391. Абстрактный Статья
Ричардсон, К.Э., Коистра Т., Ким Д. Х. (2010). Существенная роль XBP-1 в защите хозяина от иммунной активации у C. elegans. Nature 463, 1092-1095. Абстрактный Статья
Робертс А.Ф., Гумиенни Т.Л., Глисон Р.Дж., Ван Х. и Паджетт Р.В. (2010). Регулирование генов, влияющих на размер тела и врожденный иммунитет по пути, подобному DBL-1 / BMP, у Caenorhabditis elegans.BMC Dev. Биол. 10, 61. Абстрактный Статья
Редер Т., Станисак М., Гельхаус К., Брухаус И., Гротцингер Дж. И Лейппе М. (2010). Ценопоры обладают противомикробным действием пептиды нематоды Caenorhabditis elegans важны для питания и иммунитета. Dev. Комп. Иммунол. 34, 203-209. Абстрактный Статья
Рольфинг, А.К., Митева Ю., Ханненхалли С., Ламитина Т. (2010). Генетическая и физиологическая активация осмочувствительных Экспрессия гена имитирует транскрипционные сигнатуры патогенной инфекции у C. elegans. PLoS One 5, e9010. Абстрактный Статья
Россо, М.Н., Пуйоль, Н., Эубанк, Дж. Дж. (2013). Врожденный иммунитет у Caenorhabditis elegans и других нематод. В паразитарных нематодах: молекулярная биология, биохимия и иммунология, М.У. Кеннеди и У. Харнетт, ред. (Нью-Йорк: CABI Publishing), стр. 42-66.
Rouger, V., Bordet, G., Couillault, C., Monneret, S., Mailfert, S., Ewbank, J.J., Pujol, N., and Marguet, D. (2014). Независимый синхронизированный контроль и визуализация взаимодействий между живыми клетками и организмами. Биофиз. J. 106, 2096-2104. Абстрактный Статья
Сактон, Т.Б., Лаззаро Б.П., Шленке Т.А., Эванс Дж.Д., Халтмарк Д. и Кларк А.Г. (2007). Динамическая эволюция врожденная иммунная система у дрозофилы. Nat. Genet. 39, 1461–1468. Абстрактный Статья
Сагасти А., Хисамото Н., Хёдо Дж., Танака-Хино М., Мацумото К. и Баргманн К. (2001). CaMKII UNC-43 активирует MAPKKK NSY-1 для выполнения решения о латеральной передаче сигналов, необходимого для асимметричных судеб обонятельных нейронов.Cell 105, 221-232. Абстрактный Статья
Саху, С.Н., Льюис, Дж., Патель, И., Боздаг, С., Ли, Дж. Х., Леклерк, Дж. Э. и Чинар, Х. Н. (2012). Геномный анализ иммунной ответ против гемолизина Vibrio cholerae у Caenorhabditis elegans. PLoS One 7, e38200. Абстрактный Статья
Саркис П., Эш, А., Ле Пен, Дж., Маккай, М.А., и Миска, Е.А. (2013). Конкуренция между вирусным и эндогенным малым РНК регулируют экспрессию генов у Caenorhabditis elegans. Genome Res. 23, 1258–1270. Абстрактный Статья
Саркис П., Миска Э.А. (2013). Есть ли социальная РНК? Science 341, 467-468. Абстрактный Статья
Шуленбург, Х., и Boehnisch, C. (2008). Диверсификация и эволюция адаптивной последовательности лизоцимов Caenorhabditis (Nematoda: Rhabditidae). BMC Evol. Биол. 8, 114. Абстрактный Статья
Шуленбург, Х., Эубанк, Дж. Дж. (2004). Разнообразие и специфичность взаимодействия Caenorhabditis elegans и патогена Serratia marcescens. BMC Evol. Биол. 4, 49. Абстрактный Статья
Шуленбург, Х., и Ewbank, J.J. (2007). Генетика избегания патогенов у Caenorhabditis elegans. Мол. Microbiol. 66, 563-570. Абстрактный Статья
Шуленбург, Х., Хёппнер, М.П., Вайнер, Дж., 3-й, и Борнберг-Бауэр, Э. (2008). Специфика врожденного иммунитета и разнообразие белков лектинового домена С-типа (CTLD) у нематоды Caenorhabditis elegans.Иммунобиология 213, 237-250. Абстрактный Статья
Сем, X., Крейсберг, Дж. Ф., Кавли, Т., Тан, М. В., Рен, М., и Тан, П. (2012). Модуляция чувствительности к инфекции Caenorhabditis elegans белком соединения клеток LIN-7. Клетка. Microbiol. 14, 1584-1599. Абстрактный Статья
Сео, К., Чой, Э., Ли, Д., Чон, Д.Э., Чан, С.К., и Ли, С.Дж. (2013). Фактор теплового шока 1 обеспечивает долголетие. путем ингибирования сигнальных путей TOR и инсулина / IGF-1 у C. elegans. Ячейка старения 12, 1073-1081. Абстрактный Статья
Сеонг, С.Ю., и Матцингер, П. (2004). Гидрофобность: древний молекулярный паттерн, связанный с повреждениями, который инициирует врожденный иммунные ответы.Nat. Rev. Immunol. 4, 469-478. Абстрактный Статья
Шапира М., Хамлин Б.Дж., Ронг Дж., Чен К., Ронен М. и Тан М.В. (2006). Консервативная роль фактора транскрипции GATA в регуляции эпителиальных врожденных иммунных ответов. Proc. Natl. Акад. Sci. США. 103, 14086-14091. Абстрактный Статья
Шиверс, Р.П., Пагано, Д.Дж., Коистра, Т., Ричардсон, К.Э., Редди, К.С., Уитни, Дж. К., Каманзи, О., Мацумото, К., Хисамото, Н., Ким Д.Х. (2010). Фосфорилирование консервативного фактора транскрипции ATF-7 с помощью PMK-1 p38 MAPK регулирует врожденный иммунитет у Caenorhabditis elegans. PLoS Genet. 6, e1000892. Абстрактный Статья
Сифри, С.Д., Бегун, Дж., И Осубель, Ф.М. (2005). Червь превратился — микробная вирулентность смоделирована на Caenorhabditis elegans. Trends Microbiol. 13, 119–127. Абстрактный Статья
Sifri, C.D., Begun, J., Ausubel, F.M., and Calderwood, S.B. (2003). Caenorhabditis elegans как модельный хозяин патогенеза золотистого стафилококка. Заразить. Иммун. 71, 2208-2217. Абстрактный Статья
Симонсен, К.Т., Галлего, С.Ф., Фаэргеман, Нью-Джерси, и Каллиполитис, Б. (2012). Сила в цифрах: «Омикс» исследования врожденного иммунитета C. elegans. Вирулентность 3, 477-484. Абстрактный Статья
Simonsen, K.T., Moller-Jensen, J., Kristensen, A.R., Andersen, J.S., Riddle, D.L., и Kallipolitis, B.H. (2011). Количественный протеомика идентифицирует ферритин во врожденном иммунном ответе C.elegans. Вирулентность 2, 120-130. Абстрактный Статья
Сингх В. и Абаллай А. (2006). Фактор транскрипции теплового шока (HSF) -1 путь, необходимый для иммунитета к Caenorhabditis elegans. Proc. Natl. Акад. Sci. США. 103, 13092-13097. Абстрактный Статья
Сингх В., и Абаллай, А. (2009). Регуляция DAF-16-опосредованного врожденного иммунитета у Caenorhabditis elegans. J. Biol. Chem. 284, 35580-35587. Абстрактный Статья
Sinha, A., Rae, R., Iatsenko, I., and Sommer, R.J. (2012). Общесистемный анализ эволюции врожденного иммунитета у модельные виды нематод Caenorhabditis elegans и Pristionchus pacificus. PLoS One 7, e44255.Абстрактный Статья
Соломон, А., Бандхакави, С., Джаббар, С., Шах, Р., Бейтель, Дж. Дж., И Моримото, Р. И. (2004). Caenorhabditis elegans OSR-1 регулирует поведенческие и физиологические реакции на гиперосмотическую среду. Генетика 167, 161-170. Абстрактный Статья
Зоммер Р.Дж., И МакГогран А. (2013). Нематода Pristionchus pacificus как модельная система для интегративных исследований в эволюционной биологии. Мол. Ecol. 22, 2380-2393. Абстрактный Статья
Стайер, К.Л., Сингх, В., Макоско, Э., Стил, С.Е., Баргманн, К.И., и Абаллай, А. (2008). Врожденный иммунитет у Caenorhabditis elegans регулируется нейронами, экспрессирующими NPR-1 / GPCR. Science 322, 460-464.Абстрактный Статья
Салливан, Дж. К., Воленски, Ф. С., Рейцель, А. М., Френч, К. Э., Трейлор-Ноулз, Н., Гилмор, Т. Д., и Финнерти, Дж. Р. (2009). Два аллеля NF-κB у морского анемона Nematostella vectensis широко распространены в природе и кодируют белки с различными активностями. PLoS One 4, e7311. Абстрактный Статья
Сан, Дж., Сингх В., Кадзино-Сакамото Р. и Абаллай А. (2011). Нейрональная GPCR контролирует врожденный иммунитет, регулируя неканонические развернутые гены белкового ответа. Science 332, 729-732. Абстрактный Статья
Тан, М.В. (2002). Идентификация факторов хозяина и патогенов, участвующих в вирулентности, с использованием Caenorhabditis elegans. Методы Энзимол. 358, 13-28. Абстрактный Статья
Тао, Л., Xie, Q., Ding, Y.H., Li, S.T., Peng, S., Zhang, Y.P., Tan, D., Yuan, Z., и Dong, M.Q. (2013). CAMKII и кальциневрин регулируют продолжительность жизни Caenorhabditis elegans через фактор транскрипции FOXO DAF-16. eLife 2, e00518. Абстрактный Статья
Такур, Н., Пуйоль, Н., Тичит, Л., и Юбанк, Дж. Дж. (2014). Clone Mapper: онлайн-набор инструментов для экспериментов с РНКи в Caenorhabditis elegans.G3 4, 2137-2145. Абстрактный Статья
Thomas, J.H. (2006a). Адаптивная эволюция двух больших семейств адаптеров убиквитин-лигазы у нематод и растений. Геном Res. 16, 1017-1030. Абстрактный Статья
Thomas, J.H. (2006b). Согласованная эволюция двух новых семейств белков у видов Caenorhabditis.Genetics 172, 2269-2281. Абстрактный Статья
Тиллер Г.Р., Гарсин Д.А. (2014). Пероксидаза SKPO-1 действует в подкожной клетчатке, защищая Caenorhabditis elegans от бактериальной инфекции. Genetics 197, 515-526. Абстрактный Статья
Тонг, А., Линн, Г., Нго, В., Вонг, Д., Мозли, С.Л., Эубанк, Дж.Дж., Гончаров, А., Ву, Ю.С., Пуджол, Н., Чизхолм, А.Д. (2009). Отрицательная регуляция реакций на повреждение эпидермиса Caenorhabditis elegans ассоциированной со смертью протеинкиназой. Proc. Natl. Акад. Sci. США. 106, 1457–1461. Абстрактный Статья
Tonsaker, T., Pratt, R.M., and McGhee, J.D. (2012). Переоценка роли ELT-3 в цепи фактора транскрипции GATA, предложенная для управления старением C.elegans. Мех. Aging Dev. 133, 50-53. Абстрактный Статья
Treitz, C., Cassidy, L., Hockendorf, A., Leippe, M., and Tholey, A. (2015). Количественный протеомный анализ Caenorhabditis elegans при воздействии нематицидных бактерий Bacillus thuringiensis. J. Proteomics 113, 337-350. Абстрактный Статья
Тремель, Э.Р., Чу, С.В., Рейнке, В., Ли, С.С., Осубель, Ф.М., и Ким, Д.Х. (2006). p38 MAPK регулирует экспрессию иммунного ответные гены и способствует долголетию C. elegans. PLoS Genet. 2, е183. Абстрактный Статья
Troemel, E.R., Félix, M.A., Whiteman, N.K., Barrière, A., and Ausubel, F.M. (2008). Микроспоридии являются естественными внутриклеточными паразиты нематоды Caenorhabditis elegans.PLoS Biol. 6, 2736-2752. Абстрактный Статья
Troemel, E.R., Sagasti, A., and Bargmann, C.I. (1999). Боковая передача сигналов, опосредованная контактом с аксоном и входом кальция, регулирует асимметричная экспрессия пахучих рецепторов у C. elegans. Cell 99, 387-398. Абстрактный Статья
Тюльле, Дж.М., Арайз, К., Сандерс, М.Дж., Ау, К., Бенедетто, А., Папатеодору, И., Кларк, Э., Шмайссер, К., Джонс, Д., Шустер, E.F. и др. (2014). DAF-16 / FoxO напрямую регулирует атипичную AMP-активированную гамма-изоформу протеинкиназы, опосредуя эффекты передачи сигналов инсулина / IGF-1 о старении у Caenorhabditis elegans. PLoS Genet. 10, e1004109. Абстрактный Статья
Тюльле, Дж.M., Hertweck, M., An, J.H., Baker, J., Hwang, J.Y., Liu, S., Oliveira, R.P., Baumeister, R., and Blackwell, T.K. (2008). Прямое ингибирование фактора увеличения продолжительности жизни SKN-1 с помощью инсулиноподобной передачи сигналов у C. elegans. Cell 132, 1025-1038. Абстрактный Статья
Урано, Ф., Калфон, М., Йонеда, Т., Юн, К., Кирали, М., Кларк, С.Г., и Рон, Д. (2002). Путь выживания Caenorhabditis elegans с заблокированным ответом на развернутый белок.J. Cell Biol. 158, 639-646. Абстрактный Статья
Вайшнава, С., Ямамото, М., Северсон, К.М., Рун, К.А., Ю, X., Корен, О., Лей, Р., Уэйкленд, Э.К., и Хупер, Л.В. (2011). Антибактериальный лектин RegIIIγ способствует пространственному разделению микробиоты и хозяина в кишечнике. Наука 334, 255-258 Абстрактный Статья
ван ден Берг, Л.M., Gringhuis, S.I., и Geijtenbeek, T.B. (2012). Эволюционный взгляд на лектины С-типа при инфекции и иммунитет. Аня. Акад. Sci. 1253, 149–158. Абстрактный Статья
van der Hoeven, R., Cruz, M.R., Chavez, V., and Garsin, D.A. (2015). Локализация двойной оксидазы BLI-3 и характеристика ее NADPH-оксидазного домена во время инфекции Caenorhabditis elegans.PLoS One 10, e0124091. Абстрактный Статья
Висвикис, О., Ихуэгбу, Н., Лабед, С.А., Лугачак, Л.Г., Алвес, А.М., Волленберг, А.К., Стюарт, Л.М., Стормо, Г.Д., и Иразоки, J.E. (2014). Врожденная защита хозяина требует TFEB-опосредованной транскрипции цитопротекторных и антимикробных генов. Иммунитет 40, 896-909. Абстрактный Статья
Вишванатан, М., Ким, С.К., Бердичевский, А., Гуаренте, Л. (2005). Роль регуляции SIR-2.1 генов ответа на стресс ER в определении продолжительности жизни C. elegans. Dev. Cell 9, 605-615. Абстрактный Статья
Фолькерс, Р.Дж., Снук, Л. и Камменга, Дж. Э. (2013). Сигнатуры ген-среда и деградация белка характеризуют геномное и фенотипическое разнообразие в диких популяциях Caenorhabditis elegans.BMC Biol. 11, 93. Абстрактный Статья
von Reuss, S.H., Bose, N., Srinivasan, J., Yim, J.J., Judkins, J.C., Sternberg, P.W., and Schroeder, F.C. (2012). Сравнительный метаболомика показывает биогенез аскарозидов, модульной библиотеки низкомолекулярных сигналов C. elegans. Варенье. Chem. Soc. 134, 1817-1824 гг. Абстрактный Статья
Ван, Дж., Робида-Стаббс, С., Туллет, Дж. М., Руал, Дж. Ф., Видаль, М., и Блэквелл, Т. (2010). Скрининг РНКи подразумевает SKN-1-зависимый транскрипционный ответ устойчивости к стрессу и долголетия, обусловленный ингибированием трансляции. PLoS Genet. 6, e1001048. Абстрактный Статья
Вейберг, А., Ван, М., Лин, Ф.М., Чжао, Х., Чжан, З., Калошян, И., Хуанг, Х.Д., и Цзинь, Х. (2013). Малые РНК грибов подавляют иммунитет растений путем захват путей интерференции РНК хозяина. Science 342, 118-123. Абстрактный Статья
Уиллер, Дж. М., и Томас, Дж. Х. (2006). Идентификация нового семейства генов, участвующих в реакции на осмотический стресс у Caenorhabditis elegans. Genetics 174, 1327-1336. Абстрактный Статья
Виттинг, М., Лусио, М., Циотис, Д., Вагеле, Б., Сухре, К., Воулху, Р., Гарвис, С., и Шмитт-Копплин, П. (2015). На основе DI-ICR-FT-MS высокопроизводительное глубокое метаботипирование: тематическое исследование модели инфекции Caenorhabditis elegans-Pseudomonas aeruginosa. Анальный. Биоанал. Chem. 407, 1059-1073. Абстрактный Статья
Вольф, С., Ма, Х., Берч, Д., Масиэль, Г.А., Хантер, Т., и Диллин, А. (2006). SMK-1, важный регулятор продолжительности жизни, опосредованной DAF-16. Cell 124, 1039-1053. Абстрактный Статья
Wong, D., Bazopoulou, D., Pujol, N., Tavernarakis, N., and Ewbank, J.J. (2007). Полногеномное исследование выявляет патоген-специфические и общие подписи в ответе Caenorhabditis elegans на инфекцию. Genome Biol. 8, R194.Абстрактный Статья
Xie, Y., Moussaif, M., Choi, S., Xu, L., and Sze, J.Y. (2013). Фактор транскрипции RFX DAF-19 регулирует 5-HT и врожденный иммунный ответ на патогенные бактерии у Caenorhabditis elegans. PLoS Genet. 9, e1003324. Абстрактный Статья
Сюй, С., и Чисхолм, А.Д. (2011). Сигнальный путь Gα q -Ca 2+ способствует опосредованному актину закрытию эпидермальных ран у C. elegans. Curr. Биол. 21, 1960-1967. Абстрактный Статья
Ямада К., Хироцу Т., Мацуки М., Мясник Р.А., Томиока М., Исихара Т., Кларди Дж., Кунитомо Х. и Иино Ю. (2010). Обонятельная пластичность регулируется феромонными сигналами у Caenorhabditis elegans.Science, 329, 1647-1650. Абстрактный Статья
Янг В., Диркинг К., Эссер Д., Толей А., Лейппе М., Розенштиль П. и Шуленбург Х. (2015). Перекрывающиеся и уникальные сигнатуры протеомных и транскриптомных ответов нематоды Caenorhabditis elegans на патогенный Bacillus thuringiensis. Dev. Комп. Иммунол. 51, 1-9. Абстрактный Статья
Юк, К.и Ходжкин Дж. (2007). Мутагенез Mos1 выявляет разнообразие механизмов, влияющих на ответ Caenorhabditis elegans на бактериальный патоген Microbacterium nematophilum. Генетика 175, 681-697. Абстрактный Статья
Yu, H., Lai, H.-J., Lin, T.-W., Chen, C.-S., и Lo, S.J. (2015). Потеря функции ДНКазы II в гонаде связана с более высокой экспрессией антимикробные гены C.elegans. Биохим. J. 470, 145-154. Абстрактный Статья
Zhang, L., Li, L., Guo, X., Litman, G.W., Dishaw, L.J., and Zhang, G. (2015a). Массовое расширение и функциональное расхождение генов врожденного иммунитета в протостоме. Sci. Реп. 5, 8693. Абстрактный Статья
Чжан, П., Джуди, М., Ли, С.Дж., Кеньон, К. (2013). Прямая и непрямая регуляция генов продлевающим жизнь белком FOXO у C. elegans: роль факторов GATA и регуляторов липидных генов. Cell Metab. 17, 85-100. Абстрактный Статья
Чжан, X., и Чжан, Ю. (2012). DBL-1, TGF-β, важен для аверсивного обонятельного обучения Caenorhabditis elegans. Proc. Natl.Акад. Sci. США. 109, 17081–17086. Абстрактный Статья
Zhang, Y., Li, W., Li, L., Li, Y., Fu, R., Zhu, Y., Li, J., Zhou, Y., Xiong, S., и Zhang, H . (2015b). Структурное повреждение в эпидермисе C. elegans вызывает высвобождение STA-2 и индукцию врожденного иммунного ответа. Иммунитет 42, 309-320. Абстрактный Статья
Чжан, Ю., Лу, Х., и Баргманн, К. (2005). Патогенные бактерии вызывают аверсивное обонятельное обучение у Caenorhabditis elegans. Nature 438, 179–184. Абстрактный Статья
Циглер К., Курц К.Л., Циповой С., Куийо К., Пофиллат М., Пужоль Н. и Эубанк Дж. Дж. (2009). Противогрибковое врожденное иммунитет у C. elegans: PKC связывает передачу сигналов G-белка и консервативный каскад p38 MAPK.Клеточный микроб-хозяин 5, 341-352. Абстрактный Статья
Зугасти, О., Бозе, Н., Сквибан, Б., Белун, Дж., Курц, К. Л., Шредер, Ф. К., Пуйоль, Н., и Юбанк, Дж. Дж. (2014). Активация рецептора, сопряженного с G-белком, с помощью его эндогенного лиганда запускает врожденный иммунный ответ Caenorhabditis elegans. Nat. Иммунол. 15, 833-838. Абстрактный Статья
Зугасти, О., и Ewbank, J.J. (2009). Нейроиммунная регуляция экспрессии антимикробного пептида с помощью неканонической передачи сигналов TGF-β путь в эпидермисе Caenorhabditis elegans. Nat. Иммунол. 10, 249-256. Абстрактный Статья
КГБ, перестройка и распад Советского Союза на JSTOR
AbstractВ этой статье исследуется роль Комитета государственной безопасности (КГБ) в бурные шесть с половиной лет правления Михаила Горбачева, с марта 1985 года по декабрь 1991 года.Вопреки распространенному мнению, КГБ никогда не был независимым субъектом советской системы; он действовал по указанию Коммунистической партии. Когда Владимир Крючков сменил Виктора Чебрикова на посту главы КГБ в 1986 году, этот шаг стал сигналом о новой роли КГБ. Но по мере того, как реформы, начатые Горбачевым, становились все более радикальными, а политическая нестабильность в Советском Союзе стала широко распространяться, многие в КГБ стали беспокоиться о возможной фрагментации страны. Эти опасения сыграли важную роль в решении Крючкова и других высокопоставленных чиновников КГБ организовать жесткий переворот в августе 1991 года.Однако даже тогда КГБ не был полностью независимым от партии. Напротив, сотрудники КГБ ожидали — а затем отчаянно надеялись, — что Горбачев согласится отдать приказ о полномасштабных репрессиях. Поскольку Горбачев не хотел принимать непосредственного участия в массовых репрессиях, Крючкову не хватало полномочий, которые он стремился действовать. В результате попытка государственного переворота провалилась, и КГБ был вынужден перейти к обороне. Незадолго до распада Советского государства КГБ был разделен на ряд ведомств, которые вскоре перешли под прямой контроль России.
Информация журналаВ «Journal of Cold War Studies» публикуются рецензируемые статьи, основанные на архивных исследованиях бывшего коммунистического мира, западных стран и других частей земного шара. Статьи в журнале основаны на рассекреченных материалах и новых мемуарах, освещающих и поднимающих вопросы по многочисленным историческим и теоретическим проблемам: теории принятия решений, сдерживания, бюрократической политики, институционального формирования, переговоров, дипломатии, внешнеполитического поведения и международных отношений.Используя последние данные, авторы подвергают эти и другие теории тщательному эмпирическому анализу. Журнал также включает обширный раздел обзоров новых книг, касающихся холодной войны и международной политики. Журнал издается MIT Press для Гарвардского проекта исследований холодной войны.
Информация об издателеОдна из крупнейших университетских издательств в мире, MIT Press ежегодно издает более 200 новых книг, а также 30 журналов по искусству и гуманитарным наукам, экономике, международным отношениям, истории, политологии, науке и технологиям, а также другим дисциплинам.Мы были одними из первых университетских издательств, которые предлагали названия в электронном виде, и мы продолжаем внедрять технологии, которые позволяют нам лучше поддерживать научную миссию и широко распространять наш контент. Энтузиазм прессы к инновациям находит отражение в том, что мы постоянно исследуем этот рубеж. С конца 1960-х годов мы экспериментировали с поколениями электронных издательских инструментов. Благодаря нашей приверженности новым продуктам — будь то электронные журналы или совершенно новые формы коммуникации — мы продолжаем искать наиболее эффективные и действенные средства обслуживания наших читателей.Наши читатели ожидают от наших продуктов превосходного качества, и они могут рассчитывать на то, что мы сохраним приверженность созданию строгих и новаторских информационных продуктов в любых формах, которые может принести будущее издательского дела.
Права и использование Этот предмет является частью коллекции JSTOR.
Условия использования см. В наших Положениях и условиях
© 2003 Президент и научные сотрудники Гарвардского колледжа и Массачусетского технологического института
Запросить разрешения